验证InlA包被珠的E-钙粘蛋白依赖性内化
确认InlA包被珠作为工具能特异性地模拟InlA介导的侵入,且依赖于E-钙粘蛋白。
制备InlA包被乳胶珠,与野生型MCF10A和CDH1敲除MCF10A细胞孵育,检测内化效率;与BSA、GST包被珠对比。
Listeria monocytogenes Co-Opts the Host Exocyst Complex To Promote Internalin A-Mediated Entry.
体外细胞模型(Caco-2、MCF10A)结合InlA包被珠摄取实验、VAMP3-EGFP胞吐检测、RNAi敲低外泌复合体亚基、NSF抑制肽处理及表面生物素化分析,包含功能验证和机制验证。
Caco-2肠上皮细胞系 MCF10A乳腺上皮细胞系(E-钙粘蛋白表达与敲除)
InlA包被乳胶珠(3μm)与Caco-2细胞共孵育时间:15分钟(胞吐检测)或30分钟(内化检测) TAT-NSF700肽处理浓度:10 μM,处理时间:20分钟(胞吐)或45分钟(内化) siRNA敲低Exo70、Exo84、Sec6的浓度为100 nM,转染后约72小时进行内化检测 表面生物素化使用EZ-Link Sulfo-NHS-SS-Biotin(10 mM),4°C处理30分钟
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认InlA包被珠作为工具能特异性地模拟InlA介导的侵入,且依赖于E-钙粘蛋白。
制备InlA包被乳胶珠,与野生型MCF10A和CDH1敲除MCF10A细胞孵育,检测内化效率;与BSA、GST包被珠对比。
探究InlA包被珠是否在宿主细胞侵入位点刺激胞吐。
使用表达VAMP3-EGFP的Caco-2细胞,孵育InlA包被珠15分钟,通过抗EGFP抗体标记外表面VAMP3-EGFP,量化富集倍数。
确定通过NSF抑制胞吐是否能减少InlA包被珠的内化。
用TAT-NSF700肽处理Caco-2细胞,随后检测胞吐和内化,并评估细胞活力。
确定外泌复合体是否被招募到InlA介导的侵入位点。
在Caco-2细胞中表达EGFP-Exo70,与InlA包被珠孵育15分钟,通过共聚焦显微镜观察EGFP-Exo70的聚集。
通过RNAi敲低外泌复合体亚基,检测对InlA包被珠和细菌侵入的影响。
用siRNA敲低Exo70、Exo84、Sec6等,通过Western blot验证敲低效率,检测InlA包被珠内化和李斯特菌侵入。
排除胞吐抑制通过减少表面E-钙粘蛋白而影响侵入的可能性。
运用表面蛋白生物素化方法,检测TAT-NSF700处理或siRNA敲低外泌蛋白后E-钙粘蛋白的表面水平。
确定E-钙粘蛋白的同嗜性连接是否也激活类似InlA的胞吐和外泌复合体动员。
使用包被E-钙粘蛋白胞外域(ECD)的珠,检测胞吐、Exo70招募和内化,并验证NSF和siRNA对其的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 含4.5 g/L葡萄糖和2 mM谷氨酰胺的DMEM | Life Technologies | 11995-065 |
| 人转铁蛋白 | Sigma-Aldrich | T8158 | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| G418 | -- | -- | |
| 抗体 | 抗E-钙粘蛋白抗体 | Abcam | ab15148 |
| 抗GST抗体 | Sigma-Aldrich | G7781 | |
| 抗EGFP抗体 | Roche | 1181460001 | |
| 抗Exo70抗体 | Kerafast | D2001 | |
| 抗Exo84抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-5515532 | |
| 抗Sec3抗体 | Sigma-Aldrich | HPA037706 | |
| 抗Sec5抗体 | Kerafast | ED2002 | |
| 抗Sec6抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-374054 | |
| 抗Sec8抗体 | Becton Dickenson | 610658 | |
| 抗Sec10抗体 | Abcam | ab241472 | |
| 抗Sec15抗体 | Kerafast | ED2003 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T5168 | |
| Western blot | 辣根过氧化物酶标记的二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- |
| Bio-Rad Clarity Max Western ECL底物 | Bio-Rad | -- | |
| Odyssey成像系统 | Li-Cor Biosciences | -- | |
