microRNA-26b的缺失通过调控细胞特异性靶基因促进主动脉钙化

The loss of microRNA-26b promotes aortic calcification through the regulation of cell-specific target genes

作者信息Diana Luna Buitrago, Eva Jover, Eleonora Mameli, David Mellis, Ryszard Nosalski, Laura Charlton, Rosa Bauza Sanso, Hywel Dunn-Davies, Mark G MacAskill, Adriana A S Tavares, Alexander J Fletcher, Jennifer Nash, Natalia López-Andrés, Marc R Dweck, Patrick W F Hadoke, Derek S Gilchrist, Brad D Wagner, Michael L Robinson, Andrew H Baker, David E Newby, Tijana Mitić, Andrea Caporali
PMID40737220
发布时间2025-09-29
DOI10.1093/cvr/cvaf117

实验完整度

包含miR-26bKO小鼠模型及体外细胞实验、单细胞转录组学、网络分析、分子成像等多层级证据,并进行了功能验证和机制验证。

主要模型

miR-26b敲除小鼠(miR-26bKO) 人主动脉组织样本 小鼠原代主动脉平滑肌细胞(SMCs) 小鼠原代主动脉成纤维细胞(FBLs)

重点核对

miR-26bKO小鼠的构建及基因型验证(CRISPR/Cas9) 年龄(3或6个月)及性别对微钙化表型的影响 LDN-193189的给药剂量(3 mg/kg/天,腹腔注射,隔日一次,共14天) BMP4处理浓度及时间(用于SMCs刺激) 高通量测序数据的分析方法(如DEGseq2,CellChat)

摘要

目的:血管钙化是磷酸钙在血管内的异常沉积。这种情况与心血管疾病的发展显著相关,但其潜在机制在很大程度上仍然未知。MicroRNA(miRNA)可能通过调控特定细胞靶点的网络在启动血管钙化中起关键作用。在本研究中,我们首次探讨了microRNA-26b(miR-26b)在血管钙化中的潜在作用。方法和结果:使用micro-正电子发射断层扫描和计算机断层扫描(micro-PET/CT)成像与18F-氟化钠,我们测量了miR-26b敲除小鼠(miR-26bKO)的主动脉钙化。我们进行了bulk RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序和网络分析,以确定细胞特异性靶点和导致观察到的表型的细胞复杂性。此外,我们检查了主动脉瘤或瓣膜相关主动脉病患者的主动脉组织,以确定miR-26b及其靶点的表达水平如何与钙化相关。我们的发现表明,在主动脉钙化患者的主动脉组织中,miR-26b下调,而miR-26b表达与钙化水平呈负相关。同样,miR-26bKO小鼠出现了自发性的年龄相关性主动脉微钙化。结合单细胞转录组学与网络分析,我们识别并绘制了miR-26b的细胞类型特异性靶点和调控通路。此外,我们验证了平滑肌细胞(SMCs)中Smad1的细胞特异性表达,并表征了主动脉细胞间的细胞间通讯,揭示了骨形态发生蛋白(BMP)通路。微钙化的发展归因于成纤维细胞(FBLs)释放的Bmp4,导致miR-26bKO小鼠SMCs中Smad1磷酸化和钙积累。我们发现通过干扰细胞通讯可以药理学逆转主动脉微钙化。最后,我们证明了在钙化主动脉组织中miR-26b和SMAD1水平呈负相关。结论:miR-26b的缺失对于启动和促进主动脉钙化至关重要,为主动脉疾病揭示了新的治疗靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
miR-26b在血管钙化中的潜在作用及其细胞特异性机制是什么?
核心机制
miR-26b缺失导致主动脉平滑肌细胞中Smad1上调并磷酸化,该过程由成纤维细胞释放的Bmp4通过BMP信号通路驱动,促进平滑肌细胞钙积累,引发微钙化。
主要证据
miR-26bKO小鼠出现自发性年龄相关主动脉微钙化(微PET/CT、茜素红染色、钙定量);单细胞转录组学显示SMCs中Smad1上调,FBLs中Bmp4上调;体外实验证实FBL条件培养基或共培养可诱导SMCs钙化,LDN-193189抑制该过程;患者样本显示miR-26b与SMAD1呈负相关。
研究意义
miR-26b缺失是启动和促进主动脉钙化的关键因素,为主动脉疾病提供了新的治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

患者主动脉组织钙化分析

验证miR-26b表达与主动脉钙化的关联。

收集主动脉瘤或瓣膜相关主动脉病患者的主动脉组织,按钙化程度分组,进行组织学染色(茜素红、天狼星红/阿尔辛蓝)、miR-26b表达检测及相关性分析。

2

miR-26bKO小鼠模型建立及表型分析

确定miR-26b缺失对主动脉钙化的因果作用及其表型特征。

使用CRISPR/Cas9技术构建miR-26bKO小鼠,通过micro-PET/CT、组织学染色、钙定量、弹性纤维染色、压力肌动图及原子力显微镜等分析主动脉微钙化及血管力学特性。

