BCR敲入小鼠模型建立和验证
验证新建立的BCR敲入小鼠模型能够表达人源抗疟疾抗体前体BCR,并能识别PfCSP。
使用CRISPR/Cas9技术生成iGL_311、iGL_317、iGL_L9 BCR-KI小鼠,通过流式细胞术检测外周血B细胞与PfCSP结合,并通过测序确认BCR序列。
Overcoming immunogenic gaps in malaria subunit vaccines by broadening CSP regions targeted
研究包含BCR敲入小鼠模型、过继转移免疫实验、体内寄生虫攻击实验、单细胞BCR测序、BLI/ITC亲和力测定和cryo-EM结构解析等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
BCR敲入小鼠(iGL_311、iGL_317、iGL_L9、L9、iGL_CIS43) 过继转移模型(CD45.2 B细胞转移至CD45.1宿主小鼠) 转基因伯氏疟原虫(表达PfCSP和GFP-荧光素酶)感染模型
BCR敲入小鼠品系及过继转移的B细胞前体频率(5/10^5) 免疫原(截短PfCSP、全长PfCSP、Pep22-KLH、NPDP19-KLH)及剂量(10 μg/小鼠,腹腔注射) 免疫时间点(day 0 prim,day 28或day 58等分析时间点) 体内攻击实验使用2,000个转基因伯氏疟原虫子孢子,IV注射 抗体被动转移剂量(50 μg或25 μg)和挑战后42小时肝脏负荷检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证新建立的BCR敲入小鼠模型能够表达人源抗疟疾抗体前体BCR,并能识别PfCSP。
使用CRISPR/Cas9技术生成iGL_311、iGL_317、iGL_L9 BCR-KI小鼠,通过流式细胞术检测外周血B细胞与PfCSP结合,并通过测序确认BCR序列。
评估不同BCR敲入B细胞对R21表位(截短PfCSP)和全长PfCSP的免疫反应。
将CD45.2+ B细胞过继转移到CD45.1宿主小鼠,随后用截短PfCSP或全长PfCSP免疫,分析脾脏GC B细胞反应,并测量种系抗体与抗原的亲和力(BLI)。
确定能够有效激活次要重复表位特异性B细胞的免疫聚焦肽,并评估其诱导的GC反应和亲和力成熟。
比较不同NPNV重复数的KLH偶联肽(Pep21、Pep22、Pep22 long)对iGL_L9和成熟L9 B细胞的激活,通过流式细胞术追踪GC B细胞和抗体分泌细胞,并进行BCR测序和亲和力测定。
探究延长GC反应(如递增剂量和加强免疫)是否能促进高亲和力L9 B细胞的进一步亲和力成熟和广谱性。
采用递增剂量免疫和加强免疫策略,分析GC B细胞突变频率、亲和力(BLI)和对PfCSP变体的结合广度。
通过信息学筛选、体外亲和力测定和体内挑战实验,识别具有更高保护效力的L9变体抗体,并探究其结构基础。
对L9突变体进行序列特征分析,表达42个抗体,在转基因寄生虫挑战模型中评估其降低肝脏负担的能力,并进行BLI、ITC亲和力测定和cryo-EM结构解析。
验证将R21表位与免疫聚焦肽联合免疫是否能诱导平衡的抗体反应并增强体内保护。
将四种BCR敲入B细胞共转移,用全长PfCSP、截短PfCSP或截短PfCSP+肽免疫,分析GC组成、血清抗体滴度,并在4-5个月后加强免疫,进行寄生虫挑战评估保护。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养和转染 | Expi293细胞 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Turbo293转染试剂 | SPEED BioSystems | -- | |
| 抗体纯化 | 蛋白A柱 | GE Healthcare | -- |
| IgG洗脱缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| BCR测序 | SuperScript III逆转录酶 | Invitrogen | -- |
| HotStarTaq酶 | QIAGEN | -- | |
| E-Gels 96 2% 琼脂糖凝胶(含SYBR Safe) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 单细胞RNA测序 | Chromium Next GEM单细胞5'试剂盒v2 | 10x Genomics | -- |
| NextSeq 2000仪器 | Illumina | -- | |
| ELISA | AP偶联抗小鼠IgG抗体 | Jackson ImmunoResearch Labs | 115-055-003 |
| BioTek Synergy Neo2酶标仪 | Agilent | -- | |
| Bead assay | 蛋白A磁珠 | -- | -- |
| 大鼠IgG2c同型对照抗体 | BioLegend | 400701 | |
| 亲和力测量 | Octet Red384仪器 | FortéBio | -- |
| 链霉亲和素捕获生物传感器 | FortéBio | -- | |
| Cryo-EM | C-flat铜网 | Protochips | CF1.2/1.3-3Au |
| Vitrobot Mark IV | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Glacios透射电镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| K3直接电子探测器 | Gatan | -- | |
| 体内寄生虫挑战 | IVIS Spectrum活体成像系统 | Perkin Elmer | -- |
| 体内实验 | B6.SJL-Ptprca Pepcb/BoyJ CD45.1宿主小鼠 | The Jackson Laboratory | RRID:IMSR_JAX:002014 |
| 雌性C57Bl/6小鼠 | The Jackson Laboratories | RRID:IMSR_JAX:000664 | |
| 免疫原制备 | 铝羟基凝胶佐剂 | InvivoGen | -- |
| Pep22-KLH(KLH偶联的Pep22肽) | GenScript | -- | |
| NPDP19-KLH(KLH偶联的NPDP19肽) | GenScript | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| BCR敲入小鼠模型 | BCR敲入小鼠品系(iGL_311、iGL_317、iGL_L9、L9)的构建方法和基因序列 阅读提示:Materials and methods, 'BCR KI mouse model' |
| 过继转移和免疫 | B细胞前体频率(5/10^5)、免疫原(截短PfCSP、全长PfCSP、Pep22-KLH等)、剂量(10 μg)、佐剂(Alhydrogel)和免疫途径(腹腔注射) 阅读提示:Materials and methods, 'Adoptive transfer model and immunization' |
| 流式细胞术分析 | 探针浓度(50 nM)、抗体稀释比例、染色时间和温度 阅读提示:Materials and methods, 'Flow cytometry' |
| BCR测序 | PCR引物、Sanger测序和单细胞RNA测序的实验细节 阅读提示:Materials and methods, 'BCR sequencing' |
| 抗体表达和纯化 | 表达载体(VRC8400)、细胞系(Expi293)、转染试剂(Turbo293)、纯化方法(Protein A) 阅读提示:Materials and methods, 'Ab expression and purification' |
| 亲和力测量 | BLI实验条件(传感器、抗原浓度、结合/解离时间)、ITC实验条件 阅读提示:Materials and methods, 'Affinity measurements by BLI' 和 Figure S4C |
| 体内寄生虫挑战 | 挑战寄生虫数量(2,000 SPZ)、被动转移抗体剂量(50 μg或25 μg)、挑战后分析时间(42小时) 阅读提示:Materials and methods, 'Reduction in liver infection assay' |