验证COL11A1对迁移和侵袭的影响
确定COL11A1是否调节胰腺癌细胞的迁移和侵袭。
在胰腺癌细胞系中转染pCMV3-COL11A1或siCOL11A1,通过Transwell实验检测迁移和侵袭。
COL11A1-Driven Epithelial-Mesenchymal Transition and Stemness of Pancreatic Cancer Cells Induce Cell Migration and Invasion by Modulating the AKT/GSK-3β/Snail Pathway.
包含体外细胞模型,通过过表达和敲低进行功能验证,并利用通路抑制剂和siRNA进行机制验证。
PANC-1细胞系 BxPC-3细胞系 Capan-2细胞系
细胞系:PANC-1、BxPC-3、Capan-2 COL11A1过表达质粒(pCMV3-COL11A1)和siRNA(siCOL11A1)转染 通路抑制剂:LY294002(50μM,预处理1小时) siRNA敲低GSK-3β和Snail Transwell检测时间:24或48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定COL11A1是否调节胰腺癌细胞的迁移和侵袭。
在胰腺癌细胞系中转染pCMV3-COL11A1或siCOL11A1,通过Transwell实验检测迁移和侵袭。
探究COL11A1是否调节上皮间质转化相关标志物和基质金属蛋白酶。
通过Western blotting和免疫荧光检测N-cadherin、E-cadherin、Vimentin和MMP-2/9的表达。
确定COL11A1是否通过AKT/GSK-3β/Snail通路发挥作用。
通过Western blotting检测AKT、GSK-3β的磷酸化水平及Snail表达,使用PI3K抑制剂LY294002和siRNA敲低GSK-3β进行验证。
验证COL11A1诱导的EMT依赖于AKT/GSK-3β/Snail通路。
通过Western blotting、ChIP和免疫荧光检测E-cadherin表达及Snail与E-cadherin启动子的结合,并评估细胞粘附能力。
确定COL11A1是否调节胰腺癌细胞的干性。
通过Western blotting、流式细胞术和克隆形成实验检测CD24/CD44表达及集落形成能力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | BI | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | 脂质体2000 | Invitrogen | -- |
| 细胞处理 | LY294002 | Beyotime | -- |
| 迁移和侵袭 | Transwell小室 | BD Biosciences | -- |
| 基质胶 | -- | -- | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| 核蛋白提取试剂盒 | Keygen Biotech | -- | |
| BCA试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| Chemidoc™ Touch成像系统 | -- | -- | |
| E-cad抗体 | Cell Signaling Technology | 14472S | |
| N-cad抗体 | Cell Signaling Technology | 13116S | |
| VIM抗体 | Cell Signaling Technology | 5741S | |
| Snail抗体 | Cell Signaling Technology | 3879S | |
| AKT抗体 | Proteintech | 60203-2-Ig | |
| p-AKTSer473抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S | |
| MMP-2抗体 | Cell Signaling Technology | 40994S | |
| MMP-9抗体 | Cell Signaling Technology | 13667S | |
| GSK-3β抗体 | Cell Signaling Technology | 12456S | |
| p-GSK-3βSer9抗体 | Cell Signaling Technology | 5558S | |
| CD24抗体 | Proteintech | 18330-1-AP | |
| CD44抗体 | Proteintech | 60224-1-Ig | |
| β-actin抗体 | Sungene Biotech | KM9001 | |
| 染色质免疫沉淀 | 抗Snail抗体 | -- | -- |
| 免疫荧光 | FITC标记的二抗 | -- | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| 实时荧光定量PCR | 总RNA提取试剂盒 | Promega | -- |
| HiFiScript第一链cDNA合成试剂盒 | CWBIO | -- | |
| ChamQ™通用SYBR qPCR预混液 | CWBIO | -- | |
| Applied Biosystems 7500 Fast Dx实时荧光定量PCR仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式细胞术 | 抗CD24-PE | Abcam | -- |
| 抗CD44-FITC | Abcam | -- | |
| FACS Calibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| BD FACSAria II细胞分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| 克隆形成实验 | 吉姆萨染液 | Solarbio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(ATCC),培养基(RPMI-1640或DMEM),血清浓度(10%FBS),抗生素浓度(1%青霉素-链霉素),培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:2.1 Cell Culture, Transfection, and Treatment |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 2000),质粒和siRNA的浓度(文中未明确说明),转染时间(文中未明确说明) 阅读提示:2.1 Cell Culture, Transfection, and Treatment |
| 迁移和侵袭 | Transwell小室孔径(8 μm),基质胶包被与否,细胞数量(文中未明确说明),培养时间(24或48小时),固定和染色方法 阅读提示:2.2 Transwell Assay |
| 蛋白质印迹 | 蛋白上样量(30 μg),SDS-PAGE浓度(10%),PVDF膜孔径(0.2 μm),封闭液(5%脱脂牛奶),一抗浓度(见表2),二抗浓度(1:10000) 阅读提示:2.3 Western Blotting, Table 2 |
| 伤口愈合 | 细胞数量(文中未明确说明),划痕工具(10 μL枪头),观察时间(0、24、48小时) 阅读提示:2.6 Wound-Healing Assays |