基因工程纳米囊泡通过ADAR1沉默和PDL1阻断调动协同抗肿瘤免疫

Genetically engineered nanovesicles mobilize synergistic antitumor immunity by ADAR1 silence and PDL1 blockade

作者信息Lei Ding, Xiaolong Zhang, Peiwen Yu, Fang Peng, Yupeng Sun, Yanni Wu, Zijin Luo, Hongsheng Li, Yongyi Zeng, Ming Wu, Xiaolong Liu
PMID37087570
期刊Mol Ther
发布时间2023-08
DOI10.1016/j.ymthe.2023.04.011

实验完整度

包含体外细胞实验(CHO细胞工程、LNP表征、siRNA沉默)、体内抗肿瘤模型(4T1和CT26皮下瘤、肺转移、双侧肿瘤)、免疫微环境分析(流式、ELISA、RNA-seq)及机制验证。

主要模型

4T1小鼠乳腺癌皮下瘤模型 CT26小鼠结肠癌皮下瘤模型 4T1小鼠肺转移模型 4T1双侧肿瘤模型

重点核对

siAdar1序列(siAdar1-mus-3302)的基因沉默效率 siAdar1-LNP@mPD1的PD1蛋白呈递及PDL1结合能力 荷瘤小鼠给药剂量(25 μg siRNA/次)和给药方案(尾静脉注射4次,每4天一次) 肿瘤生长抑制、免疫细胞浸润和细胞因子水平

摘要

越来越多的证据表明,RNA编辑酶ADAR1负责检测内源性RNA种类,与免疫检查点阻断(ICB)治疗的不良反应或耐药显著相关。在此,开发了一种基因工程纳米囊泡(siAdar1-LNP@mPD1)作为RNA干扰纳米工具,以克服肿瘤对ICB治疗的耐药性。针对ADAR1的小干扰RNA(siAdar1)被包装到脂质纳米颗粒(LNP)中,并进一步包被来自过表达PD1的基因工程细胞提取的质膜。siAdar1-LNP@mPD1通过在包被膜上呈递PD1蛋白来阻断PD1/PDL1免疫抑制轴。此外,siAdar1可通过设计的纳米囊泡有效递送到癌细胞中,沉默ADAR1表达,导致I/II型干扰素(IFN-β/γ)产生增加,并使癌细胞对分泌的效应细胞因子(如IFN-γ)更敏感,显著抑制细胞生长。这些整合的功能赋予siAdar1-LNP@mPD1强大而全面的抗肿瘤免疫,如显著的肿瘤生长消退、远隔肿瘤预防和肺转移的有效抑制,通过肿瘤免疫微环境的整体重塑。总体而言,我们提供了一种有前景的可转化策略,同时沉默ADAR1和阻断PDL1免疫检查点以增强强大的抗肿瘤免疫。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何通过同时沉默ADAR1和阻断PD1/PDL1通路来克服肿瘤对免疫检查点治疗的耐药性并增强抗肿瘤免疫?
核心机制
siAdar1-LNP@mPD1通过敲低ADAR1增加I/II型干扰素(IFN-β/γ)的产生,使癌细胞对IFN-γ更敏感,同时通过表面PD1蛋白阻断PD1/PDL1免疫抑制轴,重塑肿瘤免疫微环境,增强抗肿瘤免疫。
主要证据
在4T1和CT26皮下瘤模型中,siAdar1-LNP@mPD1显著抑制肿瘤生长;在肺转移模型中减少转移结节;在双侧肿瘤模型中抑制远隔肿瘤生长并延长生存期。流式细胞术和免疫荧光显示肿瘤内CD8+和CD4+T细胞浸润增加,Treg和MDSC减少;ELISA显示IFN-β、IFN-γ、TNF-α和IL-12水平升高,IL-10和TGF-β1降低;RNA-seq显示免疫相关通路激活。
研究意义
该研究提供了一种可转化的策略,通过同时沉默ADAR1和阻断PDL1来增强免疫检查点治疗的效果,可推广至ADAR1高表达的不同肿瘤类型。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

