重组CBG的生产和表征
获得用于SPR实验的生物素化重组人CBG,并验证其结构和功能与天然CBG相似。
从商业来源购买HEK293细胞表达的生物素化重组人CBG,并通过SDS-PAGE、Western blot和N-聚糖分析进行表征。
Pyrexia and acidosis act independently of neutrophil elastase reactive center loop cleavage to effect cortisol release from corticosteroid-binding globulin.
包含SPR结合实验、抗体结合实验、分子动力学模拟及糖基化分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证。
重组人CBG(HEK293细胞表达,生物素化) 天然人CBG(来自健康供体血浆) 人中性粒细胞弹性蛋白酶处理CBG模型
CBG类型:重组人CBG(HEK293表达,生物素化) NE处理:0.5 U/ml,25°C,1800秒 温度条件:25°C、37°C、39°C pH条件:7.4和7.0 配体浓度范围:6000–8.2 nM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得用于SPR实验的生物素化重组人CBG,并验证其结构和功能与天然CBG相似。
从商业来源购买HEK293细胞表达的生物素化重组人CBG,并通过SDS-PAGE、Western blot和N-聚糖分析进行表征。
建立SPR方法以测定CBG与类固醇的结合常数,并验证其可靠性。
将生物素化CBG固定在链霉亲和素包被的CM5芯片上,用NE处理一个流动池生成laCBG,验证装载和切割效率。
测定19种类固醇与haCBG和laCBG在不同温度和pH下的结合亲和力。
使用SPR进行结合实验,类固醇浓度系列稀释,在不同温度(25、37、39°C)和pH(7.4、7.0)下测定KD值。
检测不同温度和pH下RCL的免疫反应性。
使用9G12和polyclonal抗体进行SPR抗体结合实验,分析RCL表位是否暴露。
研究温度对CBG结构的影响,特别是配体结合位点的动态变化。
使用CBG-孕酮复合物结构(PDB 4BB2),在310K和313K下进行60ns的MD模拟,分析RMSF等。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白捕获 | 链霉亲和素 | GE Healthcare | -- |
| CM5传感芯片 | GE Healthcare | -- | |
| NE处理 | 人中性粒细胞弹性蛋白酶 | Sigma Aldrich | E8140 |
| N-糖基化分析 | PNGase F | Promega | -- |
| SPR实验 | Biacore S200 | GE Healthcare | -- |
| 蛋白质印迹 | ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- |
| Clarity ECL底物 | Bio-Rad | -- | |
| 链霉亲和素-Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | S11223 | |
| N-糖基化分析 | 二硫苏糖醇 | Sigma-Aldrich | -- |
| PVDF膜 | Merck-Millipore | -- | |
| AG 50W X8阳离子交换树脂 | Bio-Rad | -- | |
| LTQ Velos Pro离子阱质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| Dionex Ultimate-3000高效液相色谱 | Dionex | -- | |
| SPR配体结合实验 | 氢化可的松 | Sigma Aldrich | -- |
| 皮质酮 | Sigma Aldrich | -- | |
| 泼尼松龙 | Sigma Aldrich | -- | |
| 11-脱氧皮质醇 | Sigma Aldrich | -- | |
| 17-羟孕酮 | Sigma Aldrich | -- | |
| 孕酮 | Sigma Aldrich | -- | |
| 可的松 | Sigma Aldrich | -- | |
| 睾酮 | Sigma Aldrich | -- | |
| 醛固酮 | Sigma Aldrich | -- | |
| 别孕烯醇酮 | Med Chem Express | -- | |
| 抗体结合实验 | 9G12抗体 | -- | RRID:AB_26632405 |
| 多克隆抗CBG抗体 | -- | -- | |
| 抗小鼠IgG2a-HRP | -- | -- | |
| 抗兔IgG-HRP | -- | -- | |
| 分子动力学模拟 | CHARMM36力场 | -- | -- |
| NAMD 2.13 | -- | -- | |
| VMD | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SPR配体结合实验 | CBG类型(重组或天然),缓冲液组成,温度,pH值,配体浓度范围,数据的重复次数 阅读提示:参见Methods 3.4和3.5,以及Table 1和Table 2的注释 |
| NE处理 | NE浓度,处理时间,温度,流速 阅读提示:参见Methods 3.4 |
| 抗体结合实验 | 抗体类型(9G12和polyclonal),浓度,接触时间,解离时间,再生条件 阅读提示:参见Methods 3.6和Table 3 |
| 分子动力学模拟 | PDB结构,力场,温度,模拟时间,离子浓度 阅读提示:参见Methods 3.7 |