验证PBX1在ALI中的表达变化
探究PBX1在ALI患者和模型中的表达水平是否改变。
检测肺炎患者外周血、LPS诱导的A549细胞和小鼠肺组织中PBX1的表达。
TAT-PBX1 fusion protein alleviates LPS-induced acute lung injury via AMPK-TFAM signaling activation
包含临床样本、体外细胞模型、小鼠ALI模型和PF模型,并进行了功能验证(过表达、敲低、抑制剂)和机制验证(Western blot、coIP)。
A549细胞 LPS诱导的ALI小鼠模型 BLM诱导的肺纤维化小鼠模型 肺炎患者外周血样本
LPS诱导ALI模型:小鼠气管滴注LPS 10 mg/kg,处理24小时 TAT-PBX1给药:腹腔注射10 mg/kg,在LPS处理前3小时预防性给药 AMPK抑制剂Dorsomorphin:给药剂量25 mg/kg,在TAT-PBX1处理前1小时给药 体外细胞实验:A549细胞用TAT-PBX1 80 μg/mL预处理3小时,再用LPS 40 μg/mL处理24小时 BLM诱导PF模型:小鼠气管滴注BLM 5 mg/kg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究PBX1在ALI患者和模型中的表达水平是否改变。
检测肺炎患者外周血、LPS诱导的A549细胞和小鼠肺组织中PBX1的表达。
验证PBX1是否具有抗炎作用。
构建PBX1过表达的A549细胞系,检测LPS刺激后炎症因子水平。
制备并验证TAT-PBX1融合蛋白的正确性和安全性。
构建pTAT-HA-PBX1载体,表达并纯化TAT-PBX1,通过SDS-PAGE、Western blot、动态光散射、稳定性和毒性实验进行表征。
验证TAT-PBX1能进入细胞并分布到肺组织。
用FITC标记TAT-PBX1观察细胞摄取,用Cy5.5标记进行小动物活体成像观察组织分布。
评估TAT-PBX1对ALI的治疗效果。
在A549细胞和LPS诱导的ALI小鼠模型中,检测炎症因子、ROS、MMP、细胞凋亡、肺水肿和病理损伤。
探究TAT-PBX1是否通过恢复线粒体功能抑制cGAS-STING通路。
透射电镜观察线粒体形态,检测ATP、NAD+/NADH水平,Western blot检测cGAS-STING通路蛋白。
验证TAT-PBX1是否通过激活AMPK通路发挥保护作用。
使用AMPK抑制剂Dorsomorphin处理小鼠,评估肺损伤和AMPK通路蛋白变化。
确认TAT-PBX1与AMPKγ2的相互作用及其功能相关性。
利用AlphaFold3预测蛋白相互作用,coIP验证,siRNA敲低AMPKγ2后在细胞中验证TAT-PBX1的效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L2880 |
| PF模型建立 | 博来霉素 | Yuanye | S17100 |
| Western blot | 抗STING抗体 | Proteintech | 19851-1-AP |
| 抗AMPKγ2抗体 | Proteintech | 12568-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-IG | |
| 抗6×His抗体 | Proteintech | 66005-1-IG | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 20536-1-AP | |
| 抗TFAM抗体 | Immunoway | YM8380 | |
| 抗TBK1抗体 | Abcam | ab40676 | |
| 抗cGAS抗体 | Cell Signaling Technology | 79978 | |
| 抗IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 4302 | |
| 抗磷酸化IRF3 (Ser396)抗体 | Cell Signaling Technology | 29047 | |
| 抗磷酸化TBK1 (Ser172)抗体 | Cell Signaling Technology | 5483 | |
| 抗AMPK抗体 | Huabio | SU03-48 | |
| 免疫组织化学 | 抗α-SMA抗体 | Huabio | SY02-64 |
| Western blot | 抗PGC-1α抗体 | Huabio | ET1702-96 |
| 抗PBX1抗体 | Huabio | ER1914-79 | |
| 抗磷酸化AMPK (Thr172)抗体 | Affinity | AF3423 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| 质粒提取 | 质粒小提试剂盒 | Tiangen | DP123 |
| ELISA | 人TNF-α ELISA试剂盒 | Colorful-Gene Biotech | JYM0110Hu |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | Colorful-Gene Biotech | JYM0083Hu | |
| 人IL-6 ELISA试剂盒 | Colorful-Gene Biotech | JYM0140Hu | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Colorful-Gene Biotech | JYM0218Mo | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Colorful-Gene Biotech | JYM0531Mo | |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Colorful-Gene Biotech | JYM0012Mo | |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Sigma | D6883-50MG |
| MMP检测 | JC-1荧光染料 | Macklin | E899600 |
| 细胞染色 | 瑞氏-吉姆萨染料 | Solarbio | G1020 |
| 生化检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0026 |
| NAD+/NADH定量试剂盒 | Beyotime | S0175 | |
| 凋亡检测 | TUNEL试剂盒 | Beyotime | C1088 |
| 组织处理 | 蛋白酶K | Beyotime | ST532 |
| 免疫染色 | 免疫染色洗涤液 | Beyotime | P0106 |
| 封片 | 抗荧光淬灭封片液 | Beyotime | P0126 |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Seven Biotech | SW104-01 |
| Western blot | 增强化学发光Western blot试剂盒 | Yeasen | 36208ES60 |
| 细胞标记 | 异硫氰酸荧光素 | Yeasen | 60514ES60 |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC/7AAD试剂盒 | Multi Sciences | AT105 |
| 活体成像 | Cy5.5荧光染料 | BLT | FD-CY5501 |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA重力亲和层析系统 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ALI小鼠模型建立 | LPS剂量:10 mg/kg,给药方式:气管滴注,处理时间:24小时;小鼠品系:C57BL/6J,雄性,6-8周龄 阅读提示:见Methods中'Animals'部分 |
| TAT-PBX1给药方案 | 剂量:10 mg/kg,给药方式:腹腔注射,预防性给药时间:LPS前3小时 阅读提示:见Methods中'Animals'部分 |
| AMPK抑制剂处理 | Dorsomorphin剂量:25 mg/kg,给药方式:腹腔注射,给药时间:TAT-PBX1前1小时 阅读提示:见Methods中'Animals'部分 |
| 细胞实验处理 | A549细胞培养基:DMEM高糖+10%FBS;TAT-PBX1浓度:80 μg/mL,处理时间:3小时;LPS浓度:40 μg/mL,处理时间:24小时 阅读提示:见Methods中'Cell culture and treatment'部分 |
| BLM诱导PF模型 | BLM剂量:5 mg/kg,给药方式:气管滴注;TAT-PBX1剂量:10 mg/kg,腹腔注射,BLM前3小时预防性给药,之后每隔2天注射一次,持续21天或35天 阅读提示:见Methods中'Animals'部分 |