药物筛选鉴定氟西汀
鉴定能够增强MPS-IIIA细胞溶酶体降解能力的FDA批准药物。
使用DQ-BSA高内涵筛选实验,对1280种FDA批准药物进行筛选,鉴定出氟西汀能够显著增加MPS-IIIA MEFs中DQ-BSA的降解。
Fluoxetine ameliorates mucopolysaccharidosis type IIIA
体外细胞实验、体内小鼠模型、行为学测试、机制研究等多个证据层级,并包含功能验证和机制验证。
MPS-IIIA小鼠胚胎成纤维细胞(MPS-IIIA MEFs) HeLa TFEB-GFP细胞 ARPE-19-LC3串联荧光细胞 MPS-IIIA小鼠模型
MPS-IIIA小鼠胚胎成纤维细胞(MPS-IIIA MEFs) 氟西汀处理浓度(如5 μM,用于体外实验) 小鼠腹腔注射剂量10 mg/kg,隔天一次,从6月龄至8月龄 DQ-BSA降解实验用于检测溶酶体降解能力 TFEB核转位检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能够增强MPS-IIIA细胞溶酶体降解能力的FDA批准药物。
使用DQ-BSA高内涵筛选实验,对1280种FDA批准药物进行筛选,鉴定出氟西汀能够显著增加MPS-IIIA MEFs中DQ-BSA的降解。
评估氟西汀是否在体外诱导自噬。
在MPS-IIIA MEFs中,检测氟西汀处理后的自噬标志物,如LC3脂化、p62降解、WIPI2斑点形成,以及LC3与LAMP-1共定位。
验证氟西汀是否通过溶酶体胞吐减少MPS-IIIA MEFs中的HS积累。
免疫荧光检测HS与LAMP-1共定位,观察溶酶体分布变化,并检测培养上清中组织蛋白酶D的释放。
确定氟西汀是否通过激活TFEB发挥溶酶体功能增强作用。
检测氟西汀处理后TFEB的核转位、去磷酸化及靶基因表达,并在TFEB/TFE3敲除细胞和RagC组成性激活突变体中验证。
评估氟西汀在MPS-IIIA小鼠中的病理改善效果。
对6月龄的MPS-IIIA小鼠进行氟西汀治疗(10 mg/kg,隔天一次,持续2个月),分析肝脏和脑组织的病理变化,包括GAG积累、溶酶体空泡化、自噬底物积累、神经炎症,并进行行为学测试。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物筛选 | Prestwick化学库 | Prestwick Chemical | -- |
| 药物处理 | 盐酸氟西汀 | Sigma-Aldrich | -- |
| Torin-1 | Tocris Bioscience | -- | |
| 巴弗洛霉素A1 | Sigma-Aldrich | -- | |
| BAPTA-AM | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 洋地黄皂苷 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| HBSS缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| HEPES缓冲液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Lipofectamine转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Lipofectamine Stem转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Plus Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| 逆转录 | QuantiTect逆转录试剂盒 | Qiagen | -- |
| 实时定量PCR | LightCycler 2.0实时荧光定量PCR仪 | Roche Applied Science | -- |
| DQ-BSA实验 | DQ Red BSA | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Hoechst染料 | Invitrogen | -- | |
| 绿色BSA | Invitrogen | -- | |
| 免疫荧光 | 抗HS抗体 | US Biological/Amsbio | -- |
| 抗LAMP-1抗体 | Santa Cruz | sc-19992 | |
| 抗WIPI2抗体 | Abcam | ab105459 | |
| 抗LC3抗体 | MBL | PM036 | |
| 抗HA标签抗体 | Biolegend | 901501 | |
| 抗CD68抗体 | AbD Serotec | -- | |
| 抗TFEB抗体 | Bethyl Laboratories | A303-673A | |
| 免疫沉淀及Western blot | 抗β-actin抗体 | Santa Cruz | SC 47778 |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz | sc-32233 |
| 抗Vinculin抗体 | Sigma-Aldrich | V9264 | |
| 抗LC3抗体 | Novus Biologicals | NB100-2220 | |
| 抗TFEB-pSer142抗体 | EMD-Millipore | ABE1971 | |
| 抗TFEB-pS211抗体 | Bethyl Laboratories | Custom | |
| 抗p62抗体 | BD | 610833 | |
| 抗磷酸化4E-BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 9456S | |