构建PD1过表达CHO细胞系

获得稳定表达PD1蛋白的基因工程细胞,用于提取含有PD1的细胞膜。

通过慢病毒转染CHO细胞构建PD1-mCherry稳定表达细胞系,并用嘌呤霉素筛选。通过共聚焦显微镜、流式细胞术和Western blot验证PD1表达。

2

制备和表征siAdar1-LNP@mPD1纳米囊泡

制备负载siAdar1的脂质纳米颗粒并用PD1过表达细胞膜包被,以同时递送siRNA和阻断PDL1。

通过乙醇注射法合成siAdar1-LNP,并用超声和挤出法与mPD1膜融合形成siAdar1-LNP@mPD1。通过TEM、DLS、WB等表征。

3

验证siAdar1-LNP@mPD1的体外功能

评估纳米囊泡的PDL1结合能力、细胞摄取、基因沉默效率和IFN-γ敏感性。

通过共孵育、共聚焦显微镜和流式细胞术检测mPD1 NVs与PDL1阳性细胞的结合;用5-FAM标记siAdar1观察细胞摄取;用qRT-PCR和WB检测ADAR1敲低效率;用CCK-8检测IFN-γ处理后的细胞活力。

4

评估皮下4T1肿瘤模型的治疗效果

验证siAdar1-LNP@mPD1对皮下肿瘤生长的抑制作用。

建立4T1皮下肿瘤模型,尾静脉注射不同制剂,监测肿瘤体积和体重,终点取瘤称重并进行组织学分析(H&E、Ki67、TUNEL),以及ADAR1表达检测。

5

分析肿瘤微环境中的免疫应答

探究siAdar1-LNP@mPD1治疗对肿瘤免疫微环境的调节作用。

通过ELISA检测肿瘤组织细胞因子水平,流式细胞术和免疫荧光分析免疫细胞浸润,RNA-seq分析转录组变化。

6

评估CT26肿瘤模型的普适性

验证该策略在其他肿瘤类型中的有效性。

建立CT26皮下肿瘤模型,随机分为6组,分别给予PBS、anti-PDL1、siNC-LNP@m、siAdar1-LNP@m、siNC-LNP@mPD1、siAdar1-LNP@mPD1治疗,监测肿瘤生长。

