AAV靶向肺组织的验证
确定非侵入性气管内给药AAV能否有效靶向肺实质细胞,并优化给药条件。
通过气管内、鼻内、腹腔和静脉注射AAV2/8-GFP和AAV2/9-GFP,比较不同途径和血清型对肺部GFP表达的影响;通过免疫荧光分析GFP与AT1、AT2和内皮细胞标记物的共定位,确定细胞类型特异性。
Non-invasive administration of AAV to target lung parenchymal cells and develop SARS-CoV-2-susceptible mice
包含体外细胞验证(293T转染hACE2)、AAV靶向性体内验证(不同给药途径)、基因敲除小鼠模型(IFNAR/NOD2/TLR7 KO)、SARS-CoV-2感染实验、组织病理学和免疫组化分析等多层级验证。
小鼠(C57BL/6背景的野生型及IFNAR、NOD2、TLR7基因敲除小鼠) 叙利亚仓鼠 HEK293T细胞 Vero E6细胞
AAV血清型(AAV2/8和AAV2/9)对肺靶向效率的影响 非侵入性与侵入性气管内注射对AAV转导效率的影响 hACE2表达水平和持续时间在AAV转导小鼠中的变化 IFNAR敲除对SARS-CoV-2病毒滴度和肺部病变的影响 感染后不同时间点(2、4、7天)病毒清除和病变发展
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定非侵入性气管内给药AAV能否有效靶向肺实质细胞,并优化给药条件。
通过气管内、鼻内、腹腔和静脉注射AAV2/8-GFP和AAV2/9-GFP,比较不同途径和血清型对肺部GFP表达的影响;通过免疫荧光分析GFP与AT1、AT2和内皮细胞标记物的共定位,确定细胞类型特异性。
利用AAV介导hACE2在肺中表达,建立SARS-CoV-2易感小鼠模型。
将编码hACE2-FLAG的AAV2/8通过气管内和鼻内给药,在WT、NOD2 KO、TLR7 KO和IFNAR KO小鼠中表达hACE2,然后感染SARS-CoV-2。
比较不同基因敲除小鼠对SARS-CoV-2的易感性,评估I型干扰素信号的作用。
在SARS-CoV-2感染后2、4、7天,通过空斑实验测定肺中病毒滴度,并通过免疫组化检测核衣壳蛋白。
评估SARS-CoV-2感染引起的肺部病变和炎症反应。
对气管和肺组织进行组织病理学评分,包括炎症、细胞浸润、上皮损伤等,并通过免疫组化鉴定浸润细胞类型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| AAV制备与纯化 | 聚乙烯亚胺 | 文中未明确说明 | -- |
| 苯zonase核酸酶 | Sigma-Aldrich | E8263 | |
| AAV纯化 | 碘克沙醇 | 文中未明确说明 | -- |
| Amicon Ultra-15离心过滤装置 | Sigma-Aldrich | UFC910096 | |
| 泊洛沙姆188 | Sigma-Aldrich | P5556 | |
| AAV滴度测定 | CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | -- |
| 蛋白质提取与免疫印迹 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | 11836153001 |
| 蛋白质定量 | DC蛋白质测定试剂 | Bio-Rad | 5000116 |
| 免疫印迹抗体 | ACE2抗体(单克隆) | ABclonal | A4612 |
| ACE2抗体(多克隆) | ABclonal | A12737 | |
| FLAG抗体 | Thermo Fisher | PA1-984B | |
| GFP抗体 | Abcam | ab290 | |
| β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| HSP90抗体 | Cell Signaling Technology | 4874 | |
| 免疫荧光 | 10%中性缓冲福尔马林 | Sigma-Aldrich | HT501128 |
| 免疫荧光(细胞) | FITC标记二抗 | Thermo Fisher | A16995 |
| ProLong Gold抗淬灭封片剂(含DAPI) | Thermo Fisher | P36941 | |
| 共聚焦显微镜(LSM 900) | Carl Zeiss | -- | |
| 免疫荧光(组织) | 兔抗AQP5抗体 | Abcam | ab78486 |
| 兔抗proSPC抗体 | Sigma-Aldrich | AB3786 | |
| 兔抗VWF抗体 | Thermo Fisher | PA5-16634 | |
| 兔抗ACE2抗体 | ABclonal | A12737 | |
| 鸡抗GFP抗体 | Abcam | ab13970 | |
| 驴抗兔二抗 | Thermo Fisher | A31573 | |
| 驴抗鸡二抗 | Jackson ImmunoResearch | 703-545-155 | |
| 组织病理学 | Surgipath Paraplast石蜡 | Leica Biosystems | -- |
| 轮转式切片机HM-340E | Thermo Fisher | -- | |
| 免疫组化 | SARS-CoV-2核衣壳蛋白抗体 | Sino Biological | 40,143-V08B |
| Ly6G抗体 | Thermo Fisher | 14-5931-82 | |
| F4/80抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-25830 | |
| 抗体稀释液 | GBI Labs | E09-300 | |
| HRP标记抗兔IgG | Vector Laboratories | MP-7500 | |
| HRP标记抗大鼠IgG | Vector Laboratories | MP-7404 | |
| DAB底物 | Vector Laboratories | SK-4105 | |
| 奥林巴斯BX53显微镜 | Olympus | -- | |
| 奥林巴斯DP80相机 | Olympus | -- | |
| 免疫组化图像分析 | TS Auto 5.1图像分析软件 | Olympus | -- |
| 动物实验 | 异氟烷麻醉诱导盒 | 文中未明确说明 | -- |
| 动物实验(侵入性注射) | 胰岛素注射器(31G针头) | 文中未明确说明 | -- |
| 病毒培养 | Vero E6细胞 | 文中未明确说明 | -- |
| 统计分析 | SAS 9.4统计软件 | SAS Institute | -- |
| GraphPad Prism 9.1.1绘图软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| AAV靶向性验证 | AAV剂量:4×10^11 VPs;给药体积:25μL(气管内)或50μL(鼻内);小鼠周龄:8周;分析时间:1或2周 阅读提示:Results部分“Intratracheal administration of AAV2/8 specifically targets lung parenchyma”及图1B、S1A、S1C |
| AAV转导小鼠模型构建 | AAV血清型(AAV2/8和AAV2/9);给药途径(气管内和鼻内联合);hACE2基因(FLAG标记);KO小鼠品系(WT、NOD2、TLR7、IFNAR) 阅读提示:Materials and methods部分“AAV-hACE2 transduction”及图2E |
| SARS-CoV-2感染 | SARS-CoV-2株:NCCP-43331;接种剂量:1×10^6 PFU;接种体积:30μL DMEM;接种途径:鼻内;感染后观察时间点:2、4、7天 阅读提示:Materials and methods部分“Intranasal inoculation with SARS-CoV-2”和“Determination of the viral titer” |
| 病毒滴度测定 | Vero E6细胞密度:2×10^5 cells/well;孵育时间:1小时然后3天;固定:4%甲醛;染色:0.4%结晶紫 阅读提示:Materials and methods部分“Determination of the viral titer” |
| 组织病理学与免疫组化 | 组织切片厚度:4μm;抗原修复:柠檬酸缓冲液pH 6.0 95°C 30min;抗体稀释:1:500;DAB显色 阅读提示:Materials and methods部分“Histopathology and immunohistochemistry”及图4 |
| 统计分析方法 | 单因素方差分析(ANOVA)和Duncan多重比较检验;显著性水平:P ≤ 0.05 阅读提示:Materials and methods部分“Statistical analysis” |