体内鉴定PTENα/β的切割现象
观察PTENα/β在异种移植瘤中的存在形式,发现额外条带并推测切割。
在多种细胞系来源的异种移植瘤中,通过Western blot检测PTENα/β的条带,发现PTENα/β被切割产生FragC和FragN;体外培养细胞中未检测到。
Furin extracellularly cleaves secreted PTENα/β to generate C-terminal fragment with a tumor-suppressive role.
包含体外切割实验、细胞培养、动物移植瘤模型、患者样本分析及质谱鉴定等多种证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
SMMC-7721肝癌细胞系 PTEN敲除的SMMC-7721细胞 293T细胞 裸鼠移植瘤模型 肝癌患者配对样本
PTENα/β的切割依赖于NTE中的多聚精氨酸序列(残基47-52) 弗林蛋白酶介导切割,FURIN敲低或抑制剂处理减少切割 切割片段FragC不能进入细胞但抑制肿瘤生长 切割抗性PTENα突变体增强肿瘤促进作用 肝癌组织中FragC水平及弗林蛋白酶表达下调
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察PTENα/β在异种移植瘤中的存在形式,发现额外条带并推测切割。
在多种细胞系来源的异种移植瘤中,通过Western blot检测PTENα/β的条带,发现PTENα/β被切割产生FragC和FragN;体外培养细胞中未检测到。
确定PTENα/β被切割的具体位置。
通过缺失突变和点突变,确定多聚精氨酸序列(残基47-52)为切割位点,其中R49A或R50,51A突变足以阻断切割。
验证PTENα的切割是否发生细胞外。
将细菌纯化的PTENα与细胞共孵育,检测到切割;转染Flag-PTENα的细胞培养基中检测到FragC和FragN,而细胞裂解液中无。
确定负责PTENα切割的酶。
纯化的弗林蛋白酶与PTENα孵育产生切割片段;敲低FURIN或使用抑制剂hexa-D-arginine减少切割,过表达Furin增强切割。
确定PTENα/β分泌所必需的NTE序列。
通过缺失突变分析,确定NTE中残基98-108和112-123(PTENβ)或125-135和139-150(PTENα)为分泌所需元件。
检验FragC是否具有肿瘤抑制功能。
将纯化的PTENα-WT、PTENα-Δ6R和FragC注射入异种移植瘤,比较肿瘤生长情况。结果显示FragC和PTENα-WT(可被切割)抑制肿瘤生长,而PTENα-Δ6R无效。
检验无法切割的PTENα是否增强肿瘤促进作用。
在SMMC-7721ΔPTEN细胞中表达PTENα-WT或切割抗性突变体(R49A、R49K、3RK),皮下接种裸鼠,测量肿瘤体积和重量。结果显示切割抗性突变体比WT更具促肿瘤作用。
验证PTENα/β切割在肝癌中的变化。
对20例肝癌及配对正常组织进行Western blot,检测PTENα/β、FragC和Furin水平。发现肿瘤组织中FragC和Furin下调,切割效率降低。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白检测 | 抗PTEN抗体 | CST | 9559 |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | MBL | PM053-7 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma-Aldrich | A8592 | |
| 抗GFP抗体 | Abcam | ab183734 | |
| 抗Akt(泛)抗体 | CST | 4691 | |
| 抗磷酸化Akt(Ser473)抗体 | CST | 4060 | |
| 抗V5抗体 | Abcam | ab182008 | |
| 抗WDR5抗体 | Abcam | ab178410 | |
| 抗S-tag抗体 | Beyotime | AF0285 | |
| 抗弗林蛋白酶抗体 | Abcam | ab183495 | |
| 重组蛋白 | 人血清白蛋白 | Sino Biological | 10968-HNAY |
| 分子克隆 | T4 DNA连接酶 | New England Biolabs | M0202T |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo | 15596026 |
| 逆转录 | MMLV逆转录试剂 | Promega | M1705 |
| 分子克隆 | NEBuilder HiFi DNA组装预混液 | New England Biolabs | E2621L |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 蛋白纯化 | BeyoGold His标签纯化树脂 | Beyotime | -- |
| 抗Flag M2亲和凝胶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| GFP陷阱 | ChromoTek | -- | |
| 蛋白电泳 | SurePAGE Bis-Tris 4-12%凝胶 | GenScript | -- |
| 蛋白印迹 | 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | -- |
| Immobilon Western化学发光HRP底物试剂盒 | Merck Millipore | -- | |
| 转染 | jetPRIME转染试剂 | Polyplus | -- |
| 蛋白浓缩 | Amicon过滤器(3kD) | Millipore | -- |
| 蛋白表达 | 异丙基β-D-硫代半乳糖苷 | -- | -- |
| 质谱分析 | Orbitrap Fusion LUMOS质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Easy-nLC 1200液相色谱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ReproSil-Pur 120 A C18-AQ 1.9微米色谱柱填料 | Dr. Maisch GmbH | -- | |
| 蛋白标记 | Alexa Fluor 647蛋白标记系统 | Invitrogen | -- |
| 蛋白递送 | PULSin蛋白递送试剂 | -- | -- |
| 显微镜观察 | Nikon Eclipse TI激光扫描共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| 抑制剂处理 | 六聚D-精氨酸 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PTENα/β切割检测 | 细胞系来源、异种移植瘤模型、Western blot检测条件 阅读提示:图1和图S1的图注,或Method Details中'Western blot'部分 |
| 弗林蛋白酶切割 | FURIN敲低或抑制处理条件、切割效率 阅读提示:图3C-E,或Method Details中'In vitro cleavage of PTENα with Furin' |
| 分泌实验 | 分泌元件(残基98-108和112-123) 阅读提示:图4D-E,或Method Details中'Transfection and Secretion determination' |
| 动物肿瘤治疗 | 注射剂量、频率、肿瘤体积测量时间 阅读提示:图5B,或Method Details中'Tumor treatment' |
| 临床样本分析 | 样本数量、配对类型、Western blot定量方法 阅读提示:图6,或Method Details中'Human liver cancer samples' |