7

评估肺转移抑制效果

评估治疗诱导的免疫记忆效应能否抑制肺转移。

首次治疗结束后,手术切除残余肿瘤,1周后尾静脉注射4T1细胞,观察肺转移结节数量。

8

评估远隔效应

探究局部治疗能否诱导系统性抗肿瘤免疫抑制远隔肿瘤生长。

建立双侧4T1肿瘤模型,一侧肿瘤瘤内注射治疗,另一侧不处理,监测肿瘤体积和生存期。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DOTAPAVT Pharmaceutical--
胆固醇AVT Pharmaceutical--
DPPCAVT Pharmaceutical--
DSPE-mPEG2000AVT Pharmaceutical--
DMEM培养基Gibco--
RPMI-1640培养基Gibco--
KGM-Gold培养基----
RIPA裂解液Beyotime Biotechnology--
膜和胞浆蛋白提取试剂盒Beyotime Biotechnology--
Easy II蛋白定量试剂盒TransGen Biotech--
蛋白酶抑制剂混合物MedChemExpress--
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
TransZol Up试剂TransGen Biotech--
Hieff qPCR SYBR Green预混液Shanghai Yeasen BioTechnologies--
CCK-8试剂盒Dojindo Laboratories--
DAPISigma-Aldrich--
DiO染料Us Everbright--
DiI染料Us Everbright--
抗Ki67抗体(ab231172)ABclonal--
抗PD1抗体(ab214421)ABclonal--
抗PDL1抗体(ab213480)ABclonal--
抗ADAR1抗体Santa Cruz Biotechnology--
聚凝胺Santa Cruz Biotechnology--
抗CD3-APC抗体(17-0032-82)Thermo Fisher Scientific--
抗CD4-FITC抗体(11-0042-85)Thermo Fisher Scientific--
抗CD8-PE抗体(12-0081-82)Thermo Fisher Scientific--
抗CD25-PerCP-Cy5.5抗体(46-0251-82)Thermo Fisher Scientific--
抗CD69-FITC抗体(11-0691-82)Thermo Fisher Scientific--
抗Foxp3-PE-Cy7抗体(25-5773-80)Thermo Fisher Scientific--
抗CD11b-APC抗体(17-0112-82)Thermo Fisher Scientific--
抗Ly-6G/Ly-6C-PE抗体(12-5931-82)Thermo Fisher Scientific--
抗CD44-PE-Cy7抗体(250441-82)Thermo Fisher Scientific--
抗CD62L-PerCP-Cy5.5抗体(45-0621-82)Thermo Fisher Scientific--
小鼠ELISA试剂盒(IFN-β、IFN-γ、TNF-α、IL-12p70、IL-10、TGF-β1)Boster Biological Technology--
重组小鼠PDL1蛋白Acmec Biochemical--
siAdar1(siAdar1-mus-3302)GenePharma--
CD8 TIL磁珠Miltenyi Biotec130-116-478
重组人IL-2R&D SystemsMX2918061
抗CD3ε抗体BioLegend100331
CFSE(羧基荧光素琥珀酰亚胺酯)SelleckS8269
基质胶Corning--
IV型胶原酶----
透明质酸酶----
脱氧核糖核酸酶I----
Trizol试剂----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
PD1过表达CHO细胞系构建
慢病毒转染方法、嘌呤霉素筛选浓度(5 μg/mL)、PD1表达验证方法
阅读提示:Methods: Establishment and characterization of genetically engineered stable cell lines
siAdar1-LNP@mPD1制备
脂质成分及摩尔比(DOTAP: DPPC: 胆固醇: DSPE-mPEG2000 = 50:10:38.5:1.5)、siRNA浓度(20 μM)、脂质与siRNA体积比(1:2)、挤出膜孔径(0.4, 0.2, 0.1 μm)
阅读提示:Methods: Preparation of siAdar1-LNP@mPD1
体外基因沉默
siAdar1浓度(100 nM)、处理时间(48 h)、细胞系(4T1)
阅读提示:Methods: In vitro gene silencing and protein knockdown with siAdar1-LNP
IFN-γ敏感性实验
siAdar1-LNP@mPD1浓度(100 nM)、IFN-γ浓度梯度(0.1-0.5 μg/mL)、处理时间(24 h)
阅读提示:Methods: IFN sensitivity assay
皮下4T1肿瘤模型治疗
4T1细胞接种数量(1×10^6)、给药剂量(25 μg siRNA/次)、给药方案(尾静脉注射4次,每4天一次)、肿瘤体积测量频率
阅读提示:Methods: Antitumor efficiency on the s.c. 4T1 tumor model
皮下CT26肿瘤模型治疗
CT26细胞接种数量、给药剂量(25 μg siRNA/次;anti-PDL1 5 mg/kg)、给药方案(共3次,每4天一次)
阅读提示:Methods: Antitumor efficiency on the s.c. CT26 tumor model
肺转移模型评估
挑战4T1细胞数量(5×10^5)、时间点(第27天)、肺转移计数时间(第40天)
阅读提示:Methods: Evaluation of the lung metastasis
双侧肿瘤模型评估
原发和远隔肿瘤细胞接种数量(1×10^6和5×10^5)、给药剂量(5 μg siRNA/次)、给药方案(瘤内注射4次,每4天一次)
阅读提示:Methods: Antitumor evaluation on the bilateral 4T1 tumor model