动物模型的建立与分组
建立CIP/Mdx dKO和Mdx/Utrn dKO小鼠模型,为评估setanaxib在肌营养不良心肌病中的作用提供实验平台。
使用CIP/Mdx dKO小鼠(3个月和5个月大)和Mdx/Utrn dKO小鼠(2-3个月大),分别设置setanaxib处理组和vehicle对照组。
Treatment with the Nox1/4 inhibitor Setanaxib ameliorates cardiac function in mouse models of Duchenne muscular dystrophy
包含CIP/Mdx dKO和Mdx/Utrn dKO两种动物模型,通过超声心动图、MRI、组织学、qPCR、Western blot和RNA-seq等多层级验证,明确功能验证和机制验证。
CIP/Mdx双敲除小鼠 Mdx/Utrn双敲除小鼠
setanaxib剂量:60 mg/kg/day,口服灌胃,持续20周(CIP/Mdx dKO)或12周(Mdx/Utrn dKO) 对照组:玉米油(corn oil)作为vehicle 主要检测指标:射血分数(EF)、缩短分数(FS)、心肌纤维化面积、心肌病标志物表达 转录组分析:RNA-seq识别差异表达基因,GSEA富集分析 统计方法:双尾t检验、双因素方差分析(two-way ANOVA)和Sidak事后检验,p < 0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立CIP/Mdx dKO和Mdx/Utrn dKO小鼠模型,为评估setanaxib在肌营养不良心肌病中的作用提供实验平台。
使用CIP/Mdx dKO小鼠(3个月和5个月大)和Mdx/Utrn dKO小鼠(2-3个月大),分别设置setanaxib处理组和vehicle对照组。
评估setanaxib对心脏收缩功能的保护作用。
通过超声心动图测量射血分数(EF)、缩短分数(FS)、左心室收缩末期内径(LVID;s)和容积(LV vol;s)等参数,并在CIP/Mdx dKO和Mdx/Utrn dKO小鼠中评估。
评估setanaxib对心肌纤维化的影响。
通过天狼星红/快绿染色和Masson三色染色检测心脏纤维化面积,并进行定量分析。
评估setanaxib对心肌病相关基因表达和氧化应激的影响。
通过qPCR检测Nox4、Nppb、Myh7、Mmp2等基因表达;通过Western blot检测Mmp2蛋白水平;通过免疫组化检测4-HNE水平。
揭示setanaxib对心脏转录组的影响,探索潜在分子机制。
对Mdx/Utrn dKO小鼠心室进行RNA-seq分析,识别差异表达基因,进行GSEA和DAVID功能富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | Setanaxib (GKT137831) | Selleckchem | -- |
| 药物对照组 | 玉米油 | Sigma-Aldrich | C8267 |
| 超声心动图 | Vevo 3100成像系统 | VisualSonics | -- |
| MicroScan换能器 (MS-550D) | -- | MS-550D | |
| 心脏MRI | 核磁共振扫描仪 | MR Solutions | -- |
| 组织学 | 倒置显微镜 (Bz X800) | Keyence | -- |
| 免疫组织化学 | 抗4-HNE抗体 | Thermo Fisher Scientific | BS-6313 R |
| qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| iScript高级cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| iTaq通用SYBR Green Supermix | Bio-Rad | 1725121 | |
| T100热循环仪 | Bio-Rad | -- | |
| CFX Opus 96实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| RNA-seq | Qubit RNA检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| NEBNext Ultra II方向性RNA文库制备试剂盒 | New England Biolabs | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| Micro BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Scientific | #23235 | |
| iBlot3蛋白印迹转移系统 | Thermo Scientific | #IB31001 | |
| 丽春红S染色液 | Thermo Scientific | #A40000279 | |
| Bio-Rad Chemidoc-MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| MMP2抗体 | Santa Cruz Biotechnologies | #sc-13595 | |
| Telethonin (Tcap)抗体 | Abcam | #ab133646 | |
| 山羊抗兔IgG (H+L) HRP偶联二抗 | Invitrogen | #65-6120 | |
| 山羊抗小鼠IgG (H+L) HRP偶联二抗 | Invitrogen | #62-6520 | |
| SuperSignal West Femto最大灵敏度底物 | Thermo Scientific | #34094 | |
| Licor Odyssey Fc成像仪 | LI-COR | -- | |
| Restore Western Blot剥离缓冲液 | Thermo Scientific | #21059X4 | |
| 线粒体DNA定量 | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系:CIP/Mdx dKO和Mdx/Utrn dKO;年龄和性别:CIP/Mdx dKO为3或5个月大雄性,Mdx/Utrn dKO为2-3个月大雄性;来源:CIP/Mdx dKO按文献9生成,Mdx (Strain #001801)和Utrn (Strain #013158)购自Jackson Laboratory。 阅读提示:Materials and Methods: 'Mice and treatments' |
| 药物处理 | setanaxib剂量:60 mg/kg/day;给药方式:口服灌胃;给药周期:CIP/Mdx dKO为20周(3个月大)或12周(5个月大),Mdx/Utrn dKO为12周;vehicle为玉米油。 阅读提示:Materials and Methods: 'Mice and treatments'; Figure legends 1A和2A |
| 超声心动图 | 使用Vevo 3100系统,40-MHz换能器;测量EF、FS、LVID、LV vol等参数;在基线和指定时间点测量;数据采集和由盲法操作者进行。 阅读提示:Materials and Methods: 'Echocardiography'; Table 1和2 |
| 心脏MRI | 使用MR Solutions扫描仪,Retrospective梯度回波cine序列;麻醉用异氟烷(1.0%-2.0%);体温维持36.5°C。 阅读提示:Materials and Methods: 'Cardiac MRI' |
| 纤维化定量 | 心脏横断面切片,5μm;染色:天狼星红/快绿和Masson三色;纤维化面积定量用ImageJ。 阅读提示:Materials and Methods: 'Histology'; Figure legends 1F-G和3C-D |