COVID-19病理生理学中的N-聚糖修饰:体外结构改变但功能效应有限

N-Glycan Modification in Covid-19 Pathophysiology: In vitro Structural Changes with Limited Functional Effects.

作者信息Cristiane J Nunes-Santos, Hye Sun Kuehn, Sergio D Rosenzweig
PMID33245474
发布时间2021-02
DOI10.1007/s10875-020-00905-4

实验完整度

实验包括细胞转染、糖基化分析、免疫沉淀、细胞融合和细胞因子检测,但主要采用过表达系统,未进行活病毒实验,且功能结果多为阴性。

主要模型

HEK293T细胞过表达SARS-CoV-2 S和ACE2 NIH3T3细胞共培养融合模型 MOGS缺陷患者原代成纤维细胞 正常人外周血单个核细胞

重点核对

表达质粒:pCMV3-2019-nCoV-Spike (S1+S2)-long-HA (Cat. VG40589-CY)和pCMV3-ACE2-Flag (Cat. HG10108-CF) 转染试剂:Effectene® Transfection Reagent (Qiagen) 药物处理:miglustat 1 mM或castanospermine 1 mM处理24小时 细胞融合实验:NIH3T3细胞共培养,1:1比例,miglustat处理维持 细胞因子检测:PBMC(100,000细胞/100 μl)预处理miglustat 1 mM 24小时,再刺激5 μg SARS-CoV-2 S蛋白24小时

摘要

2014年,我们报道了两名患有罕见的先天性糖基化障碍的兄弟姐妹,该病由甘露糖寡糖葡萄糖苷酶(MOGS)基因突变引起。该疾病导致的聚糖改变在体外对某些包膜、N-糖基化依赖性病毒(如流感和HIV)产生感染抵抗力。作为全球寻找安全有效的COVID-19抗病毒疗法努力的一部分,我们评估了FDA批准的α-葡萄糖苷酶抑制剂米格鲁特对SARS-CoV-2的体外活性。测试了编码SARS-CoV-2刺突蛋白(S)和人ACE2糖蛋白(GP)的表达质粒,以评估α-葡萄糖苷酶抑制诱导的N-聚糖修饰。使用免疫沉淀评估这两种GP之间的结合。通过免疫荧光检测SARS-CoV-2 S和表达ACE2的细胞共培养的细胞间融合。通过测量暴露于纯化的SARS-CoV-2 S的PBMC释放的细胞因子来测试米格鲁特对免疫反应的影响。在我们的过表达系统中,米格鲁特成功且特异性地修饰了SARS-CoV-2 S及其主要受体ACE2的N-聚糖。这两种GP之间的结合不受聚糖修饰的影响。作为病毒细胞病变效应的替代标志物,即受体依赖性SARS-CoV-2 S驱动的细胞间融合,未因米格鲁特处理而中断。这一观察结果在MOGS缺失的转染细胞中得到了进一步证实。米格鲁特对SARS-CoV-2 S糖蛋白刺激PBMC后细胞因子的产生没有统计学显著影响。我们的工作表明,尽管在米格鲁特存在下N-聚糖发生明显改变,所研究的COVID-19相关糖蛋白的功能未受影响,使得米格鲁特不太可能改变疾病的自然病程。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
抑制α-葡萄糖苷酶(miglustat)能否通过修饰SARS-CoV-2 S和ACE2的N-糖基化来影响其功能,从而改变COVID-19病理生理过程?
核心机制
研究发现miglustat能够特异性修饰SARS-CoV-2 S和ACE2的N-糖基化,但未证实这种修饰影响病毒与受体的结合、膜融合或免疫应答,因此未确立其作为抗病毒药物的机制。
主要证据
过表达系统中Western blot检测N-糖基化改变;免疫沉淀显示结合不受影响;细胞融合实验显示合胞体形成未减少;PBMC细胞因子释放无显著变化;MOGS缺失细胞融合能力与正常对照无差异。
研究意义
作者认为虽然结果显示miglustat不太可能改变COVID-19自然病程,但阴性数据对当前疫情下基于科学证据的决策具有重要价值,并提示需进一步研究其他抗病毒策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

表达SARS-CoV-2 S和ACE2并验证N-糖基化模式

验证过表达系统中SARS-CoV-2 S和ACE2是否具有N-糖基化修饰,并建立后续实验的基础。

在HEK293T细胞中转染编码SARS-CoV-2 S和ACE2的质粒,收集细胞裂解液,用PNGase F或Endo H处理,通过Western blot检测蛋白迁移模式。

