SARS-2-S与胆固醇和HDL的结合分析
验证SARS-2-S是否具有胆固醇结合能力及其与HDL的相互作用。
通过MST、SPR和肽-胆固醇结合实验,检测SARS-2-S蛋白与胆固醇、HDL的结合,并定位结合位点。
HDL-scavenger receptor B type 1 facilitates SARS-CoV-2 entry
实验包括分子结合(MST、SPR、多肽结合)、细胞感染(假病毒与活病毒)、基因敲低/过表达、药理抑制及组织免疫组化多个层级,并包含功能与机制验证。
Huh-7细胞 Vero E6细胞 293T细胞 Hepa 1-6细胞
HDL浓度(0.1% FBS作为对照,HDL 1-12 μg/ml) SR-B1表达水平(siRNA敲低或过表达) ACE2共表达 SR-B1抑制剂(ITX 5061和BLT-1)使用的浓度(25 μM) 感染时间点(如3小时和24小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SARS-2-S是否具有胆固醇结合能力及其与HDL的相互作用。
通过MST、SPR和肽-胆固醇结合实验,检测SARS-2-S蛋白与胆固醇、HDL的结合,并定位结合位点。
检测HDL是否增强SARS-CoV-2的细胞进入和感染。
用假病毒和活病毒感染Huh-7细胞,在含HDL或对照条件下检测进入效率和病毒复制。
验证SR-B1是否参与SARS-CoV-2的进入。
通过过表达或siRNA敲低SR-B1,检测假病毒和活病毒感染的变化。
确定SR-B1和ACE2共表达是否增强细胞对SARS-CoV-2的易感性。
在293T、Hepa 1-6和MDCK细胞中共转染ACE2和SR-B1,评估假病毒感染。
探索SR-B1是否通过增强病毒附着和进入来发挥作用。
通过免疫染色和流式细胞术检测SR-B1与病毒粒子的共定位及附着,并通过抑制剂实验验证。
检查SR-B1和ACE2在人体组织中的共表达情况。
使用免疫组化对正常人体器官组织芯片进行染色,检测SR-B1和ACE2的表达与定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白表达与纯化 | SARS-2-S蛋白 | Acro Biosystems | SPN-C52H9 |
| SARS-2-S1蛋白 | Acro Biosystems | S1N-C52H3 | |
| SARS-2-S2蛋白 | Acro Biosystems | S2N-C52H5 | |
| SARS-2-RBD蛋白 | Acro Biosystems | SPD-C52H3 | |
| 药物处理 | ITX 5061 | MedChemExpress | HY-19900 |
| BLT-1 | Sigma-Aldrich | SML0059 | |
| 脂质结合实验 | 胆固醇 | Sigma-Aldrich | C8667 |
| 菜油甾醇 | Sigma-Aldrich | C5157 | |
| 表胆固醇 | Sigma-Aldrich | R207349 | |
| 细胞培养 | DMEM(高糖) | Sigma-Aldrich | D5796 |
| 人血清 | Gibco | A3969001 | |
| 胎牛血清 | Gibco | A3160901 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | 11668-027 |
| 免疫组织化学 | 人正常器官组织芯片 | Biomax | MNO661 |
| MST | Monolith His-Tag标记试剂盒 | NanoTemper Technologies | MO-L018 |
| NT-647染料 | NanoTemper Technologies | MO-L008 | |
| 标准玻璃毛细管 | NanoTemper Technologies | MO-K022 | |
| SPR | OpenSPR-XT系统 | Nicoya Lifesciences | -- |
| NTA传感器 | Nicoya Lifesciences | SEN-AU-100-3-NTA | |
| Western blot | 抗Flag抗体 | Sigma-Aldrich | A8592 |
| 抗HA抗体 | Sigma-Aldrich | H9658 | |
| 抗SR-B1抗体 | Abcam | ab217318 | |
| 抗ACE2抗体 | Abcam | ab108252 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T9026 | |
| 免疫组化 | ACE2抗体 | Abcam | ab108252 |
| SR-B1抗体 | Abcam | ab217318 | |
| 流式 | 流式用ACE2抗体 | Proteintech | 21115-1-AP |
| PE抗His抗体 | BioLegend | 362603 | |
| 流式用SR-B1抗体 | BioLegend | 363208 | |
| 共聚焦 | SARS-2-S单克隆抗体 | GeneTex | GTX632604 |
| SARS-2-S1抗体 | Sino Biological | 40150-T62-COV2 | |
| 免疫沉淀 | Flag-SARS-2-S | -- | -- |
| 细胞培养 | Huh-7细胞系 | JCRB | 0403 |
| HeLa-hACE2细胞系 | Beijing Vitalstar Biotechnology | 012 | |
| 293T细胞系 | ATCC | CRL-3216 | |
| Vero E6细胞系 | ATCC | CRL-1568 | |
| MDCK细胞系 | ATCC | CCL-34 | |
| Hepa 1-6细胞系 | ATCC | CRL-1830 | |
| 荧光测量 | Cary Eclipse荧光分光光度计 | Agilent Technologies | -- |
| Western blot | Tanon 5200化学发光成像系统 | Tanon | -- |
| RT-qPCR | 病毒RNA提取试剂盒 | Qiagen | 52906 |
| 一步法PrimeScript RT-PCR试剂盒 | Takara | -- | |
| Applied Biosystems 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式 | Invitrogen Attune NxT声波聚焦流式细胞仪 | Invitrogen | -- |
| 病毒检测 | SARS-CoV-2毒株 | -- | BetaCoV/Beijing/IME-BJ01/2020 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 分子结合实验 | SARS-2-S蛋白浓度、HDL浓度、胆固醇浓度、缓冲液成分(如Fos-choline 13浓度) 阅读提示:Methods部分中的MST、SPR和肽结合实验小节 |
| 病毒感染实验 | 细胞系(Huh-7)、HDL浓度、感染时间、MOI、检测时间点(3h/24h)、RT-qPCR引物和探针序列 阅读提示:Methods部分中的感染实验和RT-qPCR小节,以及图例 |
| SR-B1功能和抑制实验 | siRNA序列、转染试剂、ITX 5061和BLT-1浓度、预孵育时间 阅读提示:Methods部分中的细胞培养和转染、感染实验、化合物处理,以及图例 |
| 组织表达分析 | 组织芯片类型、抗体稀释度、抗原修复条件 阅读提示:Methods部分中的免疫组化小节 |