细胞毒性评估
评估邻甲苯胺及其代谢物对T24细胞的细胞毒性,并确定IC50值。
使用MTT法检测T24细胞经不同浓度(20-1000 µM)化合物处理24小时后的细胞活力,计算IC50值。
o-Toluidine and its metabolites induce oxidative and nitrative DNA damage in human urinary bladder epithelial cells
包含细胞活力、ROS/NO检测、免疫细胞化学、彗星实验、siRNA敲低和抗体阻断等多层级实验,并明确验证了HMGB1-RAGE-TLR9通路和NF-κB/iNOS机制。
T24人膀胱上皮癌细胞系 体外培养模型
T24细胞培养于含5% FBS和100 mg/l卡那霉素的MEM培养基中,处理浓度和时间需核实 4AC等化合物处理浓度(5-200 nM)和时间(1-4小时)需核实 MTT实验细胞接种密度3×10^4 cells/ml,处理浓度20-1000 µM,持续24小时 流式细胞术使用DHE和DAF-FM探针检测ROS和NO,处理浓度50 µM 免疫细胞化学和彗星实验的关键步骤:抗体浓度、Fpg处理、电泳条件等需对照原文Methods
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估邻甲苯胺及其代谢物对T24细胞的细胞毒性,并确定IC50值。
使用MTT法检测T24细胞经不同浓度(20-1000 µM)化合物处理24小时后的细胞活力,计算IC50值。
检测邻甲胺唑及其代谢物是否诱导T24细胞产生ROS和NO。
使用流式细胞术检测DHE(ROS探针)和DAF-FM(NO探针)的荧光强度,处理浓度50 µM,时间1和3小时。
检测邻甲苯胺及其代谢物是否诱导8-oxodG和8-nitroG形成。
通过免疫细胞化学检测8-oxodG和8-nitroG的染色强度;彗星实验检测DNA断裂。
验证HMGB1、RAGE和TLR9在4AC诱导的DNA损伤中的作用。
使用siRNA敲低HMGB1、RAGE和TLR9,以及抗HMGB1和抗RAGE抗体预处理,观察DNA损伤的变化。
观察4AC处理后HMGB1、RAGE与TLR9的共定位及表达变化。
通过双重免疫荧光染色检测HMGB1和TLR9、RAGE和TLR9的共定位,并通过Western blot检测蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化学处理 | 二甲基亚砜 | -- | -- |
| 细胞培养 | Eagle最低必需培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 卡那霉素 | Fujifilm Wako Pure Chemical Corporation | -- | |
| MTT实验 | MTT试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| Multiskan™ FC酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式细胞术 | 二氢乙锭 | Molecular Probes | -- |
| 4-氨基-5-甲基氨基-2',7'-二氟荧光素二乙酸酯 | Goryo Chemical | -- | |
| FACSCanto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 免疫细胞化学 | 抗8-oxodG抗体 | Japan Institute for the Control of Aging | -- |
| 抗8-硝基鸟嘌呤抗体 | 实验室自制 | -- | |
| Alexa 488标记抗小鼠IgG | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Alexa 594标记抗兔IgG | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Hoechst 33258 | Nacalai Tesque | -- | |
| 荧光显微镜BX53 | Olympus | -- | |
| ImageJ软件 | -- | -- | |
| 彗星实验 | 低熔点琼脂糖 | Nacalai Tesque | -- |
| 正常熔点琼脂糖 | Fujifilm Wako Pure Chemical Corporation | -- | |
| 甲酰胺嘧啶DNA糖基化酶 | New England Biolabs | -- | |
| 碘化丙啶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| WSE-1720 Submerge-Multi水平电泳系统 | ATTO | -- | |
| CASP软件 | -- | -- | |
| siRNA转染 | Silencer® Select siRNA | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Opti-MEM I培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | -- |
| BCA™蛋白质检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗HMGB1抗体 | Abcam | ab190377 | |
| 抗RAGE抗体 | Abcam | ab54741 | |
| 抗TLR9抗体 | Abcam | ab37154 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 辣根过氧化物酶标记抗小鼠IgG | Cell Signaling Technology | #7076 | |
| 辣根过氧化物酶标记抗兔IgG | Cell Signaling Technology | #7074 | |
| ECL™ Prime化学发光检测试剂 | Amersham™ | -- | |
| ImageQuant LAS 4000 mini生物分子成像仪 | Fujifilm | -- | |
| 抑制剂处理 | 1400 W | Sigma-Aldrich | -- |
| Bay 11-7082 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗体处理 | 抗HMGB1抗体 (ab79823) | Abcam | ab79823 |
| 抗RAGE抗体 (ab216329) | Abcam | ab216329 | |
| 兔单克隆IgG (ab172730) | Abcam | ab172730 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | T24细胞来源(RIKEN BioResource Center),培养基(MEM含5% FBS和100 mg/l卡那霉素),培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Materials and methods, Cell culture 部分 |
| 化学处理 | 化合物浓度(20-1000 µM),处理时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods, MTT assay 部分 |
| ROS/NO检测 | 处理浓度(50 µM),处理时间(1-3小时),探针浓度(DHE 2.5 µM, DAF-FM 2.5 µM) 阅读提示:Materials and methods, Measurement of ROS and NO by flow cytometry 部分 |
| DNA损伤检测 | 处理浓度(5-200 nM),处理时间(1-4小时),抗体浓度(anti-8-oxodG 2 µg/ml, anti-8-nitroG 1 µg/ml) 阅读提示:Materials and methods, Detection of DNA lesions by immunocytochemistry 部分 |
| 彗星实验 | 处理浓度(20 nM),处理时间(4小时),Fpg浓度(1:1000),电泳条件(25 V,20分钟) 阅读提示:Materials and methods, Comet assay 部分 |