IL-38表达与免疫浸润分析
确定IL-38在肿瘤中的表达频率及其与免疫细胞浸润的相关性。
利用TCGA和Tempus数据库分析IL-38 mRNA表达,并通过免疫组化检测头颈鳞癌、肺癌、宫颈鳞癌组织芯片中IL-38蛋白表达;使用ImSig和NEXT方法估计免疫细胞浸润。
IL-38 blockade induces anti-tumor immunity by abrogating tumor-mediated suppression of early immune activation.
包含患者样本表达分析、TCGA和Tempus数据队列、抗体体外功能验证、两种同基因小鼠模型体内疗效及免疫记忆检测。
EMT6同基因乳腺癌小鼠模型 B16.F10黑色素瘤同基因小鼠模型 头颈鳞癌、肺癌和宫颈鳞癌患者肿瘤组织
IMM20324抗体对人和小鼠IL-38的结合亲和力KD值(人4.87 nM,小鼠9.86 nM) IMM20324抑制IL-38与IL-36R和IL1RAPL1结合的IC50值(1.267 nM和1.4667 nM) EMT6模型中IMM20324给药剂量(10, 15, 25 mg/kg)和治疗方案(每周两次,共6次) B16.F10模型中IMM20324给药剂量(10, 50 mg/kg)和治疗方案(每3天一次,共6次) B16.F10模型中肿瘤体积与IMM20324暴露的负相关及瘤内趋化因子水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定IL-38在肿瘤中的表达频率及其与免疫细胞浸润的相关性。
利用TCGA和Tempus数据库分析IL-38 mRNA表达,并通过免疫组化检测头颈鳞癌、肺癌、宫颈鳞癌组织芯片中IL-38蛋白表达;使用ImSig和NEXT方法估计免疫细胞浸润。
生成并验证特异性结合人和小鼠IL-38并能阻断其与受体结合的抗体。
用重组人IL-38免疫CD-1小鼠,生成杂交瘤克隆IMM20331,重组表达为IMM20324;通过蛋白芯片、生物层干涉、ELISA、流式细胞术检测结合,并通过受体结合抑制实验评估阻断能力。
评估IMM20324在非荷瘤小鼠中的药代动力学特征和耐受性。
给予C57BL/6小鼠单次或多次IMM20324H,检测血浆浓度、体重、脾脏重量和细胞因子水平。
评估IMM20324在EMT6乳腺癌模型中的抗肿瘤效果及是否诱导免疫记忆。
BALB/c小鼠皮下植入EMT6细胞,待肿瘤平均体积达110-115 mm3后随机分组,给予不同剂量IMM20324H或PBS;记录肿瘤体积和生存期;对完全消退的小鼠进行对侧再挑战。
评估IMM20324在免疫冷肿瘤模型B16.F10中的抗肿瘤效果。
C57BL/6小鼠皮下植入B16.F10细胞,待肿瘤体积达60-65 mm3后随机分组,给予IMM20324或同型对照;测量肿瘤体积并分析生长速率。
评估IMM20324暴露与肿瘤体积及瘤内趋化因子水平的关系。
在B16.F10模型中给予不同剂量IMM20324,检测血浆暴露水平,并分析肿瘤匀浆中32种细胞因子/趋化因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质芯片 | HuProt阵列V4 | CDI Laboratories, Inc. | -- |
| Western blot检测 | AlexaFluor-647偶联抗H+L二抗 | Jackson ImmunoResearch | 709-606-149 |
| 亲和力检测 | GatorPlus仪器 | GatorBio | -- |
| ELISA | 重组小鼠IL-38 | Adipogen | AG-40A-0191-C050 |
| 高结合力板 | Corning | 9018 | |
| ELISA检测 | HRP偶联兔抗小鼠二抗 | Jackson ImmunoResearch | 309-035-082 |
| ELISA底物 | OPD底物 | Sigma | P8287 |
| ELISA终止液 | 终止液(2N硫酸) | R&D Systems | DY994 |
| ELISA读取 | EnSpire酶标仪 | PerkinElmer | model |
| 细胞培养 | CellStripper | Corning | 25-056-CI |
| 流式细胞术 | 可固定活/死染料 | Life Technologies | L34965 |
| AF647山羊抗小鼠IgG2a二抗 | Jackson ImmunoResearch | 115-607-186 | |
| Attune NxT流式细胞仪 | Life Technologies | -- | |
| 受体结合抑制实验 | 人IL1RAPL1-Fc | Sino Biological | 10177-H02H |
| 人IL-36R-Fc | R&D Systems | 872-RP | |
| MSD高结合力板 | MSD | -- | |
| 生物素化小鼠抗人IL-38(克隆H127C) | Thermo Fisher Scientific | 14-7385-82 | |
| Sulfo-Tag-链霉亲和素 | MesoScale Discovery | L15×B | |
| Meso Sector S 600读板仪 | -- | -- | |
| 免疫组化 | 兔多克隆抗体 | LS Bio | LS-C201139 |
| 免疫组化成像 | NanoZoomer-HT 2.0图像系统 | -- | -- |
| 血液采集 | K2-EDTA管 | Becton Dickinson | 366643 |
| PK检测 | 重组人IL-38 | NovoPro | 519753 |
| 抗小鼠IgG-HRP | Southern Biotech | 6170-05 | |
| 肿瘤匀浆制备 | Bead Ruptor预填充研磨管 | Omni International | 19-628 |
| Bead Ruptor Elite匀浆器 | Omni International | 19-042E | |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Scientific | 23225 |
| 细胞因子检测 | Luminex 200系统 | Luminex | -- |
| 小鼠细胞因子32-Plex Discovery检测 | MilliporeSigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| IL-38表达分析 | TCGA数据中IL-38表达的阈值设定(90%正常样本)及阳性样本定义;Tempus数据中纳入的癌症类型和样本量;免疫组化评分标准。 阅读提示:见Materials and methods: Analysis of IL-38 expression and immune cell infiltration in TCGA cohort; Tempus database; Immunohistochemical analysis |
| 抗体结合与中和实验 | IMM20324的浓度;IL-38蛋白的浓度范围;受体结合抑制实验中IL-38与抗体的预孵育时间和浓度。 阅读提示:见Materials and methods: Affinity of anti-IL-38 antibodies; Neutralization of human IL-38 binding |
| EMT6同基因模型 | 细胞接种数量(5×10^5);起始治疗时的肿瘤体积(110-115 mm3);给药剂量(10,15,25 mg/kg)和方案(每周两次,共6次);再挑战时细胞数量(5×10^5)和部位(对侧)。 阅读提示:见Materials and methods: EMT6 syngeneic tumor model; Figure 5 legend |
| B16.F10同基因模型 | 细胞接种数量(2.5×10^5);起始治疗时的肿瘤体积(60-65 mm3);给药剂量(10,50 mg/kg)和方案(每3天一次,共6次);肿瘤体积计算公式((最长径)×(最短径)^2/2)。 阅读提示:见Materials and methods: B16.F10 syngeneic tumor model; Figure 6 legend |
| 药代动力学与暴露分析 | 单次给药剂量(10 mg/kg IV或IP);多次给药方案(QW/Q2W,21天);重复给药剂量(3,10,30 mg/kg)和方案(每3天一次,共4次);分析时间点。 阅读提示:见Materials and methods: Pharmacokinetic and tolerability analysis; Supplementary Tables S1, S2 |