鉴定CD147的二甲基化修饰
确证CD147蛋白存在二甲基化修饰并定位具体赖氨酸位点。
用LC-MS/MS分析NSCLC组织,鉴定CD147的13个赖氨酸二甲基化位点,并通过IP和western blot验证;合成标准肽段进行质谱比对。
Di-methylation of CD147-K234 Promotes the Progression of NSCLC by Enhancing Lactate Export
包含体外细胞实验(质谱鉴定、coIP、FRET、PLA、代谢检测)、体内裸鼠移植瘤模型及临床组织芯片分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证(乳酸输出、肿瘤生长)和机制验证(KMT5A甲基化、MCT4转运)。
A549细胞系 H460细胞系 HEK293T细胞系 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
CD147-K234R突变体与野生型CD147的构建及其表达验证 KMT5A敲低和过表达对CD147-K234me2水平的影响 CD147-K234me2对MCT4膜转位和乳酸输出的影响 体内荷瘤小鼠的肿瘤体积和重量测量方法 NSCLC组织芯片中CD147-K234me2和KMT5A的IHC评分标准
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确证CD147蛋白存在二甲基化修饰并定位具体赖氨酸位点。
用LC-MS/MS分析NSCLC组织,鉴定CD147的13个赖氨酸二甲基化位点,并通过IP和western blot验证;合成标准肽段进行质谱比对。
确定催化CD147二甲基化的甲基转移酶及其具体位点。
通过coIP和LC-MS/MS鉴定CD147相互作用蛋白,发现KMT5A;体外甲基化实验验证KMT5A甲基化CD147;构建CD147ECD/ICD和K234R突变体,确定K234为修饰位点。
获得能特异性检测CD147-K234me2的抗体并用其检测修饰水平。
用K234me2肽段免疫兔子制备多克隆抗体,通过点印迹、western blot、ELISA和SPR验证特异性,并用于IHC检测NSCLC组织。
明确CD147-K234me2是否参与调节NSCLC细胞的糖代谢。
在KMT5A敲低/过表达细胞和CD147-WT/K234R细胞中测量葡萄糖摄取、LDH活性和乳酸输出,并检测相关分子表达。
探究CD147-K234me2是否促进CD147与MCT4的相互作用及MCT4的膜转位。
通过FRET、PLA、coIP检测CD147-MCT4相互作用;通过免疫荧光观察共定位及膜定位。
在动物体内评估CD147-K234me2对肿瘤生长和代谢的影响。
将CD147-WT或CD147-K234R过表达细胞皮下注射裸鼠,测量肿瘤体积和重量,并用NMR分析肿瘤代谢物。
评估CD147-K234me2和KMT5A在NSCLC患者中的表达及预后价值。
对NSCLC组织芯片进行IHC染色,分析表达与临床病理参数的相关性及与总生存期的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 质谱分析 | LTQ质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫沉淀 | Pierce交联免疫沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26147 |
| 免疫共沉淀 | Pierce免疫共沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26149 |
| 蛋白质印迹 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| Gel Doc EZ成像系统 | BIO-RAD | -- | |
| Image Lab软件 | BIO-RAD | -- | |
| 免疫组织化学 | 通用SP试剂盒 | ZSGB-BIO | SP-9000 |
| 免疫荧光 | Dylight405标记的山羊抗小鼠IgG | KeyGEN | KGAB024 |
| Alexa Fluor 555标记的驴抗兔IgG | Thermo Fisher Scientific | A-31572 | |
| Alexa Fluor 488标记的驴抗小鼠IgG | Thermo Fisher Scientific | A-21202 | |
| 近连接技术 | Duolink原位红色试剂盒 | Sigma-Aldrich | DUO92101 |
| 表面等离子共振 | Biacore T200 | GE | -- |
| 体外甲基化实验 | UNC0379 | MedChemExpress | HY-12335 |
| 受体构建 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 代谢检测 | 葡萄糖测定试剂盒 | Jianchengbio | F006-1-1 |
| 乳酸脱氢酶测定试剂盒 | Jianchengbio | A020-1-2 | |
| 乳酸测定试剂盒 | Jianchengbio | A019-2-1 | |
| 核磁共振 | Bruker AV III 600 MHz核磁共振波谱仪 | Bruker | -- |
| Sonics VX-130超声破碎仪 | Sonics | -- | |
| 3 kDa超滤装置 | Millipore | -- | |
| DSS标准溶液 | Anachro | -- | |
| 5毫米核磁管 | Norell | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:RPMI 1640培养基,10%胎牛血清,1%青霉素/链霉素,2%L-谷氨酰胺,37°C,5%CO2 阅读提示:STAR Methods, Cell Lines |
| 质谱分析 | 组织处理和质谱参数:RIPA裂解,SDS-PAGE,胰酶消化,LTQ质谱仪,全扫描m/z 300-2000 阅读提示:STAR Methods, Mass Spectrometry Analysis |
| 体外甲基化实验 | 甲基化反应体系:CD147蛋白或K234肽段(1μg)与甲基转移酶(1μg)在甲基转移酶缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 8.5,100 mM NaCl,10 mM DTT,1 mM PMSF,20 μM SAM)中37°C孵育2-3小时;KMT5A抑制剂UNC0379作为阴性对照 阅读提示:STAR Methods, In Vitro Methyltransferase Assay |
| 代谢检测 | 葡萄糖摄取、LDH活性和乳酸输出的检测方法:使用相应的商业试剂盒(见方法部分),细胞培养24小时后测量 阅读提示:STAR Methods, Tests of Glucose Uptake, LDH Activity, and LD Export |
| 体内肿瘤模型 | 动物品系BALB/c裸鼠;注射细胞数1×10^7;肿瘤体积和重量测量方法;剔除2只H460组未成瘤小鼠 阅读提示:STAR Methods, Establishment of NSCLC Nude Mouse Model |
| 免疫组织化学 | IHC评分标准:基于阳性细胞强度和密度,评分0-3,总分为两者之和,0-1为“–”,2-3为“+”,4-5为“++”,6为“+++”;低表达组包括“–”和“+”,高表达组包括“++”和“+++” 阅读提示:STAR Methods, Immunohistochemistry Analysis |