ADE活性的鉴定
确定中和抗体是否在FcγRIIB表达细胞上增强SARS-CoV-2假病毒感染
使用SARS-CoV-2假病毒与不同浓度抗体混合,感染Raji和Daudi细胞,检测荧光素酶活性。
Antibody-dependent enhancement (ADE) of SARS-CoV-2 pseudoviral infection requires FcγRIIB and virus-antibody complex with bivalent interaction.
包含分子结构解析(X射线晶体学)、体外感染模型(Raji、Daudi细胞)、功能验证(中和与ADE实验)、机制验证(抑制剂实验)及原代人B细胞验证等多层级证据。
Raji细胞 Daudi细胞 人原代B细胞 SARS-CoV-2假病毒
使用Raji和Daudi细胞评估ADE活性 抗体二价/单价形式(野生型hIgG1、KIH二价、KIH-Mo单价) FcγRIIB表达及其与Fc的相互作用(LALA突变及抗FcγRIIB抗体) 内吞和巨胞饮抑制剂(Cytochalasin D、Dynole 34-2、Filipin III) 内涵体运输和溶酶体酸化抑制剂(Apilimod、Baf.A1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定中和抗体是否在FcγRIIB表达细胞上增强SARS-CoV-2假病毒感染
使用SARS-CoV-2假病毒与不同浓度抗体混合,感染Raji和Daudi细胞,检测荧光素酶活性。
验证ADE活性是否依赖于抗体Fc段与FcγRIIB的相互作用
引入LALA突变破坏Fc与FcγR的相互作用,使用抗FcγRIIB抗体阻断,或增强FcγRIIB结合的突变,评估ADE活性的变化。
确定抗体与RBD结合的表位和结合模式,以解释与ADE相关的结构基础
解析MW01和MW05的Fab与SARS-CoV-2 RBD复合物的晶体结构,并通过叠加模型分析其与S三聚体的结合方式。
验证ADE活性是否依赖于抗体与S三聚体的二价结合
利用knob-in-hole(KIH)策略生成二价和单价抗体,通过SPR测量结合动力学,并比较它们在ADE和中和实验中的活性。
探究FcγRIIB介导病毒-抗体复合物进入细胞的途径和细胞内转运机制
使用巨胞饮抑制剂(Cytochalasin D)、内吞抑制剂(Dynole 34-2, Filipin III)、内涵体运输抑制剂(Apilimod)和溶酶体酸化抑制剂(Baf.A1)处理细胞,检测对ADE活性的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Hyclone | SH30243.01 |
| RPMI 1640培养基 | BasalMedia | L220KJ | |
| Dynamis培养基 | GIBCO | A2661501 | |
| 中和实验和ADE实验 | 荧光素酶检测试剂 | PerkinElmer | 6066769 |
| ADE实验和ADE抑制实验 | 荧光素酶检测试剂 | Promega | G7940 |
| 单核细胞分化 | 佛波醇12-豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | P8139 |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L6529 | |
| 流式细胞术 | 抗FcγRIA抗体 | Sino Biological | 10256-R401-F |
| 抗FcγRIIA抗体 | Sino Biological | 10374-MM01-F | |
| 抗FcγRIIIA抗体 | Sino Biological | 10389-MM41-F | |
| 抗FcγRIIB抗体 | Biolegend | 398302 | |
| FITC标记试剂盒 | Sigma-Aldrich | MX488AS100 | |
| SPR | CM5生物传感芯片 | Cytiva | BR100012 |
| NTA生物传感芯片 | Cytiva | 28994951 | |
| His捕获试剂盒 | Cytiva | 28995056 | |
| 蛋白质表达和纯化 | 293fectin转染试剂 | Life Technologies | 12347019 |
| 蛋白质纯化 | Mabselect纯化填料 | Cytiva | 17-5199-02 |
| HisTrap HP纯化柱 | GE Healthcare | 17-5248-01 | |
| 蛋白质浓缩 | 超滤浓缩器 | Sartorius Stedim | VS2002 |
| Vivacon 500浓缩器 | Sartorius Stedim | VS0122 | |
| 细胞培养 | T75培养瓶 | Corning | 430641 |
| ADE抑制实验 | 细胞松弛素D | MCE | HY6682 |
| Dynole 34-2 | Abcam | ab120346 | |
| 菲立平III | CAYMAN CHEMICAL COMPANY | 70400 | |
| 阿匹莫德 | MCE | HY-14644 | |
| 巴弗洛霉素A1 | Cell Signaling | 56545 | |
| 重组蛋白 | SARS-CoV-2 S三聚体重组蛋白 | ACRO Biosystems | SPN-C52H9 |
| 蛋白表达 | pKN019载体 | -- | -- |
| pKN009-A载体 | -- | -- | |
| pKN009-B载体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ADE实验 | 细胞系(Raji、Daudi)、病毒感染剂量(750 TCID50)、抗体稀释倍数(2倍)、孵育时间(60分钟)、细胞密度(2×10^6 cells/mL)、检测时间(24小时) 阅读提示:Methods部分“Antibody-dependent enhancement (ADE) assay” |
| FcγRIIB依赖性验证 | LALA突变、G237D、P238D、P271G、A330R组合突变、抗FcγRIIB抗体处理 阅读提示:Methods部分“Generation of mutated mAbs to increase the binding to FcγRIIB”及图1c、d |
| 二价结合验证 | KIH二价和单价抗体的构建、SPR检测条件(捕获水平约200 RU或75 RU,抗体浓度梯度) 阅读提示:Methods部分“Generation of KIH format bivalent and monovalent mAbs”及“Surface plasmon resonance (SPR)” |
| 进入途径和细胞内转运 | 抑制剂种类及初始浓度:Cytochalasin D(200 μM)、Dynole 34-2(500 μM)、Filipin III(200 μM)、Apilimod(100 μM)、Baf.A1(10 μM);溶剂对照DMSO 阅读提示:Methods部分“ADE inhibition assay”及图4a-d |
| 晶体结构解析 | 蛋白复合物制备摩尔比(MW01/RBD 1:1,MW05/RBD 1:2.5)、结晶条件、衍射数据收集参数 阅读提示:Methods部分“Generation of Fab/RBD complex”和“Crystallization, structure determination, and Spike trimer-binding modeling” |