验证LMP1通过NF-κB上调CYPA表达
探究EBV-LMP1对CYPA表达的调控及其是否依赖NF-κB通路。
在EBV阳性293细胞和293-LMP1细胞中检测CYPA蛋白表达;过表达p65或使用NF-κB抑制剂处理,检测CYPA的蛋白和mRNA水平变化。
Cyclophilin A binds to AKT1 and facilitates the tumorigenicity of Epstein-Barr virus by mediating the activation of AKT/mTOR/NF-κB positive feedback loop.
含有体外细胞实验、动物实验(裸鼠移植瘤)、分子互作验证(co-IP、IF)及机制验证(siRNA、过表达、抑制剂)。
EBV阳性鼻咽癌细胞系C666-1 EBV阴性鼻咽癌细胞系HONE1、CNE1、HK1 293及293-LMP1细胞 裸鼠异种移植瘤模型
LMP1调控CYPA表达是否依赖NF-κB CYPA敲低/敲除对细胞增殖和凋亡的影响 CYPA与AKT1的结合及其受LMP1的影响 CYPA对AKT/mTOR/NF-κB信号通路激活的必需性 雷帕霉素抑制正反馈环的效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究EBV-LMP1对CYPA表达的调控及其是否依赖NF-κB通路。
在EBV阳性293细胞和293-LMP1细胞中检测CYPA蛋白表达;过表达p65或使用NF-κB抑制剂处理,检测CYPA的蛋白和mRNA水平变化。
探究CYPA对肿瘤细胞增殖和凋亡的调控作用。
通过siRNA敲低CYPA、CRISPR/Cas9敲除CYPA、过表达CYPA恢复,用CCK-8检测细胞活力,用流式细胞术和TUNEL检测凋亡。
证实CYPA与AKT1结合,并考察LMP1对结合的影响。
使用STRING预测相互作用,在HK-1和293细胞中进行内源和外源Co-IP实验,用免疫荧光观察共定位。
探究CYPA是否影响AKT/mTOR/NF-κB通路的激活。
在NPC细胞中siRNA敲低CYPA,在293 KOCYPA细胞中敲除或恢复CYPA,用Western blot检测p-AKT1、p-mTOR、p-p70S6K、p-NF-κB等蛋白表达。
验证mTOR抑制剂雷帕霉素能否逆转NF-κB/CYPA/AKT/mTOR/NF-κB正反馈环的激活。
用雷帕霉素处理EBV阳性C666-1和C2089细胞,检测关键蛋白表达变化。
验证CYPA敲除在体内对肿瘤形成的影响。
将293 KOCYPA和对照293细胞皮下注射裸鼠,45天后处死,测量肿瘤体积和重量,并通过IHC和TUNEL检测增殖和凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific | -- |
| TurboFect转染试剂 | Thermo Scientific | R0534 | |
| 蛋白质检测 | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 磷酸酶抑制剂 | MCE | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Millipore | WBKLS0100 | |
| Bio-Rad Gel Doc XR+系统 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白质检测-抗体 | LMP1小鼠单克隆抗体 | DAKO Lifetech | M0897 |
| p-NF-κB (p65)兔单克隆抗体 | CST | 3033 | |
| NF-κB兔单克隆抗体 | Millipore | 06-418 | |
| CYPA兔单克隆抗体 | Proteintech | -- | |
| AKT1兔单克隆抗体 | CST | 2938S | |
| AKT1小鼠单克隆抗体 | Beyotime | AF0045 | |
| p-AKT1 (Ser473)兔单克隆抗体 | CST | 9018S | |
| p-mTOR (Ser2448)兔单克隆抗体 | ABclone | AP0115 | |
| mTOR兔单克隆抗体 | SAB | 41187 | |
| p-p70S6K (Thr389)小鼠单克隆抗体 | CST | 9206S | |
| p70S6K兔单克隆抗体 | CST | 2708S | |
| GAPDH兔多克隆抗体 | Proteintech | 10494-I-AP | |
| HRP山羊抗小鼠IgG | ABclone | AS003 | |
| HRP山羊抗兔IgG | ABclone | AS014 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| 凋亡检测 | AnnexinV-FITC | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| 碘化丙啶 | Dojindo Molecular Technologies | -- | |
| Cytek Aurora流式细胞仪 | Cytek Biosciences | -- | |
| TUNEL检测试剂盒 | Roche Diagnostics | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Bimake, Selleck | -- |
| 免疫荧光 | Hoechst 33342 | -- | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Hunan SLAC Laboratory Animal CO. LTD | -- |
| 免疫组化 | 免疫组化试剂盒 | Boster Inc. | -- |
| 质粒构建 | pCAGGS-AKT1-HA质粒 | -- | -- |
| pcDNA3.1-LMP1-Flag质粒 | -- | -- | |
| pCAGGS-Flag-CYPA质粒 | -- | -- | |
| pCMV3-p65质粒 | Sino Biological Inc. | HG12054-NF | |
| 基因编辑 | lentiCRISPRv2质粒 | -- | -- |
| psPAX2包装质粒 | -- | -- | |
| Pmd2.G包膜质粒 | -- | -- | |
| 药物处理 | 雷帕霉素 | -- | -- |
| 抑制剂 | NF-κB抑制剂 | -- | -- |
| 筛选药物 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、培养条件 阅读提示:Methods 2.1 Cell lines |
| 质粒转染 | 质粒名称、转染试剂、浓度、时间 阅读提示:Methods 2.2 Plasmids and siRNA |
| 基因敲除 | gRNA序列、构建方法、筛选药物浓度、细胞系 阅读提示:Methods 2.3 CRISPR/cas9 technique |
| 蛋白质检测 | 抗体信息、稀释比例、孵育条件 阅读提示:Methods 2.4 Western blotting |
| 细胞活力检测 | 细胞数量、CCK-8检测时间点、波长 阅读提示:Methods 2.5 Cell viability assay |
| 凋亡检测 | 染色方案、流式细胞仪型号、分析软件 阅读提示:Methods 2.6 Cell apoptosis detection |
| 免疫共沉淀 | 抗体、洗涤条件、孵育时间 阅读提示:Methods 2.7 Co-immunoprecipitation assay |
| 免疫荧光 | 固定、透化、封闭条件、抗体孵育 阅读提示:Methods 2.8 Immunofluorescence assay |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、细胞注射量、分组、时间 阅读提示:Methods 2.9 Nude mice experiment |
| 免疫组化 | 抗体、修复条件、显色系统 阅读提示:Methods 2.10 Immunohistochemistry |
| 生物信息预测 | STRING数据库使用 阅读提示:Methods 2.11 Protein-protein interaction prediction |
| 统计分析 | 统计方法、显著性水平、软件 阅读提示:Methods 2.12 Statistical analysis |