SNCAWT小鼠的表型表征
评估老龄化对SNCAWT小鼠运动功能和黑质多巴胺能神经元的影响。
对3、13、22个月龄的SNCAWT小鼠进行转棒、爬杆和僵住症测试,并通过无偏立体计数评估TH+神经元数量。
FKBP51 inhibition ameliorates neurodegeneration and motor dysfunction in the neuromelanin-SNCA mouse model of Parkinson's disease
包含体外细胞实验、转基因小鼠模型、人体组织样本及转录组分析,并有功能验证和机制研究。
SNCAWT转基因小鼠 FVB/N野生型小鼠 人脑组织样本 单细胞RNA-seq数据
SNCAWT小鼠的年龄范围(3、13、22个月) AAV9-hTyr注射剂量(8.94×10^12基因组拷贝/mL) SAFit2给药剂量(20 mg/kg,腹腔注射,持续12天) 行为测试时间点(注射后4周内) 检测指标:TH+神经元数量、TH+纤维光密度、Iba1+细胞计数、FKBP51表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估老龄化对SNCAWT小鼠运动功能和黑质多巴胺能神经元的影响。
对3、13、22个月龄的SNCAWT小鼠进行转棒、爬杆和僵住症测试,并通过无偏立体计数评估TH+神经元数量。
在SNCAWT小鼠中通过人酪氨酸酶过表达诱导神经黑色素积累,模拟帕金森病病理。
向3和13个月龄的SNCAWT小鼠SNpc双侧注射AAV-hTyr或AAV-null,4周后评估运动行为、多巴胺能神经元存活、包涵体形成和神经炎症。
鉴定NM积累后中脑中的差异表达基因和通路,特别是与神经炎症相关的。
对3个月龄AAV-hTyr和AAV-null注射小鼠的腹侧中脑进行RNA-seq,使用LIMMA分析和GO富集,并用CIBERSORTx进行细胞类型反卷积。
验证FKBP51在帕金森病患者脑中的表达变化。
使用公开的单细胞RNA-seq数据(GEO: GSE243639)分析FKBP5表达,并在PD患者和健康对照的死后中脑样本中进行western blot和免疫荧光染色。
评估FKBP51抑制剂SAFit2对NM诱导的神经退行性变和运动功能障碍的神经保护作用。
在AAV-hTyr注射后1周开始,对3个月龄SNCAWT小鼠腹腔注射SAFit2(20 mg/kg)或溶剂对照12天,随后评估运动功能、多巴胺能神经元存活、包涵体和微胶质细胞反应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 病毒包装与注射 | 重组腺相关病毒9型-人酪氨酸酶 | -- | -- |
| 空载AAV9 | -- | -- | |
| 立体定位注射 | Hamilton神经注射器 | Hamilton | model |
| 微量注射泵 | Stoelting | -- | |
| 药物处理 | SAFit2 | MedChemExpress | HY-102080 |
| 药物溶剂 | 吐温80 | Millipore Sigma | P4780 |
| 聚乙二醇400 | Millipore Sigma | 8.07485 | |
| 组织固定 | 蔗糖 | -- | -- |
| 组织切片 | 乙二醇 | PanReac AppliChem | 141316.1211 |
| 甘油 | PanReac AppliChem | 131339.1211 | |
| IHC封闭 | Triton X-100 | Sigma | T8787 |
| 正常山羊血清 | Merck Millipore | S26 | |
| IHC显色 | Vectastain Elite ABC试剂盒 | Vector Laboratories | PK-4001 |
| Vector VIP底物试剂盒 | Vector Laboratories | SK-4600 | |
| IHC封片 | DPX封片剂 | PanReac AppliChem | 255254.1608 |
| 免疫荧光 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Sigma-Aldrich | D8417 |
| 免疫荧光封片剂 | Thermo Fisher Scientific | 9990402 | |
| 多重IHC | DAKO PT Link 2.0.1 | Agilent Dako | -- |
| 柠檬酸盐缓冲液pH6.0 | Akoya Biosciences | AR600250ML | |
| 封闭缓冲液 | Akoya Biosciences | ARD1001EA | |
| Bond聚合物精红检测试剂盒 | Leica Biosystems | DS9390 | |
| Bond聚合物HRP PLEX检测 | Leica Biosystems | DS9914 | |
| 黄色色原 | Enzo Life Sciences | ADI-950-170 | |
| Vitroclud封片剂 | Deltalab | A20250 | |
| 显微镜成像 | 尼康Eclipse E800显微镜 | Nikon | -- |
| 尼康DS-Qi1Mc相机 | Nikon | -- | |
| PLA | Duolink原位红色PLA检测试剂盒 | Sigma | DUO92101 |
| 蔡司LSM 800 Airyscan共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 中性红染色 | 中性红溶液 | Invitrogen | N3246 |
| 蛋白提取 | Complete Mini蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11836153001 |
| PhosSTOP EASYpack磷酸酶抑制剂 | Roche | 04906837001 | |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | -- | -- |
| 增强化学发光系统 | GE Healthcare Bioscience | -- | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| RNA提取 | Maxwell RSC simplyRNA组织试剂盒 | Promega | AS1340 |
| RT-qPCR | SuperScript III反转录酶 | Invitrogen | 18064014 |
| RNA酶抑制剂 | Invitrogen | 10777019 | |
| iQ SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 1708882 | |
| CFX96 Touch实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNA-seq | Qubit高灵敏度RNA定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 4200 Tapestation高灵敏度RNA ScreenTape | Agilent Technologies | -- | |
| Illumina链特异性mRNA建库试剂盒 | Illumina | -- | |
| AMPure XP磁珠 | Beckman Coulter | -- | |
| NextSeq2000测序仪 | Illumina | -- | |
| 立体定量 | Bx61显微镜 | Olympus | -- |
| DP71相机 | Olympus | -- | |
| Stereo Investigator软件 | MBF Bioscience | version | |
| 图像扫描 | Aperio CS2数字病理切片扫描仪 | Leica | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | NIH | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9软件 | GraphPad Software | -- |
| GraphPad Prism 8.02版本 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | SNCAWT小鼠的遗传背景、年龄和性别 阅读提示:Materials and methods, Animals and virus |
| 病毒注射 | AAV-hTyr滴度、注射体积、注射速率、立体定位坐标 阅读提示:Materials and methods, Stereotaxic surgery for viral administration |
| 药物治疗 | SAFit2剂量、给药途径、给药时间、溶剂成分 阅读提示:Materials and methods, SAFit2 treatment |
| 行为测试 | 转棒、爬杆、僵住症测试的具体参数和时间安排 阅读提示:Materials and methods, Behavioral studies |
| 神经病理分析 | TH+神经元立体计数、TH+纤维光密度、Iba1+细胞计数、包涵体检测方法 阅读提示:Materials and methods, Stereological quantification |
| 蛋白检测 | FKBP51和HSP90抗体信息、样品制备、蛋白质印迹条件 阅读提示:Materials and methods, Protein extracts and immunoblotting |
| 转录组分析 | RNA-seq样本来源、文库构建、测序平台、差异表达分析阈值 阅读提示:Materials and methods, RNA-seq and bioinformatics |