一种高度光稳定且明亮的绿色荧光蛋白

A highly photostable and bright green fluorescent protein.

作者信息Masahiko Hirano, Ryoko Ando, Satoshi Shimozono, Mayu Sugiyama, Noriyo Takeda, Hiroshi Kurokawa, Ryusaku Deguchi, Kazuki Endo, Kei Haga, Reiko Takai-Todaka, Shunsuke Inaura, Yuta Matsumura, Hiroshi Hama, Yasushi Okada, Takahiro Fujiwara, Takuya Morimoto, Kazuhiko Katayama, Atsushi Miyawaki
PMID35468954
发布时间2022-07
DOI10.1038/s41587-022-01278-2

实验完整度

高

包含体外纯化蛋白的光谱与光漂白测定、活细胞成像(WF、SIM、共聚焦)验证光稳定性,并进行了ER、线粒体、微管及病毒蛋白的多层级功能验证。

主要模型

HeLa细胞 COS-7细胞 原代海马神经元 VeroE6/TMPRSS2细胞

重点核对

光漂白实验中使用的光源类型和强度(如5.6 W cm^-2) 蛋白质浓度(如1 μM) 表达FP的细胞类型(如HeLa、COS-7) 成像模式(WF、3D-SIM、共聚焦) SARS-CoV-2感染实验的MOI和固定时间

摘要

荧光蛋白的低光稳定性是荧光显微镜许多应用中的限制因素。在这里,我们介绍了StayGold,一种来源于水螅纲动物Cytaeis uchidae的绿色荧光蛋白(GFP)。StayGold的光稳定性比目前任何可用的荧光蛋白高出一个数量级以上,其细胞亮度与mNeonGreen相似。我们使用StayGold,通过结构化照明显微镜(SIM)对内质网(ER)的动态进行了高时空分辨率、持续数分钟的成像,并观察到比针对ER稳定性优化的GFP变体显著更少的光漂白。利用StayGold融合蛋白和SIM,我们还对线粒体融合和分裂的动态进行了成像,并绘制了感染严重急性呼吸综合征冠状病毒2的固定细胞中的病毒刺突蛋白图谱。由于StayGold是二聚体,我们创建了一个串联二聚体版本,使我们能够观察微管和神经元中兴奋性突触后密度的动态。StayGold将大幅减少光漂白带来的限制,尤其是在活细胞或体积成像中。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
开发一种具有高光稳定性和高亮度的荧光蛋白,以克服光漂白对活细胞和超分辨成像的限制。
核心机制
StayGold来源于水母Cytaeis uchidae,其高光稳定性可能与特定的氨基酸序列和单点突变(V168A)有关,该突变提高了亮度和表达效率,同时不损害光稳定性。
主要证据
通过体外纯化蛋白的光漂白实验、活细胞成像(WF、SIM、共聚焦)证明StayGold的光稳定性优于EGFP、mNeonGreen等,并在ER、线粒体、微管和SARS-CoV-2刺突蛋白成像中验证了其应用价值。
研究意义
StayGold将减少光漂白限制,尤其在活细胞或体积成像中,为超分辨成像提供了新的工具。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

分子克隆和突变

从水母中克隆荧光蛋白基因,并通过突变改善其亮度和表达。

通过RNA-seq鉴定编码FP的转录本,克隆CU17S,通过随机诱变获得V168A突变体(StayGold)。

2

体外光稳定性测定

比较StayGold与其他绿荧光蛋白的光稳定性。

纯化蛋白,制备1 μM蛋白胶,在WF照明下测量光漂白曲线,计算t1/2。

3

活细胞光稳定性验证

检查StayGold在活细胞中的光稳定性。

稳定表达FP的HeLa细胞,在HBSS或DMEM中连续WF成像,测量光漂白。

4

ER成像应用

展示StayGold在活细胞ER超分辨成像中的应用。

构建靶向ER的StayGold变体(er-(n2)oxStayGold(c4)),在HeLa细胞中表达,进行3D-SIM连续成像观察ER动态。

5

线粒体成像应用

展示StayGold在活细胞线粒体动态成像中的应用。

构建靶向线粒体的StayGold(mt-(n1)StayGold),在HeLa细胞中表达,进行3D-SIM成像观察融合分裂。

6

蛋白融合应用

评估StayGold串联二聚体在蛋白标记中的应用。

构建tdStayGold,标记EB3(微管正端)和PSD-95(突触后密度),在COS-7细胞和神经元中成像。

7

SARS-CoV-2刺突蛋白可视化

利用StayGold融合纳米抗体可视化SARS-CoV-2刺突蛋白。

构建Nb(S1)= =StayGold,感染VeroE6/TMPRSS2细胞,固定后免疫染色,进行WF和3D-SIM成像。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
U-2910分光光度计Hitachi--
F-2500荧光分光光度计Hitachi--
C9920-02绝对光致发光量子产率光谱仪Hamamatsu Photonics--
蛋白质检测染料试剂浓缩试剂盒Bio-Rad5000006
Optima XL-A分析超速离心机Beckman--
DMEM培养基Sigma-Aldrich--
胎牛血清AusGeneX Pty. Ltd.--
脂质体2000Thermo Fisher Scientific11668027
IX-81显微镜Olympus--
ORCA AG相机Hamamatsu Photonics--
N-SIM S显微镜Nikon Instruments--
ORCA FUSION相机Hamamatsu Photonics--
SpinSR10转盘共聚焦系统Olympus--
CSU X1转盘单元Yokogawa--
iXon Ultra 897 EMCCD相机Andor Technology--
FACSAria II流式细胞仪BD Biosciences--
Biacore T200表面等离子体共振仪GE Healthcare--
Vybrant DyeCycle Ruby染料Thermo Fisher ScientificV10309
DAPIFuji Film340-07971
抗ERGIC3抗体Abcamab129179
抗Nsp8抗体GeneTexGTX632696
抗dsRNA抗体MerckMABE1134-100UL
抗泛钙粘蛋白抗体Sigma-AldrichC1821
Alexa Fluor 555偶联的驴抗兔IgGThermo Fisher ScientificA-31572
Alexa Fluor 647偶联的驴抗鼠IgGThermo Fisher ScientificA-31571

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
光漂白实验(纯化蛋白)
激发光强度(如5.6 W/cm²),蛋白浓度(1 μM),凝胶介质(polyacrylamide gel)
阅读提示:Methods: WF photobleaching (purified protein)
光漂白实验(活细胞)
细胞类型,培养基(HBSS或DMEM),激发光强度
阅读提示:Methods: WF photobleaching (living cells in HBSS)、WF photobleaching (living cells in DMEM)
ER成像
细胞系(HeLa),表达构建体(er-(n2)oxStayGold(c4)),成像模式(3D-SIM),光照强度(2.4 W/cm²),帧率(2.6 Hz)
阅读提示:Methods: SIM for live imaging; Figure legends: Fig. 4
线粒体成像
细胞系(HeLa稳定表达mt-(n1)StayGold),成像模式(3D-SIM),光照强度(3.9 W/cm²),帧率(4.4 Hz)
阅读提示:Extended Data Fig. 3; Methods: SIM for live imaging
SARS-CoV-2成像
细胞系(VeroE6/TMPRSS2),MOI(0.1或0.02),感染时间(24或36小时),Nb(S1)= =StayGold浓度(3.4 μg/ml),固定方式
阅读提示:Methods: Visualizing SARS-CoV-2 S protein in infected cells