| 药物处理 | TAT-NSF700肽 | AnaSpec | -- |
| TAT肽 | AnaSpec | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 拉特伦库林A | Sigma-Aldrich | L5163 | |
| 重组蛋白 | 重组InlA蛋白(6xHis标记) | -- | -- |
| 纯化E-钙粘蛋白ECD-Fc融合蛋白 | Sino Biological | 10204-H02H | |
| 谷胱甘肽S转移酶 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMax转染试剂 | Life Technologies | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Life Technologies | -- | |
| siRNA寡核苷酸 | Sigma-Aldrich / Dharmacon | -- | |
| 珠子偶联 | 羧基修饰乳胶珠 | Polysciences | 09850 |
| 表面生物素化 | EZ-Link Sulfo-NHS-SS-生物素 | Thermo Fisher Scientific | 21331 |
| 链霉亲和素-琼脂糖珠 | Sigma-Aldrich | 85881 | |
| 蛋白A/G琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 蛋白纯化 | His-Bind树脂 | MerckMillipore | -- |
| HiTrap Q柱 | GE Healthcare | -- | |
| 细胞培养 | 脑心浸液肉汤 | Difco | -- |
| 细菌感染 | 庆大霉素 | -- | -- |
| 显微镜 | FV1200激光扫描共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
| 统计分析 | Prism软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | Caco-2亚克隆BBE1(ATTC CRL-2102)的培养条件(DMEM高糖、谷氨酰胺、转铁蛋白、FBS、青霉素-链霉素),VAMP3-EGFP稳定细胞系需G418筛选。 阅读提示:见Materials and Methods中的'Bacterial strains, mammalian cell lines, and media'部分。 |
| 珠子偶联 | InlA、BSA、GST或E-cadherin ECD与羧基修饰乳胶珠(直径3 μm)的共价偶联方法。 阅读提示:见Materials and Methods中的'Coupling of proteins to latex beads'部分。 |
| 胞吐检测 | VAMP3-EGFP外表面标记步骤:无透化条件下抗EGFP抗体孵育浓度和时间(1:50,4°C,45分钟)。 阅读提示:见Materials and Methods中的'Confocal microscopy analysis'部分。 |
| 内化测定 | 珠子与细胞比例(约5:1)、离心促进结合(1,000 rpm,2分钟)、孵育时间(30分钟)和胞外珠子标记方法(透化前抗体标记)。 阅读提示:见Materials and Methods中的'Quantification of internalization of beads'部分。 |
| NSF抑制 | TAT-NSF700或TAT肽使用浓度(10 μM)、处理时间(20分钟或45分钟)和对照条件(未处理或DMSO)。 阅读提示:见Materials and Methods中'Quantification of internalization of beads'和'Cell surface biotinylation studies'相关部分。 |
| siRNA敲低 | siRNA序列、浓度(100 nM)、转染试剂(Lipofectamine RNAiMax)和转染时间(约72小时)以确保敲低效率。 阅读提示:见Materials and Methods中的'siRNAs'和'Transfection'部分。 |
| 表面生物素化 | EZ-Link Sulfo-NHS-SS-Biotin浓度(10 mM)、4°C处理时间(30分钟)、淬灭步骤(20 mM甘氨酸)和裂解缓冲液成分。 阅读提示:见Materials and Methods中的'Cell surface biotinylation studies'部分。 |
| 细菌侵入 | 李斯特菌株(BUG 1047和BUG 949)的感染复数(MOI约30:1)、感染时间(1小时)和庆大霉素浓度(20 μg/mL)及处理时间(2小时)。 阅读提示:见Materials and Methods中的'Bacterial entry assays'部分。 |