细胞毒性评估
评估SAA、SAB、SAC对ACE2h细胞的毒性,确定安全实验浓度。
使用Cell Counting Kit-8检测不同浓度(0-400μM)处理24小时后的细胞活力;使用Annexin V-FITC/PI双染进行流式凋亡分析。
Three salvianolic acids inhibit 2019-nCoV spike pseudovirus viropexis by binding to both its RBD and receptor ACE2.
包含分子对接、SPR结合实验、细胞毒性凋亡检测及假病毒进入抑制实验,但缺乏体内模型及活病毒实验验证。
ACE2高表达HEK293T细胞(ACE2h细胞) 2019-nCoV刺突蛋白假病毒
SAA、SAB、SAC浓度梯度:0、25、50、100、200、400μM处理24小时 SPR结合常数KD值:SAA与RBD (3.82±0.43)e−6 M,与ACE2 (4.08±0.61)e−7 M等 假病毒进入抑制EC50:SAA 11.31μM、SAB 6.22μM、SAC 10.14μM 2019-nCoV刺突假病毒与VSV-G假病毒对照
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SAA、SAB、SAC对ACE2h细胞的毒性,确定安全实验浓度。
使用Cell Counting Kit-8检测不同浓度(0-400μM)处理24小时后的细胞活力;使用Annexin V-FITC/PI双染进行流式凋亡分析。
验证SAA、SAB、SAC是否能与2019-nCoV刺突蛋白RBD和ACE2蛋白物理结合。
通过分子对接分析化合物与RBD及ACE2的结合模式,使用表面等离子体共振(SPR)定量测定结合动力学和亲和力。
在细胞水平验证SAA、SAB、SAC对2019-nCoV刺突假病毒进入ACE2h细胞的抑制作用,并计算EC50。
在ACE2h细胞中加入不同浓度药物后,感染2019-nCoV刺突假病毒,通过荧光素酶活性定量病毒进入效率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 材料与试剂 | 丹酚酸A | Herbest Pharmaceutical Co., Ltd. | -- |
| 丹酚酸B | Ambrosia Pharmaceutical Co., Ltd. | -- | |
| 丹酚酸C | Herbest Pharmaceutical Co., Ltd. | -- | |
| 氯喹 | Macklin | -- | |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | HyClone | SH30022.01 |
| 胎牛血清 | HyClone | 16140071 | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Xi'an Hat Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| 凋亡检测 | 膜联蛋白V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | 7Sea Pharmatech Co., Ltd. | A005-3 |
| 细胞毒性检测 | 细胞计数试剂盒 | 7Sea Pharmatech Co., Ltd. | -- |
| 病毒进入实验 | 2019-nCoV刺突假病毒 | Sino Biological | PSV001 |
| 病毒进入实验对照 | VSV-G假病毒 | Genomeditech | GM-2439LV18 |
| SPR实验 | 带6-His标签的ACE2蛋白 | -- | -- |
| SARS-CoV-2刺突S1蛋白 | -- | -- | |
| Open SPRTM表面等离子体共振仪 | Nicoya Lifesciences | -- | |
| 假病毒进入检测 | 荧光素酶检测系统 | Promega | E1500 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | ACE2h细胞构建方法、培养基组成(DMEM高糖、10% FBS、1%青霉素-链霉素、0.75μg/ml嘌呤霉素)、培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Methods - Cell culture |
| 细胞毒性检测 | 细胞接种密度(5×10^3/孔)、药物处理浓度(0-400μM)、处理时间(24h)、CCK-8孵育时间(2h)、检测波长(450nm) 阅读提示:Methods - Cytotoxicity assay; Figure 1 |
| 凋亡检测 | 细胞接种密度(6孔板)、药物处理浓度(0,25,50μM)、处理时间(24h)、Annexin V-FITC和PI的用量及孵育条件 阅读提示:Methods - Apoptosis assay; Figure 2 |
| 分子对接 | 使用软件(SYBYL-X 2.0)、蛋白质结构(PDB ID: 6M0J)、对接搜索空间、力场参数 阅读提示:Methods - Docking studies |
| SPR结合实验 | 固定蛋白浓度(30μg/ml)、化合物浓度(12.5, 25, 50, 100μM)、结合和解离时间(250s)、流速(20μl/s)、再生条件(盐酸,pH 2.0) 阅读提示:Methods - Surface plasmon resonance |
| 假病毒进入抑制实验 | 细胞密度(5×10^4/孔)、药物预处理时间(2h)、假病毒加入量(5μl)、病毒孵育时间(6-8h)、后续培养时间(48h)、荧光素酶检测条件 阅读提示:Methods - Detection of 2019-nCoV spike pseudovirus entry into ACE2h cells; Figure 5 & 6 |
| 统计分析 | 数据表示方式(mean±SEM)、统计方法(方差分析)、组间比较(双尾检验)、显著性水平(p < .05) 阅读提示:Methods - Statistical analysis |