3

单细胞转录组学和网络分析

识别miR-26b缺失引起的细胞类型特异性转录变化和潜在调控网络。

对6个月龄雄性WT和miR-26bKO小鼠主动脉细胞进行scRNA-seq,进行聚类、差异表达基因分析和通路富集;结合网络分析预测miR-26b靶基因和关键节点。

4

细胞特异性靶基因验证

验证miR-26b对靶基因Smad1的细胞特异性调控作用。

分离主动脉SMCs、FBLs和ECs,检测miR-26b-5p和Smad1的表达;通过免疫组化、Western blot验证Smad1磷酸化;使用荧光素酶报告基因、miRNA mimic/抑制剂及siRNA验证miR-26b对SMAD1的直接调控。

5

细胞间通讯分析

阐明BMP信号通路在主动脉细胞间通讯中的作用。

基于scRNA-seq数据使用CellChat推断BMP通路配体-受体相互作用,并通过ELISA、qPCR及BMP4刺激实验验证FBLs释放BMP4促进SMCs中Smad1磷酸化。

6

药理学干预实验

验证阻断BMP信号是否能逆转miR-26bKO小鼠的微钙化。

使用BMP受体抑制剂LDN-193189处理miR-26bKO SMCs和共培养体系,检测钙沉积、p-Smad1水平;并对6个月龄miR-26bKO小鼠给予LDN-193189(3mg/kg,隔日一次,腹腔注射,共14天),评估微钙化程度。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
茜素红----
天狼星红----
阿尔辛蓝----
Mediso PET/CT扫描仪Mediso--
PMOD 4.2版PMOD Technologies--
DMEM培养基Gibco--
DMEM/F12培养基Gibco--
胎牛血清----
胶原酶II----
弹性蛋白酶----
大豆胰蛋白酶抑制剂----
含钙镁的Hank's平衡盐溶液----
CD31抗体----
CD45抗体----
BD LSRFortessa流式细胞仪BD Biosciences--
FACS Aria II分选仪BD Biosciences--
Qiazol试剂QIAGEN--
miRNeasy小提试剂盒QIAGEN217004
iScript高级cDNA合成试剂盒Bio-Rad--
iQ SYBR Green SupermixBio-Rad--
CFX Connect实时荧光定量PCR系统Bio-Rad--
TaqMan microRNA对照检测U6 snRNAApplied Biosystems)
TaqMan microRNA检测miR-26b-5pApplied Biosystems)
TaqMan microRNA逆转录试剂盒Applied Biosystems--
TaqMan通用PCR预混液,无AmpErase UNGApplied Biosystems)
DAB染色Leica--
p-SMAD1/5抗体Invitrogen)
miRCURY LNA miRNA检测探针Qiagen--
杂交溶液AmsbioK2191050
RIPA裂解液----
蛋白酶抑制剂混合物Roche--
Pierce BCA蛋白测定试剂盒Thermo Fisher--
磷酸化SMAD1 (Ser463/465) (41D10)抗体CST9516
总SMAD1抗体Proteintech66559-1-Ig
β-actin抗体SigmaA5441
IRDye 680RD抗鼠IgG--926-68070
IRDye 800CW抗兔IgG--926-3221
Odyssey F成像系统LICORbio--
Empiria Studio软件LICORbio--
10x Genomics Chromium Next GEM单细胞3'试剂盒v3.110x Genomics--
10x Genomics CellPlex CMO寡核苷酸10x Genomics--
10x Genomics Chromium X仪器10x Genomics--
Illumina NextSeq 2000测序仪Illumina--
DNBSEQ测序系统BGI--
LDN-193189--1062368-24-4
BMP4重组蛋白----
SMAD1 siRNA----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
患者组织分析
患者分组标准(钙化程度低/中高),样本量(n=19低,n=16中/高),miR-26b表达检测方法
阅读提示:Methods 2.1和Results 3.1及图1图例
miR-26bKO小鼠表型
小鼠年龄(3和6个月),性别,微钙化检测方法(micro-PET/CT、茜素红染色、钙定量),样本量
阅读提示:Methods 2.2、2.5和Results 3.2及图2图例
单细胞转录组学
样本池(3条主动脉/样本),测序平台,细胞数量(n=5191),数据分析参数(MAC值0.5)
阅读提示:Methods 2.9和Results 3.3及图3图例
细胞特异性靶基因验证
细胞分离方法(酶消化、流式分选),抗体信息(p-Smad1, Smad1),高磷培养基浓度(2.6 mM)及处理时间(10天)
阅读提示:Methods 2.3、2.4、2.7和Results 3.4及图4图例
细胞间通讯分析
BMP4处理浓度和时间,ELISA检测方法,目标基因(Id3, Mfap4)
阅读提示:Methods 2.9和Results 3.5及图5图例
药理学干预
LDN-193189体外浓度(500 nM)和处理时间(30分钟、48小时、10天),体内剂量(3 mg/kg/天)和给药方案(隔日一次,共14天)
阅读提示:Methods 2.2和Results 3.6及图6图例