表达SARS-CoV-2 S和ACE2并验证N-糖基化模式
验证过表达系统中SARS-CoV-2 S和ACE2是否具有N-糖基化修饰,并建立后续实验的基础。
在HEK293T细胞中转染编码SARS-CoV-2 S和ACE2的质粒,收集细胞裂解液,用PNGase F或Endo H处理,通过Western blot检测蛋白迁移模式。
N-Glycan Modification in Covid-19 Pathophysiology: In vitro Structural Changes with Limited Functional Effects.
实验包括细胞转染、糖基化分析、免疫沉淀、细胞融合和细胞因子检测,但主要采用过表达系统,未进行活病毒实验,且功能结果多为阴性。
HEK293T细胞过表达SARS-CoV-2 S和ACE2 NIH3T3细胞共培养融合模型 MOGS缺陷患者原代成纤维细胞 正常人外周血单个核细胞
表达质粒:pCMV3-2019-nCoV-Spike (S1+S2)-long-HA (Cat. VG40589-CY)和pCMV3-ACE2-Flag (Cat. HG10108-CF) 转染试剂:Effectene® Transfection Reagent (Qiagen) 药物处理:miglustat 1 mM或castanospermine 1 mM处理24小时 细胞融合实验:NIH3T3细胞共培养,1:1比例,miglustat处理维持 细胞因子检测:PBMC(100,000细胞/100 μl)预处理miglustat 1 mM 24小时,再刺激5 μg SARS-CoV-2 S蛋白24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证过表达系统中SARS-CoV-2 S和ACE2是否具有N-糖基化修饰,并建立后续实验的基础。
在HEK293T细胞中转染编码SARS-CoV-2 S和ACE2的质粒,收集细胞裂解液,用PNGase F或Endo H处理,通过Western blot检测蛋白迁移模式。
确定miglustat能否特异性地修饰SARS-CoV-2 S和ACE2的N-糖基化。
转染后24小时,用miglustat(1 mM)或castanospermine(1 mM)处理,或用eliglustat(10 μM)作为对照,再孵育24小时,收集裂解液,部分样品用PNGase F消化,Western blot检测蛋白迁移变化。
检验N-糖基化修饰是否影响SARS-CoV-2 S与ACE2的结合。
在HEK293T细胞中单独表达ACE2或共表达ACE2和S,并用miglustat或castanospermine处理,然后进行免疫沉淀(用抗Flag抗体)和Western blot检测共沉淀的S蛋白。
评估miglustat引起的N-糖基化修饰是否改变S与ACE2的结合亲和力/亲合力。
在共转染ACE2和S的HEK293T细胞中,用miglustat处理,裂解后加入不同浓度的SDS,进行免疫沉淀,比较不同洗涤条件下的结合情况。
验证N-糖基化修饰是否影响SARS-CoV-2 S介导的膜融合能力。
将表达S或ACE2的NIH3T3细胞按1:1比例共培养,或在MOGS缺陷患者成纤维细胞中重复实验,用免疫荧光检测多核巨细胞(合胞体)的形成。
评估miglustat是否影响SARS-CoV-2 S蛋白诱导的免疫反应。
从健康供体分离PBMC,用miglustat预处理24小时,再暴露于纯化的SARS-CoV-2 S蛋白24小时,收集上清,通过Luminex检测细胞因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM(杜氏改良Eagle培养基) | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| PBMC分离 | Ficoll-Paque Plus | GE Healthcare | -- |
| 转染 | Effectene转染试剂 | Qiagen | -- |
| pCMV3-2019-nCoV-Spike (S1+S2)-long-HA | Sino Biological | VG40589-CY | |
| pCMV3-ACE2-Flag | Sino Biological | HG10108-CF | |
| 药物处理 | 米格鲁特(N-丁基脱氧野尻霉素) | Emergent BioSolutions | -- |
| 栗树精胺 | Santa Cruz Biotechnology | sc-201358 | |
| 依利格鲁特 | Selleckchem | S7852 | |
| 糖基化分析 | PNGase F | New England Biolabs | P0704 |
| Endo H | New England Biolabs | P0702 | |
| 蛋白裂解 | Halt蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma | PPC1010 |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Pierce | -- |
| Western blot | NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris蛋白凝胶 | Life Technology | -- |
| Trans-Blot Turbo转印系统 | Bio-Rad | -- | |
| C-Digit扫描仪 | Li-Cor | -- | |
| Image Studio软件 | Li-Cor | -- | |
| SARS-CoV-2 S糖蛋白抗体 | GeneTex | GTX632604 | |
| ACE2抗体 | Cell Signaling Technology | CST 4355 | |
| Western blot/IP | 抗FLAG抗体 | Cell Signaling Technology | CST 14793 |
| Western blot | 抗β肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | CST 4970 |
| HRP标记的二抗 | Jackson ImmunoResearch | 111-035-003 or 115-035-003 | |
| 细胞融合实验 | Amaxa人皮肤成纤维细胞Nucleofector试剂盒 | Lonza | -- |
| DAPI | Cell Signaling Technology | 4083S | |
| Alexa Fluor 488偶联二抗 | Invitrogen | A-11001 | |
| Alexa Fluor 594偶联二抗 | Invitrogen | A-11072 | |
| ZOE荧光细胞成像仪 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞因子检测 | 人XL细胞因子Luminex性能检测板 | R&D Systems | -- |
| Luminex 200系统 | Luminex Corporation | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.3.0 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和转染 | 细胞系(HEK293T, NIH3T3, 原代成纤维细胞)、转染试剂(Effectene)和质粒(pCMV3-2019-nCoV-Spike, pCMV3-ACE2-Flag)的用量和比例 阅读提示:Methods: Cell Culture, Expression Plasmids and Purified Protein |
| 药物处理 | miglustat浓度(1 mM)和处理持续时间(24小时);castanospermine浓度(1 mM);eliglustat浓度(10 μM) 阅读提示:Results: Miglustat Modified the N-Glycosylation Pattern... |
| 糖基化分析 | PNGase F和Endo H的用量、消化时间(1小时)及温度(37°C) 阅读提示:Methods: Enzymatic Digestion |
| 免疫沉淀 | IP抗体(抗FLAG)、蛋白A/G琼脂糖珠、孵育时间和温度(2-4小时4°C) 阅读提示:Methods: Western Blotting and Immunoprecipitation |
| 细胞间融合实验 | 共培养细胞比例(1:1)、密度(4x10^4/12孔板)、处理时间(24小时+48小时)及转染效率(20-30%) 阅读提示:Methods: Cell-Cell Fusion Assay |
| 细胞因子检测 | PBMC数量(100,000/100 μl)、miglustat预处理时间(24小时)、S蛋白刺激浓度(5 μg)和持续时间(24小时) 阅读提示:Methods: Cytokine Analysis |