WTAP表达分析
评估WTAP在FSGS中的表达情况。
利用Nephroseq数据库、免疫组化、免疫荧光和Western blot检测FSGS患者及ADR小鼠/细胞中WTAP的表达。
WTAP Deficiency Promotes Podocyte PANoptosis and FSGS via SPP1 Signaling
研究包含患者样本、细胞实验、两种基因敲除小鼠模型及功能验证,并利用单细胞测序进行机制探索。
人足细胞系(HPC) ADR诱导的FSGS小鼠模型(BALB/c) 足细胞特异性Wtap敲除小鼠(cKO和iKO) FSGS患者肾活检样本
WTAP在足细胞中的表达水平(患者及小鼠) Wtap敲除小鼠模型的构建及表型验证 SPP1中和抗体的给药方案(剂量、频率) 单细胞RNA测序分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估WTAP在FSGS中的表达情况。
利用Nephroseq数据库、免疫组化、免疫荧光和Western blot检测FSGS患者及ADR小鼠/细胞中WTAP的表达。
探究足细胞中WTAP缺失对肾脏的影响。
利用Nphs2-Cre和Cre-ERT2系统构建组成性(cKO)和诱导性(iKO)足细胞特异性Wtap基因敲除小鼠,并评估其生存率、体重、肾功能和肾脏病理。
确定WTAP缺失是否导致足细胞损伤和PANoptosis。
通过免疫荧光、透射电镜、Western blot和YO-PRO-1/PI染色评估足细胞数量、超微结构、损伤标志物及PANoptosis标志物。
验证WTAP过表达能否改善足细胞损伤和FSGS。
在体外使用AAV9-WTAP转染HPC,在体内通过尾静脉注射AAV9-WTAP,然后用ADR诱导FSGS,评估肾脏损伤指标。
阐明WTAP调节SPP1表达的分子机制。
通过单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、dot blot、meRIP-seq和meRIP-qPCR分析WTAP-KO HPC中SPP1的表达和m6A修饰水平,并用ActD处理检测mRNA稳定性。
分析SPP1在cKO小鼠肾脏中介导的细胞间通讯。
利用单细胞测序数据进行细胞亚型分析、KEGG通路分析和CellChat细胞通讯分析,并用免疫组化和ELISA验证SPP1表达。
评估抑制SPP1对FSGS的治疗效果。
给予cKO小鼠和ADR诱导FSGS小鼠SPP1中和抗体,评估肾功能、病理和足细胞损伤指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| WTAP表达分析 | FSGS患者样本数量及临床特征;ADR处理浓度和时间 阅读提示:Results部分及图1、图S1、表S1 |
| Wtap基因敲除小鼠模型 | Cre-loxP系统构建的具体方案;cKO和iKO小鼠的基因型确认;他莫昔芬给药方案 阅读提示:Methods部分及图S3、图S4 |
| 足细胞损伤与PANoptosis分析 | 用于检测PANoptosis的标志物抗体信息;电镜样本制备方法 阅读提示:Results部分及图3、图S6 |
| WTAP过表达实验 | AAV9-WTAP的构建和注射剂量;ADR诱导剂量和时间 阅读提示:Methods部分及图4 |
| 机制研究 | meRIP-seq和meRIP-qPCR的具体实验步骤;ActD处理的浓度和时间 阅读提示:Results部分及图5、图S7 |
| SPP1中和抗体治疗 | SPP1中和抗体的给药剂量、频率和途径;cKO和ADR小鼠模型的给药时间点 阅读提示:Methods部分及图8 |