U90926表达分析
检测U90926在缺血性卒中后的表达变化及细胞定位。
通过qRT-PCR检测tMCAO小鼠缺血半暗带、血清、不同器官及分选的小胶质细胞中U90926水平;通过FISH检测OGD-R处理的原代小胶质细胞中U90926表达及定位。
Microglial lnc-U90926 facilitates neutrophil infiltration in ischemic stroke via MDH2/CXCL2 axis
包含体内动物模型(tMCAO小鼠)、体外细胞实验(原代小胶质细胞、BV2细胞)、分子机制验证(RNA pull-down、RIP、荧光素酶报告基因)等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
tMCAO小鼠模型 原代小胶质细胞 BV2小胶质细胞系 体外血脑屏障模型(Bend3内皮细胞)
tMCAO小鼠模型构建细节:50分钟阻塞,再灌注,CBF降低>20% AAV-F4/80-shRNA-U90926微注射坐标、剂量(1×10^12 vg/μL)及敲低效率 中性粒细胞耗竭:抗Ly6G抗体(150 μg/只)腹腔注射,术前24小时 OGD-R条件:无糖无血清DMEM,5% CO2/95% N2,4小时,再灌注12-24小时 CXCL2 mRNA稳定性测定:ActD处理浓度1 μg/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测U90926在缺血性卒中后的表达变化及细胞定位。
通过qRT-PCR检测tMCAO小鼠缺血半暗带、血清、不同器官及分选的小胶质细胞中U90926水平;通过FISH检测OGD-R处理的原代小胶质细胞中U90926表达及定位。
评估小胶质细胞特异性敲低U90926对tMCAO小鼠神经功能和梗死体积的影响。
通过AAV-F4/80-shRNA-U90926或对照AAV显微注射到小鼠皮层,诱导tMCAO,评估mNSS、握力、转棒表现和TTC染色梗死体积。
确定U90926敲低是否影响中性粒细胞向缺血脑组织的浸润。
通过流式细胞术分析缺血半球免疫细胞(小胶质细胞、B细胞、T细胞、中性粒细胞)数量;免疫荧光染色检测Ly6G+细胞;qRT-PCR检测MPO和MMP3;体外构建transwell中性粒细胞迁移模型。
验证U90926的作用是否通过促进中性粒细胞浸润介导。
使用抗Ly6G抗体耗竭中性粒细胞,然后比较对照组和U90926敲低组在tMCAO后的梗死体积和神经功能。
鉴定U90926调控的中性粒细胞趋化因子。
对LPS刺激的原代小胶质细胞(对照或U90926敲低)进行mRNA微阵列分析;qRT-PCR验证CXCL1、CXCL2、CXCL10在缺血皮层和OGD-R处理细胞中的表达。
阐明U90926如何上调CXCL2表达并促进中性粒细胞趋化。
RNA稳定性实验检测CXCL2 mRNA半衰期;RNA pull-down和LC-MS/MS鉴定U90926结合蛋白MDH2;RIP、FISH、免疫荧光验证结合;荧光素酶报告基因检测U90926对MDH2对CXCL2 3'UTR作用的影响;MDH2敲低/过表达实验验证U90926作用的依赖性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| tMCAO模型 | 6-0硅胶涂层单丝缝线 | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| RNA提取和qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | miRNeasy血清/血浆提取试剂盒 | QIAGEN | -- |
| 逆转录 | PrimeScript RT试剂盒 | Vazyme Biotech | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green试剂盒 | Takara | -- |
| ABI 7500 PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 微阵列 | Agilent SurePrint G3小鼠基因表达微阵列V2.0 | Agilent Technologies | -- |
| RNeasy Mini试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| 微阵列扫描 | Agilent G2505C扫描仪 | Agilent Technologies | -- |
| FISH | FISH试剂盒 | RiboBio | -- |
| U90926特异性探针 | -- | 50 | |
| FISH/免疫荧光 | DAPI | Beyotime Biotechnology | -- |
| 显微注射 | AAV-F4/80-shRNA-U90926 / AAV-F4/80-shRNA-Con | Genechem Techniques | 1×10^12 |
| CBF测量 | 激光散斑成像系统 | Moor Instruments | -- |
| 激光多普勒血流仪 | -- | -- | |
| 神经行为测试 | 转棒仪 | Nature Gene Corporation | -- |
| 握力测试 | Panlab握力计(LE902) | Bioseb | -- |
| 梗死体积测量 | TTC | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞活力 | CCK-8试剂盒 | Sigma | -- |
| 细胞活力测定 | 酶标仪 | Tecan | -- |
| 流式细胞术 | 神经组织解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| Percoll分离液 | GE Healthcare BioSciences | -- | |
| 抗小鼠CD45抗体 | Invitrogen | 25-0451-82 | |
| 抗小鼠CD11b抗体 | Invitrogen | 53-0112-82 | |
| 抗小鼠Ly6G抗体 | Invitrogen | 12-9668-82 | |
| 抗小鼠CD19抗体 | Invitrogen | 17-0193-82 | |
| 抗小鼠CD4抗体 | Invitrogen | 12-0041-82 | |
| 抗小鼠CD8抗体 | Invitrogen | 17-0081-82 | |
| 中性粒细胞分离 | ACK裂解缓冲液 | -- | -- |
| 抗PE磁珠 | BD Biosciences | -- | |
| MACS分选柱/分选器 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 免疫荧光染色 | MDH2抗体 | Santa Cruz | sc-293474 |
| Iba-1抗体 | Abcam | ab48004 | |
| Ly6G抗体 | Abcam | ab25377 | |
| 二抗 | Invitrogen | -- | |
| 体外BBB模型 | Bend3细胞 | -- | -- |
| TEER测量 | EVOM电阻仪 | World Precision Instruments | -- |
| FITC-葡聚糖渗透实验 | FITC标记葡聚糖(MW 70,000) | Sigma-Aldrich | -- |
| 中性粒细胞耗竭 | 抗小鼠Ly6G抗体 | GeneTex | GTX00669 |
| RNA pull-down | 生物素标记RNA探针(U90926) | GenePharma Technologies | -- |
| 链霉亲和素磁珠 | MCE | HY-K0208 | |
| RIP | Magna RIP试剂盒 | Millipore | -- |
| MDH2抗体 | Santa Cruz | sc-293474 | |
| 对照兔IgG | Cell Signaling Technology | 2729 | |
| RNA干扰 | 携带shRNA的慢病毒(U90926/MDH2) | Genechem Techniques | -- |
| 过表达 | U90926/MDH2过表达质粒 | GenePharma Techniques | -- |
| 双荧光素酶报告实验 | 编码CXCL2 3'UTR的pGL3荧光素酶质粒 | -- | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| tMCAO模型 | 小鼠品系、性别、年龄(8周龄雄性C57BL/6J);线栓规格(6-0硅胶涂层单丝,长度12 mm);阻塞时间(50分钟);CBF下降标准(>20%基线) 阅读提示:Materials and methods: tMCAO |
| 小胶质细胞U90926敲低 | AAV血清型(F4/80启动子,GFP标记);注射剂量(1×10^12 vg/μL,1μL);注射坐标(三个坐标);注射后时间(3周后诱导tMCAO) 阅读提示:Materials and methods: Microinjection of AAV; Figure 2A |
| 中性粒细胞耗竭 | 抗体(抗Ly6G,150 μg/只)腹腔注射时间(tMCAO前24h) 阅读提示:Materials and methods: Neutrophil depletion; Figure 4A |
| OGD-R处理 | 培养基(无糖无血清DMEM);气体条件(5% CO2/95% N2);处理时间(4小时);再灌注时间(12-24小时) 阅读提示:Materials and methods: OGD-R |
| qRT-PCR | 内参基因(GAPDH或β-actin,具体见图注);引物序列(Table 1) 阅读提示:Materials and methods: RNA isolation and quantitative real-time PCR; Table 1 |
| RNA稳定性实验 | LPS浓度(100 ng/mL)刺激时间(3小时);ActD浓度(1 μg/mL) 阅读提示:Materials and methods: RNA stability assay |
| 中性粒细胞迁移实验 | 内皮细胞(Bend3)培养时间(96小时);OGD处理时间(4小时);中性粒细胞迁移时间(3小时) 阅读提示:Materials and methods: Neutrophil migration model |