蛋白质组学分析
识别AD患者突触体中失调的通路和关键蛋白
对AD患者和对照者的颞叶皮质突触体进行无标记定量蛋白质组学分析,发现TALDO1显著下调
Transaldolase 1 contributes to pentose phosphate pathway disruption and synaptic dysfunction in Alzheimer's disease
包含人类样本蛋白质组学、细胞模型、小鼠模型、代谢组学、功能和行为学验证。
原代皮层神经元 HT22细胞 5×FAD小鼠 WT小鼠
AD患者和对照者颞叶皮质突触体样本的蛋白质组学分析 原代神经元中Taldo1敲低及恢复 HT22细胞中Taldo1敲低 5×FAD小鼠中神经元TALDO1恢复 WT小鼠中神经元Taldo1敲低
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别AD患者突触体中失调的通路和关键蛋白
对AD患者和对照者的颞叶皮质突触体进行无标记定量蛋白质组学分析,发现TALDO1显著下调
验证TALDO1下调对神经元代谢和功能的影响
在原代皮层神经元和HT22细胞中敲低Taldo1,检测代谢物、氧化还原状态、线粒体功能及突触蛋白
验证神经元Taldo1敲低对小鼠代谢、突触和认知的影响
通过脑室注射AAV-shT1敲低WT小鼠神经元Taldo1,检测代谢、突触结构、电生理和行为
验证恢复神经元TALDO1表达对AD小鼠代谢、突触和认知的改善作用
在5×FAD小鼠脑室注射LV-Taldo1恢复神经元TALDO1表达,检测葡萄糖摄取、氧化还原、线粒体、突触、Aβ病理和行为
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质组学 | 通用核酸酶 | Thermo Fisher Scientific | 88700 |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| Fusion Lumos质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 代谢组学 | 甲醇 | -- | -- |
| Aβ42寡聚体制备 | Aβ42 | Novus Biologicals | NBP3-18318 |
| 六氟异丙醇 | Tokyo Chemical Industry | H0424 | |
| 细胞培养 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 神经基础培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| B27添加剂 | Thermo Fisher Scientific | 17504044 | |
| 青霉素/链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
| NADP/NADPH检测 | NADP(H)检测试剂盒 | Abbkine Scientific | KTB1010 |
| GSH检测 | GSH检测试剂盒 | Solarbio | BC1175 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-10线粒体膜电位检测试剂盒 | Solarbio | CA1310 |
| 组织线粒体分离试剂盒 | Beyotime | C3606 | |
| ROS检测 | CellROX染料 | Thermo Fisher Scientific | C10422 |
| OCR测量 | Seahorse XF24分析仪 | Agilent | -- |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| FCCP | -- | -- | |
| 鱼藤酮 | -- | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶/磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1045 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Beyotime | P0018S | |
| Li-Cor Odyssey Fc成像系统 | Li-Cor Biosciences | -- | |
| 免疫荧光 | ProLong Gold防淬灭封片剂(含DAPI) | Life Technologies | D3571 |
| 高尔基染色 | FD快速高尔基染色试剂盒 | FD NeuroTechnologies | PK401 |
| PET/CT | 18F-氟代脱氧葡萄糖 | -- | -- |
| ELISA | Aβ40 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | KHB3481 |
| Aβ42 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | KHB3441 | |
| TALDO1 ELISA试剂盒 | Cloud-Clone | SEB371Mu |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白质组学分析 | 人脑样本(AD/对照)、样本量、皮层区域、突触体制备方法、质谱参数 阅读提示:Methods中“Human brain samples”和“Label-free quantitative proteomic analysis”及图1图注 |
| 细胞培养 | 原代神经元来源、培养条件、Aβ42寡聚体制备及处理浓度和时长 阅读提示:Methods中“Primary cortical neuron culture and infection”和“Preparation of Aβ42 and oligomers” |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、病毒注射位点及体积、检测时间 阅读提示:Methods中“Lateral ventricular virus injection”和“Behavioral tests” |
| 代谢检测 | NADPH/NADP+比值、GSH含量、OCR测量条件、线粒体膜电位检测 阅读提示:Methods中“NADP+ and NADPH assays”、“GSH assay”、“Detection of mitochondrial membrane potential”、“Oxygen consumption assessment” |
| 行为学 | 行为测试类型、参数、样本量 阅读提示:Methods中“Behavioral tests”及相应图注 |