评估L2-siRNA在年轻和老年大脑中的生物分布
比较年轻和老年小鼠中L2-siRNA经ICV注射后在大脑各区域的分布。
对3月龄和21月龄小鼠进行双侧ICV注射Cy5标记的L2-siRNA(10 nmol)或未标记的L2-siRNA(15 nmol),在48小时和2周后进行组织学分析和PNA定量检测。
Evaluating the effects of aging on distribution and gene silencing activity of lipid-siRNA conjugates delivered into cerebrospinal fluid
包含体内分布(组织学、PNA定量)、细胞摄取(流式)、基因沉默(RT-qPCR)、安全性评估(血清化学、细胞因子)及不同偶联物比较等多项独立实验验证。
3月龄年轻C57BL/6N小鼠 21月龄老年C57BL/6N小鼠 A7R5细胞系
小鼠年龄:3月龄(年轻)和21月龄(老年) ICV注射剂量:10 nmol(Cy5标记,用于组织学和流式)或15 nmol(未标记,用于PNA和RT-qPCR) 注射方式:双侧ICV注射,每侧5 μL,速率1 μL/min 检测时间点:48小时、2周、3个月 靶基因:Htt和Sod1
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较年轻和老年小鼠中L2-siRNA经ICV注射后在大脑各区域的分布。
对3月龄和21月龄小鼠进行双侧ICV注射Cy5标记的L2-siRNA(10 nmol)或未标记的L2-siRNA(15 nmol),在48小时和2周后进行组织学分析和PNA定量检测。
比较年轻和老年小鼠中L2-siRNA在脊髓的分布情况。
通过组织学和PNA定量分析检测脊髓颈段、胸段和腰段的分布。
比较年轻和老年小鼠中L2-siRNA靶向Htt的基因沉默效果。
在ICV注射L2-Htt(15 nmol)后2周,通过RT-qPCR检测大脑和脊髓各区域的Htt mRNA水平。
在老年小鼠中比较L2-siRNA和C16-siRNA在不同siRNA结构下的基因沉默活性和分布。
给18月龄小鼠ICV注射L2-Htt、C16-Htt、L2-Sod1、C16-Sod1、L2-NTC或生理盐水(15 nmol),3个月后检测Htt和Sod1 mRNA水平,并用PNA分析siRNA分布。
研究L2-siRNA在CSF流出部位的分布和基因沉默活性。
对年轻和老年小鼠ICV注射Cy5标记的L2-siRNA(10 nmol)或L2-Htt/L2-NTC(15 nmol),通过组织学和流式细胞术评估在硬脑膜和淋巴结中的分布,并通过RT-qPCR检测Htt沉默。
评估L2-siRNA在老年小鼠中的毒性。
检测外周器官(肝、肾)中siRNA积累、血清生化指标(BUN、肌酐、ALT、AST、LDH)、皮层细胞因子水平、GFAP免疫荧光和体重变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 寡核苷酸合成 | MerMade 12合成仪 | BioAutomation | -- |
| 2'-氟和2'-甲氧基亚磷酰胺 | Glen Research | -- | |
| Cy5功能化CPG载体 | -- | -- | |
| 寡核苷酸纯化 | Savant SpeedVac SPD120 真空浓缩仪 | Thermo Fisher | -- |
| 高效液相色谱 | Waters 1525 EF | -- | |
| Clarity Oligo-RP柱 | Phenomenex | -- | |
| Gel-Pak 脱盐柱 | Glen Research | -- | |
| Source 15Q 阴离子交换柱 | Cytiva | -- | |
| 寡核苷酸鉴定 | LTQ Orbitrap XL 质谱仪 | Thermo Fisher | -- |
| Waters XBridge 寡核苷酸BEH C18柱 | Waters | -- | |
| C16亚磷酰胺合成 | 400-MHz AMX Bruker 核磁共振波谱仪 | Bruker | -- |
| ICV注射 | Hamilton 701型微量进样器 | Hamilton | -- |
| 3K Amicon Ultra 超滤管 | MilliporeSigma | UFC500324 | |
| Tecan 酶标仪 | Tecan | -- | |
| 组织学 | Leica 荧光显微镜 | Leica | -- |
| Aperio Versa 200 玻片扫描仪 | Leica | -- | |
| Epredia 自动染色仪360 | Epredia | -- | |
| ImageJ 软件 | -- | -- | |
| PNA杂交分析 | Tissuelyzer 2.0 组织研磨仪 | Qiagen | -- |
| iSeries 液相色谱系统 | Shimadzu | -- | |
| DNAPac PA100 阴离子交换柱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式细胞术 | Amnis CellStream 流式细胞仪 | Luminex | -- |
| RT-qPCR | Nanodrop 2000c 分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| TissueLyser II 组织研磨仪 | Qiagen | -- | |
| RNeasy 微型RNA提取试剂盒 | Qiagen | 74134 | |
| Bio-Rad CFX 实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 血清化学 | BD 微量采血管 | BD Biosciences | 365967 |
| 细胞因子定量 | 小鼠高灵敏18因子检测试剂盒 | Eve Technologies | -- |
| 细胞培养 | RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 13778075 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ICV注射 | 注射剂量:10 nmol(Cy5标记)或15 nmol(未标记);注射体积:每侧5 μL;注射速率:1 μL/min;小鼠年龄:3月龄和21月龄。 阅读提示:Materials and Methods, Intracerebroventricular injection and euthanasia |
| 组织学分析 | 组织固定:4% PFA或10%福尔马林;切片厚度:30 μm(脑、脊髓)和10 μm(淋巴结);抗体浓度:CD31 1:100, Lyve1 1:200, AQP4-488 1:200, Glut1-PE 1:300, F4/80 1:100。 阅读提示:Materials and Methods, Histology |
| PNA定量 | 组织匀浆缓冲液:300 μL;蛋白酶K浓度:1:100;杂交缓冲液:50 mM Tris, 10% ACN, pH 8.8;PNA探针浓度:5 μM,2 μL。 阅读提示:Materials and Methods, Peptide nucleic acid hybridization assay |
| 流式细胞术 | 脑组织解离:Miltenyi成人脑解离试剂盒;抗体:ACSA2 (1:2000), CD11b (1:2000), O1 (1:100), CD206 (1:100);DAPI浓度:1:10,000。 阅读提示:Materials and Methods, Flow cytometry |
| RT-qPCR | RNA提取:RNeasy plus mini kit;cDNA合成:标准RNA含量;RT-qPCR反应:10 μL或20 μL;Taqman探针:Ppib (Mm00478295_m1), Htt (Mm01213820_m1), Sod1 (Mm01344233_g1)。 阅读提示:Materials and Methods, RT-qPCR |
| 细胞培养与体外敲低 | 细胞系:A7R5;细胞密度:50,000 cells/mL;转染试剂:RNAiMAX;siRNA浓度:1或10 nM;转染时间:48小时。 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture and in vitro knockdown experiments |