人群队列研究
评估CRC诊断后全身使用特比萘芬与死亡和转移风险的关系
基于瑞典国家登记处数据,对185名CRC后使用特比萘芬的患者进行倾向评分匹配,使用时间依赖性Cox回归分析死亡和转移风险。
Terbinafine prevents colorectal cancer growth by inducing dNTP starvation and reducing immune suppression
包含人群队列研究、多种小鼠模型(AOM/DSS、原位、APCmin/+)、细胞实验、机制验证(SQLE、G6PD、代谢)及FMT回补实验,证据层级丰富。
结直肠癌细胞系HCT116、HT29、LoVo、DLD1、MC38 AOM/DSS诱导的CRC小鼠模型 原位CRC小鼠模型(MC38细胞) APCmin/+转基因小鼠模型 CRC患者来源异种移植瘤(PDX)模型
特比萘芬剂量:AOM/DSS模型为20 mg/kg腹腔注射,原位和皮下模型为50 mg/kg FMT实验:来自未处理小鼠的粪便微生物群移植 MDSC清除:抗Ly6G抗体(25 μg,每3天腹腔注射) 代谢分析:13C标记葡萄糖示踪检测dNTP和R5P合成 G6PD抑制:6-AN和DHEA处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CRC诊断后全身使用特比萘芬与死亡和转移风险的关系
基于瑞典国家登记处数据,对185名CRC后使用特比萘芬的患者进行倾向评分匹配,使用时间依赖性Cox回归分析死亡和转移风险。
在多种CRC小鼠模型中评估特比萘芬的抗肿瘤效果
使用AOM/DSS诱导、原位移植(MC38-luc)和APCmin/+小鼠模型,给予特比萘芬或载体,评估肿瘤数量、大小、组织学和生存期。
探究特比萘芬对肠道真菌组成和免疫细胞浸润的影响
检测粪便真菌载量、ITS测序分析真菌组成,流式细胞术分析肿瘤组织中MDSC、CD8+和CD4+细胞比例。
验证真菌在特比萘芬抗肿瘤效应中的作用
对特比萘芬处理的小鼠进行粪便微生物群移植(来自载体组或特比萘芬组),评估肿瘤负荷、MDSC和T细胞浸润。
评估特比萘芬对CRC细胞增殖的直接抑制作用
用不同浓度特比萘芬处理HCT116、HT29、LoVo和DLD1细胞,检测细胞活力、集落形成、细胞周期和核苷酸合成。
验证特比萘芬是否通过SQLE抑制PPP和核苷酸合成
通过shRNA敲低或过表达SQLE,检测G6PD活性、NADP+/NADPH比值、dNTP合成和细胞生长。
验证MDSC清除和SQLE抑制在特比萘芬抗肿瘤效应中的作用
在APCmin/+小鼠中单独或联合使用抗Ly6G抗体和特比萘芬,评估肿瘤负荷和免疫指标;在原位模型中敲低SQLE并给予特比萘芬。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | McCoy's 5A培养基 | 文中未明确说明 | -- |
| DMEM培养基 | 文中未明确说明 | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | 文中未明确说明 | -- | |
| 链霉素 | 文中未明确说明 | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | ShareBio | SB-CCK8S |
| 酶标仪 | TECAN | M1000 PRO | |
| 细胞周期分析 | 碘化丙啶 | 文中未明确说明 | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778150 | |
| 聚凝胺 | Sigma | H9268 | |
| 嘌呤霉素 | Gibco | A1113802 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | 9109 |
| RT-qPCR | PrimeScript RT-PCR试剂盒 | Takara | RR037A |
| SYBR Premix Ex Taq | Roche | 04913914001 | |
| 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA-seq | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- |
| AMPure XP磁珠纯化系统 | Beckman Coulter | -- | |
| TruSeq PE Cluster Kit v3-cBot-HS | Illumina | -- | |
| HiSeq X Ten测序平台 | Illumina | -- | |
| Western blot | Western blot裂解和提取缓冲液 | Thermo Fisher | 89900 |
| 抗cleaved-caspase-8抗体 | ImmunoWay | YC0011 | |
| 抗cleaved-caspase-3抗体 | ImmunoWay | YC0027 | |
| 抗cleaved-caspase-7抗体 | ImmunoWay | YC0010 | |
| 抗cleaved-caspase-1抗体 | ImmunoWay | YC0002 | |
| 抗gasdermin D抗体 | CST | #46451 | |
| 抗pMLKL抗体 | CST | #37333 | |
