临床相关性分析
评估巨噬细胞浸润与癌症早期复发和血管侵犯的关联性。
分析431例HCC患者及TCGA 20种癌症4145例数据中CD68+巨噬细胞浸润与复发、血管侵犯的相关性。
miRNome targeting NF-κB signaling orchestrates macrophage-triggered cancer metastasis and recurrence
包含临床样本分析、细胞系体外迁移实验、小鼠原位肝癌模型以及机制验证(双荧光素酶报告、Western blot)等层级。
人肝癌细胞系HepG2 人正常肝细胞HL-7702 小鼠肝癌细胞系Hepa1-6 C57BL/6小鼠原位肝癌模型
DICER1表达与巨噬细胞浸润对早期复发和血管侵犯的交互影响 TAM-CM刺激后NF-κB RELA核转位及细胞迁移 miR-26b-5p对TAK1和TAB3 3'UTR的荧光素酶活性影响 miR-26b-5p在体内对肝转移的抑制作用 巨噬细胞耗竭或TNF-α/IL-1β敲低对肝转移的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估巨噬细胞浸润与癌症早期复发和血管侵犯的关联性。
分析431例HCC患者及TCGA 20种癌症4145例数据中CD68+巨噬细胞浸润与复发、血管侵犯的相关性。
验证巨噬细胞条件培养基(TAM-CM)对肝癌细胞迁移的影响及细胞异质性。
用TAM-CM处理多种肝癌细胞和正常肝细胞,检测迁移能力变化。
明确Dicer表达是否决定巨噬细胞诱导的迁移。
在HL-7702中敲低DICER1,在HepG2中过表达DICER1,检测迁移变化。
验证TAM-CM是否激活NF-κB信号,并受Dicer表达影响。
检测TAM-CM处理后RELA磷酸化及核转位。
鉴定靶向NF-κB信号的miRNA及其直接靶基因。
筛选下调miRNA,验证miR-26b-5p对TAK1/TAB3的靶向作用。
验证巨噬细胞来源的TNF-α和IL-1β参与促转移作用。
用重组细胞因子刺激细胞,并用中和抗体阻断。
评估Dicer或miR-26b-5p对小鼠肝癌转移的影响。
将改装细胞原位接种小鼠肝脏,注射巨噬细胞耗竭抗体或siRNA脂质体,分析肺转移。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞迁移实验 | Boyden腔 | Corning | 3422 |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| ECL试剂盒 | -- | -- | |
| 实时PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| MMLV逆转录酶 | Yeasen | -- | |
| SYBR Green实时PCR预混液 | Abm | -- | |
| miRNA检测 | Taqman miRNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4366596 |
| TaqMan MicroRNA检测试剂盒 | Applied Biosystems | A25576 | |
| RNA干扰 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778150 |
| 基因过表达 | pCDH-CMV-MCS-EF1α-GreenPuro载体 | System Biosciences | -- |
| 病毒包装 | psPAX2包装质粒 | Addgene | -- |
| pVSV-G包膜质粒 | Addgene | -- | |
| 聚乙烯亚胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 慢病毒转导 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | H9268 |
| 双荧光素酶报告 | pGL3cm载体 | Promega | -- |
| pRL-TK载体 | Promega | -- | |
| 动物实验 | 抗CSF1R抗体 | -- | -- |
| 基质胶 | R&D Systems | 3432-005-01 | |
| 脂质体制备 | DOTAP脂质 | Avanti Lipids | 790310 |
| 胆固醇 | -- | -- | |
| DPPC | Avanti | 850355P | |
| DOPC | Avanti | 850375P | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | eBioscience | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 巨噬细胞浸润指标(CD68)与患者早期复发、血管侵犯的关联;DICER1表达分层 阅读提示:Methods: Patients and specimens; Figure legends 1 and 2 |
| 细胞迁移实验 | TAM-CM处理浓度和时间(24小时);细胞数量(3×10^4) 阅读提示:Methods: Cell migration assay; Figure legends 1 and 4 |
| Dicer表达调控 | shDICER1和DICER1过表达载体构建与转导效率 阅读提示:Methods: Construction of viral vectors and shDICER1 or DICER1 cell lines |
| NF-κB激活检测 | RELA磷酸化检测时间点(30分钟);抗体和条件 阅读提示:Methods: Immunoblotting; Figure legends 3 and 5 |
| miRNA靶点验证 | 双荧光素酶报告基因检测条件(共转染量、时间) 阅读提示:Methods: Vectors and luciferase reporter assay; Figure legend 5 |
| 炎症因子刺激 | TNF-α和IL-1β浓度(20 ng/mL)及处理时间 阅读提示:Methods: Cell migration assay; Figure legend 6 |
| 体内动物模型 | 细胞接种数量(1×10^6)、αCSF1R抗体剂量(8 mg/kg)和给药时间 阅读提示:Methods: Animal experiments; Figure legends 7 |