基于碳纳米管场效应晶体管(CNT-FET)的生物传感器用于快速检测SARS-CoV-2(COVID-19)表面刺突蛋白S1

Carbon nanotube field-effect transistor (CNT-FET)-based biosensor for rapid detection of SARS-CoV-2 (COVID-19) surface spike protein S1.

作者信息Mazin A Zamzami, Gulam Rabbani, Abrar Ahmad, Ahmad A Basalah, Wesam H Al-Sabban, Saeyoung Nate Ahn, Hani Choudhry
PMID34715586
发布时间2022-02
DOI10.1016/j.bioelechem.2021.107982

实验完整度

研究包含了器件制备、表面修饰、电学表征、选择性、重复性和重复使用性验证,但缺乏动物模型或临床样本验证,且未提供与真实阳性样本的检测数据。

主要模型

CNT-FET器件(Si/SiO2基底,SWCNT网络) SARS-CoV-2重组S1抗原 SARS-CoV-1和MERS-CoV重组S1抗原(用作非靶标) 健康人唾液样本(强化S1抗原)

重点核对

PBASE修饰浓度(2 mM)和反应时间(1小时) 抗体固定浓度(100 µg/mL的anti-SARS-CoV-2 S1) 抗原检测缓冲液(10 mM醋酸铵,pH 6.0)及抗原浓度范围(0.1–5000 fg/mL) 选择性测试中使用的非靶抗原(SARS-CoV-1和MERS-CoV S1) 重复性测试中使用的芯片批次数(3批)和传感测试重复次数(≥3次)

摘要

在疫情暴发期间,对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的大规模诊断对于溯源和治疗非常重要。我们开发了一种快速(2-3分钟)、易用、低成本、定量的基于碳纳米管场效应晶体管(CNT-FET)的电化学生物传感器,可实现对强化唾液样本中SARS-CoV-2 S1的数字检测,从而快速准确地检测SARS-CoV-2 S1抗原。该生物传感器在Si/SiO2表面通过CNT打印制备,并固定了抗SARS-CoV-2 S1抗体。SARS-CoV-2 S1抗体通过连接分子1-芘丁酸N-羟基琥珀酰亚胺酯(PBASE)以非共价作用固定在S-D通道区域之间的CNT表面。使用商业化的SARS-CoV-2 S1抗原表征了CNT-FET生物传感器的电输出。在10 mM醋酸铵缓冲液(pH 6.0)中,CNT-FET生物传感器能有效检测0.1 fg/mL至5.0 pg/mL浓度的SARS-CoV-2 S1抗原。所开发的CNT-FET生物传感器的检测限(LOD)为4.12 fg/mL。选择性测试使用目标SARS-CoV-2 S1和非目标SARS-CoV-1 S1及MERS-CoV S1抗原在10 mM醋酸铵缓冲液(pH 6.0)中进行。该生物传感器显示出高选择性(对SARS-CoV-1 S1或MERS-CoV S1抗原无响应),能够检测10 mM醋酸铵缓冲液(pH 6.0)中的SARS-CoV-2 S1抗原。该生物传感器灵敏度高、节省时间,可能成为快速检测患者唾液中SARS-CoV-2 S1抗原的有用平台。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
开发一种快速、灵敏、选择性高的基于碳纳米管场效应晶体管(CNT-FET)的生物传感器,用于检测SARS-CoV-2 S1抗原。
核心机制
基于抗原-抗体结合引起的源漏电流(IDS)变化:抗体通过PBASE修饰固定在CNT表面,与带正电的SARS-CoV-2 S1结合后改变CNT-FET的电输运特性,从而产生可测量的电信号。文中还提到静电场效应和肖特基势垒效应可能参与电流变化机制。
主要证据
通过Western blot验证了抗体的特异性;通过SEM和XPS验证了表面修饰和抗原结合;通过电学测量显示了浓度依赖性响应,LOD为4.12 fg/mL,且对非特异性抗原(SARS-CoV-1和MERS-CoV S1)无响应。
研究意义
该生物传感器有望成为快速(2-3分钟)、低成本、易于操作的工具,用于SARS-CoV-2 S1抗原的检测和COVID-19感染的诊断,特别适用于大规模筛查,但需要进一步在真实临床样本中验证。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