| 抗MLKL抗体 | CST | #37705 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8226 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠二抗 | Jackson ImmunoResearch | 115-035-003 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Jackson ImmunoResearch | 111-035-003 | |
| NCM通用抗体稀释液 | New Cell & Molecular Biotech | WB500D | |
| ECL化学发光试剂 | ShareBio | SB-WB012 | |
| 免疫组化 | 抗PCNA抗体 | CST | 13110 |
| 抗COX2抗体 | Abcam | ab179800 | |
| 抗Gr-1抗体 | Invitrogen Antibodies | 14-5931-82 | |
| 抗CD8抗体 | Cell Signaling | 98941 | |
| 抗CD4抗体 | Cell Signaling | 25229 | |
| 抗SQLE抗体 | Proteintech | 12544-1-AP | |
| DAB显色底物 | CST | 8059 | |
| 磷酸盐缓冲液 | BasalMedia | B320KJ | |
| 牛血清白蛋白组分V | BioFroxx | 4240GR250 | |
| 代谢分析 | U-13C标记葡萄糖 | CIL | CLM-1396-1 |
| NADP+/NADPH检测试剂盒 | Biovision | #K347 | |
| PicoProbe葡萄糖-6-磷酸脱氢酶活性检测试剂盒(荧光法) | Biovision | #K751 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- | |
| 流式细胞术 | IV型胶原酶 | 文中未明确说明 | -- |
| Percoll分离液 | 文中未明确说明 | -- | |
| 抗CD45抗体 | eBioscience | 12-0451-82 | |
| 7-AAD活细胞染料 | eBioscience | 00-6993-50 | |
| 抗CD11b抗体 | BD Pharmingen | 17-0112-82 | |
| 抗Gr-1抗体 | Biolegend | 108412 | |
| 抗CD3抗体 | Biolegend | 100308 | |
| 抗CD4抗体 | eBioscience | 11-0042-82 | |
| 抗CD8抗体 | eBioscience | 17-0081-82 | |
| LSRFortessa流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人群队列研究 | 纳入标准(CRC诊断时间、ICD-10代码),特比萘芬使用定义(全身/局部),结局定义,匹配变量,统计模型 阅读提示:Materials and methods: National population-based cohort study in Sweden |
| AOM/DSS模型 | 小鼠品系、性别、年龄、AOM剂量(10 mg/kg)、DSS浓度(2.5%)和周期、特比萘芬剂量(20 mg/kg)和给药方式(腹腔注射) 阅读提示:Materials and methods: AOM/DSS model |
| 原位模型 | 细胞系(MC38-luc)、注射细胞数(5×10^5)、手术方法、特比萘芬剂量(50 mg/kg)、FMT方法 阅读提示:Materials and methods: Orthotopic mouse model |
| APCmin/+模型 | 小鼠基因型、年龄(6周龄)、特比萘芬剂量(20 mg/kg)、抗Ly6G抗体剂量(25 μg)和给药频率(每3天)、评估时间(20周龄) 阅读提示:Materials and methods: Apcmin/+ model |
| 细胞实验 | 细胞系、培养基、特比萘芬浓度、处理时间、细胞接种密度、检测方法 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, Cell viability assay, Cell-cycle assay, Colony formation assays |
| 机制验证 | SQLE敲低/过表达方法、G6PD抑制剂(6-AN和DHEA)浓度、NADP+/NADPH检测试剂盒、G6PD活性检测试剂盒、13C标记葡萄糖浓度和标记时间 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection and RNA interference, Liquid chromatography-mass spectrometry analysis of cell metabolites, NADP+/NAPDH ratio, G6PD enzyme activity |
| 免疫分析 | 组织处理、消化酶浓度、Percoll梯度、抗体克隆号和稀释度、流式分析仪器 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry |