NDNF表达模式分析
评估NDNF在正常和ALS小鼠脊髓中的时空表达
通过免疫印迹和免疫染色检测NDNF在发育过程中的表达,以及在SOD1G93A小鼠不同疾病阶段的表达,并通过RNA原位杂交验证NDNF在运动神经元中的表达
Intrathecal delivery of AAV-NDNF ameliorates disease progression of ALS mice
包含体内动物模型(SOD1G93A小鼠)多个阶段干预,组织学、行为学、分子及转录组等多层级验证,并涉及机制通路分析。
SOD1G93A转基因小鼠(ALS模型) HEK293T细胞(用于病毒包装和表达验证) WT小鼠(对照)
AAV-NDNF在不同疾病阶段(P61、P85、P100-110)的鞘内注射剂量和时机 运动功能评估(Catwalk步态分析) 脊髓运动神经元存活计数(ChAT染色) 神经肌肉接头(NMJ)神经支配状态评估 mTOR信号通路激活(pS6水平)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NDNF在正常和ALS小鼠脊髓中的时空表达
通过免疫印迹和免疫染色检测NDNF在发育过程中的表达,以及在SOD1G93A小鼠不同疾病阶段的表达,并通过RNA原位杂交验证NDNF在运动神经元中的表达
优化AAV载体以实现高效的中枢神经系统神经元转导
比较AAV-PHP.eB衣壳介导的hSyn或CBh启动子驱动的GFP表达,并通过腰椎穿刺鞘内注射评估转导效率
评估AAV-NDNF在疾病不同阶段对体重和运动功能的影响
在P61或P85鞘内注射AAV-NDNF或对照病毒,通过Catwalk步态分析和体重监测评估效果
评估AAV-NDNF对运动神经元存活、神经肌肉接头完整性和蛋白聚集的影响
对P135小鼠的脊髓和肌肉进行免疫染色,计数运动神经元、评估NMJ神经支配状态、检测泛素化蛋白聚集
探索NDNF过表达介导的分子机制
对AAV-NDNF处理的小鼠脊髓进行bulk RNA-seq,并进行差异表达基因和通路富集分析
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 病毒包装 | pUCmini-iCAP-PHP.eB | Addgene | #103005 |
| 聚乙烯亚胺(PEI 40000) | Yeasen | #40816ES02 | |
| 病毒纯化 | 碘克沙醇 | Sigma-Aldrich | #D1556-250ML |
| 病毒浓缩 | Amicon Ultra-100离心过滤器 | Millipore | #UFC910096 |
| 病毒滴度测定 | 脱氧核糖核酸酶I | Thermo Fisher Scientific | #EN0525 |
| SYBR Green | Bimake | #B21702 | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Bimake | B14001 | |
| 上样缓冲液 | Tsingke | TSJ010 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| NDNF抗体 | Abcam | ab177456 | |
| Myc抗体 | Sigma | 05-419 | |
| pS6抗体 | Cell Signaling | 5364 | |
| S6抗体 | Cell Signaling | 2317 | |
| 肌动蛋白抗体 | Millipore | MAB1501 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠二抗 | Beyotime | A0216 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔二抗 | Beyotime | A0208 | |
| 行为分析 | Catwalk步态分析系统 | -- | -- |
| 免疫染色 | DAPI | Beyotime | C1002 |
| ChAT抗体 | Millipore | Ab1449 | |
| NeuN抗体(小鼠) | Millipore | MAB377 | |
| NeuN抗体(大鼠) | oasis Biofarm | OB-PRT013-01 | |
| GFP抗体 | Aves | GFP-1020 | |
| Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 2278S | |
| S100抗体 | Dako | Z0311 | |
| 神经丝抗体 | Biolegend | 837904 | |
| 突触素-1抗体 | Cell Signaling | 5297S | |
| 泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP | |
| GFAP抗体 | Dako | Z0334 | |
| Iba1抗体 | Abcam | Ab283346 | |
| pS6抗体 | Cell Signaling | 5364 | |
| Alexa Fluor 488标记的驴抗小鼠二抗 | Invitrogen | A21202 | |
| Alexa Fluor 488标记的驴抗鸡二抗 | Jackson Laboratories | 703-546-155 | |
| Alexa Fluor 555标记的驴抗兔二抗 | Invitrogen | A31572 | |
| Alexa Fluor 555标记的驴抗大鼠二抗 | Invitrogen | A48270 | |
| Alexa Fluor 555标记的驴抗山羊二抗 | Invitrogen | A21432 | |
| Alexa Fluor 647标记的驴抗兔二抗 | Invitrogen | A32795 | |
| Alexa Fluor 647标记的驴抗山羊二抗 | Invitrogen | A21447 | |
| 免疫染色封闭 | 牛血清白蛋白 | Sigma | #V900933 |
| 免疫染色封片 | 封片剂 | DAKO | S3023 |
| NMJ染色 | α-银环蛇毒素 | Biotium | 00005 |
| CSF检测 | ELISA试剂盒 | Jining Shiye | JN823680 |
| 组织切片 | 冷冻切片机 | Leica | CryoStar NX50 |
| RNAscope | Ndnf探针 | ACD | 447471-C1 |
| Chat探针 | ACD | 40831-C2 | |
| RNA-seq | Illumina NovaSeq PE150测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型和分组 | SOD1G93A小鼠的性别分布、年龄和分组数量 阅读提示:Materials and methods: Animals; Figure legends |
| AAV注射 | AAV剂量、注射时间点(P61, P85, P105, P100-110)、注射体积和注射部位 阅读提示:Materials and methods: Intrathecal injection; Figure legends |
| 行为学检测 | Catwalk步态分析的训练和测试方案、记录次数和有效性标准 阅读提示:Materials and methods: Behavior analysis |
| 组织学分析 | 切片厚度、染色抗体及稀释比例、显微镜设置 阅读提示:Materials and methods: Immunostaining and RNAscope |