2

评估miglustat对N-糖基化模式的影响

确定miglustat能否特异性地修饰SARS-CoV-2 S和ACE2的N-糖基化。

转染后24小时,用miglustat(1 mM)或castanospermine(1 mM)处理,或用eliglustat(10 μM)作为对照,再孵育24小时,收集裂解液,部分样品用PNGase F消化,Western blot检测蛋白迁移变化。

3

检测SARS-CoV-2 S与ACE2的结合

检验N-糖基化修饰是否影响SARS-CoV-2 S与ACE2的结合。

在HEK293T细胞中单独表达ACE2或共表达ACE2和S,并用miglustat或castanospermine处理,然后进行免疫沉淀(用抗Flag抗体)和Western blot检测共沉淀的S蛋白。

4

测试结合亲和力(SDS梯度)

评估miglustat引起的N-糖基化修饰是否改变S与ACE2的结合亲和力/亲合力。

在共转染ACE2和S的HEK293T细胞中,用miglustat处理,裂解后加入不同浓度的SDS,进行免疫沉淀,比较不同洗涤条件下的结合情况。

5

细胞间融合实验

验证N-糖基化修饰是否影响SARS-CoV-2 S介导的膜融合能力。

将表达S或ACE2的NIH3T3细胞按1:1比例共培养,或在MOGS缺陷患者成纤维细胞中重复实验,用免疫荧光检测多核巨细胞(合胞体)的形成。

6

细胞因子释放分析

评估miglustat是否影响SARS-CoV-2 S蛋白诱导的免疫反应。

从健康供体分离PBMC,用miglustat预处理24小时,再暴露于纯化的SARS-CoV-2 S蛋白24小时,收集上清,通过Luminex检测细胞因子。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM(杜氏改良Eagle培养基)Gibco--
胎牛血清Gibco--
L-谷氨酰胺Gibco--
青霉素-链霉素Gibco--
Ficoll-Paque PlusGE Healthcare--
Effectene转染试剂Qiagen--
pCMV3-2019-nCoV-Spike (S1+S2)-long-HASino BiologicalVG40589-CY
pCMV3-ACE2-FlagSino BiologicalHG10108-CF
米格鲁特(N-丁基脱氧野尻霉素)Emergent BioSolutions--
栗树精胺Santa Cruz Biotechnologysc-201358
依利格鲁特SelleckchemS7852
PNGase FNew England BiolabsP0704
Endo HNew England BiolabsP0702
Halt蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物SigmaPPC1010
蛋白A/G琼脂糖珠Pierce--
NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris蛋白凝胶Life Technology--
Trans-Blot Turbo转印系统Bio-Rad--
C-Digit扫描仪Li-Cor--
Image Studio软件Li-Cor--
SARS-CoV-2 S糖蛋白抗体GeneTexGTX632604
ACE2抗体Cell Signaling TechnologyCST 4355
抗FLAG抗体Cell Signaling TechnologyCST 14793
抗β肌动蛋白抗体Cell Signaling TechnologyCST 4970
HRP标记的二抗Jackson ImmunoResearch111-035-003 or 115-035-003
Amaxa人皮肤成纤维细胞Nucleofector试剂盒Lonza--
DAPICell Signaling Technology4083S
Alexa Fluor 488偶联二抗InvitrogenA-11001
Alexa Fluor 594偶联二抗InvitrogenA-11072
ZOE荧光细胞成像仪Bio-Rad--
人XL细胞因子Luminex性能检测板R&D Systems--
Luminex 200系统Luminex Corporation--
GraphPad Prism 8.3.0GraphPad--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养和转染
细胞系(HEK293T, NIH3T3, 原代成纤维细胞)、转染试剂(Effectene)和质粒(pCMV3-2019-nCoV-Spike, pCMV3-ACE2-Flag)的用量和比例
阅读提示:Methods: Cell Culture, Expression Plasmids and Purified Protein
药物处理
miglustat浓度(1 mM)和处理持续时间(24小时);castanospermine浓度(1 mM);eliglustat浓度(10 μM)
阅读提示:Results: Miglustat Modified the N-Glycosylation Pattern...
糖基化分析
PNGase F和Endo H的用量、消化时间(1小时)及温度(37°C)
阅读提示:Methods: Enzymatic Digestion
免疫沉淀
IP抗体(抗FLAG)、蛋白A/G琼脂糖珠、孵育时间和温度(2-4小时4°C)
阅读提示:Methods: Western Blotting and Immunoprecipitation
细胞间融合实验
共培养细胞比例(1:1)、密度(4x10^4/12孔板)、处理时间(24小时+48小时)及转染效率(20-30%)
阅读提示:Methods: Cell-Cell Fusion Assay
细胞因子检测
PBMC数量(100,000/100 μl)、miglustat预处理时间(24小时)、S蛋白刺激浓度(5 μg)和持续时间(24小时)
阅读提示:Methods: Cytokine Analysis