玉米EMF2b-1通过招募PRC2调控胚乳细胞周期

EMF2b-1 regulates endosperm cell cycling through PRC2 recruitment in maize

作者信息Jiameng Xu, Ying Zhang, Ke Qing, Nianguo Xue, Jie Chen, Xu Zhang, Wenjing Zhao, Xing Tian, Hengyu Yan, Yubin Li, Jiaqiang Dong
PMID41904579
发布时间2026-03-28
DOI10.1186/s13059-026-04049-3

摘要

背景:Polycomb抑制复合物2(PRC2)通过建立H3K27me3修饰调控基因表达,但其在大型作物基因组中的靶向机制尚不清楚。谷物胚乳发育依赖于有丝分裂和核内复制的紧密协调转换,这对最终籽粒大小至关重要。本文鉴定出玉米SUZ12同源蛋白EMF2b-1是胚乳细胞周期和籽粒生长的关键调控因子。结果:EMF2b-1的功能缺失突变导致籽粒变小和核内复制增强。emf2b-1突变体表现出细胞尺寸减小和细胞分化延迟,同时H3K27me3水平显著下降。转录组和H3K27me3 ChIP-seq分析鉴定出353个下游靶基因,其H3K27me3水平降低且表达上调,其中98个直接靶基因富集于细胞周期和核内复制功能。值得注意的是,籽粒大小调控因子ZmDA1(一个抑制细胞分裂并促进核内复制的DA1同源基因)是EMF2b-1-PRC2复合物的直接靶标,在emf2b-1突变体中上调,这与其限制籽粒大小的已知功能一致。进一步的基序富集和EMF2b-1免疫沉淀-质谱分析表明,胚乳特异性转录因子BZR1-9招募EMF2b-1-PRC2复合物至ZmDA1位点,从而抑制其表达以调控细胞周期和核内复制。结论:这些发现证明EMF2b-1对玉米胚乳发育过程中的细胞周期至关重要,并揭示了一种转录因子引导的PRC2招募机制,这是一种与拟南芥和果蝇中Polycomb靶向机制平行的进化保守策略。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
Megazyme总淀粉检测试剂盒MegazymeKTSTA-50A
BCA蛋白定量试剂盒EpizymeZJ102
Leica RM2265LeicaRM2265
Leica MZ10 F显微镜LeicaMZ10 F
Facscan激光流式细胞仪Becton Dickinson--
Qsep400仪器--Qsep400
VAHTS mRNA-seq V8文库制备试剂盒Vazyme--
Illumina NovaSeq 6000IlluminaNovaSeq 6000
BGI2000平台BGI2000
Vazyme CUT&Tag检测试剂盒VazymeTD903
NEXTFLEX® ChIP-Seq试剂盒Bioo ScientificNOVA-5143–02
UltiMate 3000 RSLCnano系统Thermo Fisher Scientific3000 RSLCnano
Q Exactive HF质谱仪Thermo Fisher ScientificQ Exactive HF
UltiMate 3000 RSLCnano系统耦合Q Exactive HF质谱仪Thermo Fisher Scientific--