CNT-FET器件制造

制备具有半导体特性的CNT-FET器件,为后续功能化和检测提供平台。

通过光刻技术在Si/SiO2基底上图案化Ti/Au电极,打印SWCNT,烘烤,并用SU-8光刻胶钝化电极。

2

表面修饰和抗体固定

通过PBASE连接分子将抗SARS-CoV-2 S1抗体固定在CNT表面。

将CNT-FET芯片浸入2 mM PBASE溶液,然后滴加抗体孵育,用BSA封闭。

3

电学表征

评估器件在每一步修饰后的半导体特性和传感能力。

测量IDS-Vg曲线,记录功能化过程引起的电流变化。

4

SARS-CoV-2 S1抗原检测

测试生物传感器对不同浓度SARS-CoV-2 S1抗原的响应,确定检测限和检测范围。

在稳定基线后,依次滴加递增浓度的S1抗原溶液,记录实时IDS响应,并绘制校准曲线。

5

选择性测试

验证传感器对SARS-CoV-2 S1的特异性,与SARS-CoV-1和MERS-CoV S1进行区分。

使用相同条件检测靶标和非靶标抗原,测量IDS响应并比较。

6

强化唾液样本测试

模拟真实临床样本,评估传感器在复杂基质中的检测能力。

将S1抗原添加到健康唾液中制备强化样本,检测传感器的响应。

7

重复性和重复使用性测试

评估传感器的制造一致性和重复使用后的性能稳定性。

使用多个批次芯片测试响应,并对使用后的芯片进行清洗和再功能化,比较重复使用的性能。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证分子表达变化

产品清单

实验环节名称品牌货号
单壁碳纳米管NanoIntegris--
SARS-CoV-2刺突蛋白S1亚基-His标签重组蛋白Sino Biological40591-V08H
SARS-CoV-1刺突蛋白S1亚基-His标签重组蛋白Sino Biological40150-V08B1
兔抗刺突蛋白S1单克隆抗体Sino Biological40150-R007
HRP标记的山羊抗兔IgG多克隆二抗Abcamab6721
1-芘丁酸N-羟基琥珀酰亚胺酯Sigma Aldrich457078
牛血清白蛋白Sigma AldrichA7906
巯基PEG-羧基功能化金纳米颗粒(20 nm)Sigma Aldrich765511
1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐Sigma Aldrich03450
N-羟基琥珀酰亚胺Sigma Aldrich130672
增强化学发光液Dongin BiotechECL-PS250
硅/二氧化硅晶圆Waferbiz--
PVDF转印膜Merck Millipore--
去离子水纯化系统(MDM Wellix Plus)MDM Corporation--
Keithley探针台Keithley--
K-Alpha X射线光电子能谱仪Thermo Fisher Scientific--
场发射扫描电子显微镜JEOL Ltd--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
器件制造
CNT打印浓度(0.1 mg/mL)、溶剂(1,2-二氯苯)、退火温度(120°C)和时间(10分钟)、钝化层材料(SU-8)
阅读提示:见3.1节 CNT-FET device fabrication
表面修饰和抗体固定
PBASE浓度(2 mM)和孵育时间(1小时),抗体浓度(100 µg/mL)和孵育条件(4°C过夜),封闭试剂(1% BSA)和时间(20分钟)
阅读提示:见3.4节 Surface modification and antibody immobilization on CNT-FET
抗原检测
缓冲液类型(10 mM AA缓冲液,pH 6.0),抗原浓度范围(0.1–5000 fg/mL),测量电压(Vds=0.5 V, Vg=-1.5 V),样本体积(0.8 µL)
阅读提示:见3.8节 Antigen sample preparation and antigen test 及 4.6节 Determination of response time, detection limit, and detection range
选择性测试
非靶标抗原种类(SARS-CoV-1 S1、MERS-CoV S1)、浓度(100 fg/mL)、缓冲液(10 mM AA, pH 6.0)
阅读提示:见3.9节 Selectivity measurements of the CNT-FET biosensor 和 4.8节 Selectivity study
强化唾液实验
唾液样本来源(健康人)、强化浓度范围(0.1–5000 fg/mL)、孵育条件(30分钟,37°C)、测试体积(1.0 µL)
阅读提示:见3.10节 SARS-CoV-2 S1 fortified saliva preparation and electrical response measurement