| 抗4E-BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 9644S | |
| 抗磷酸化p70 S6激酶抗体 | Cell Signaling Technology | 9205 | |
| 抗p70 S6激酶抗体 | Cell Signaling Technology | 2708 | |
| 抗泛素抗体 | Novus Biologicals | NBP1-30030 | |
| 抗组织蛋白酶D抗体 | Santa Cruz | sc-10725 | |
| Luminata Crescendo Western HRP底物 | Millipore | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 组织裂解 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 组织匀浆 | 组织研磨仪 | Qiagen | -- |
| GAG定量 | Blyscan试剂盒 | Biocolor | -- |
| GAG染色 | 阿尔新蓝 | -- | -- |
| 组织固定 | Methacarn固定液 | -- | -- |
| 组织切片 | 切片机 | Leica | -- |
| 免疫组化 | VENTANA BenchMark Ultra自动染色仪 | Ventana Medical Systems | -- |
| EZ Prep溶液 | Ventana | 950-102 | |
| CC1抗原修复液 | Ventana | 950-224 | |
| ultra-view通用DAB检测试剂盒 | Ventana | 760-500 | |
| 蓝化试剂 | Ventana | 760-2037 | |
| DISCOVERY FAM试剂盒 | Ventana | 760-243 | |
| DISCOVERY QD DAPI | Ventana | 760-4196 | |
| 蔡司Axio Scan.Z1扫描仪 | ZEISS | -- | |
| 显微镜 | 蔡司LSM 700共聚焦显微镜 | ZEISS | -- |
| 高内涵筛选 | Opera高内涵成像系统 | PerkinElmer | -- |
| Columbus图像数据存储与分析系统 | PerkinElmer | -- | |
| 电镜 | FEI Tecnai-12透射电子显微镜 | FEI | -- |
| VELETTA CCD数字相机 | FEI | -- | |
| Leica EM UC7超薄切片机 | Leica | -- | |
| 行为学 | 条件化训练箱 | Ugo Basile | -- |
| ANY-maze视频追踪系统 | Stoelting | -- | |
| 图像分析 | ImageJ软件 | National Institutes of Health | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物筛选 | 筛选浓度(10 μM)、处理时间(3小时)、DQ-BSA浓度(10 μg/mL)、阳性对照Torin-1浓度(1 μM)、阴性对照BafA1浓度(200 nM)、细胞密度(3.2×10^3 cells/well)、筛选板型(384孔)、图像采集和分析参数 阅读提示:Materials and methods,DQ-BSA assay and screening部分;Figure 1 legend |
| 体外自噬检测 | 氟西汀浓度(5 μM)、处理时间(3-24小时)、BafA1浓度(200 nM,处理3小时)、细胞类型(MPS-IIIA MEFs, ARPE-19-LC3 Tandem cells)、LC3脂化检测条件 阅读提示:Results中“FLX induces autophagy in vitro”部分;Figure 2 legend;Materials and methods中“LC3 tandem assay”部分 |
| 溶酶体胞吐检测 | 氟西汀处理时间(24小时)、HS染色和共定位分析条件、LAMP-1分布分析参数、溶酶体到质膜距离的测量条件、组织蛋白酶D分泌检测条件 阅读提示:Results中“FLX reduces the accumulation of heparan sulfate”部分;Figure 3 legend;Materials and methods中“Western blotting”及“Protein concentration from growth medium”部分 |
| TFEB机制研究 | 氟西汀浓度(5 μM)和处理时间(3小时)、TFEB核转位检测方法、TFEB磷酸化检测、siRNA序列及浓度(40 nM)、转染试剂及方法、RagC突变体质粒 阅读提示:Results中“FLX promotes lysosomal clearance through the activation of TFEB”和“FLX induces TFEB through the inhibition of mTORC1 via a Rag-dependent mechanism”部分;Figure 4 legend;Materials and methods中“TFEB nuclear translocation assay”及“Cellular models, drug treatments, plasmids, and small interfering RNAs (siRNAs) transfection”部分 |
| 体内实验 | 小鼠品系(B6Cg-Sgsh[mps3a/PstJ])、年龄(6月龄开始治疗)、给药途径(腹腔注射)、剂量(10 mg/kg)、频率(隔天一次)、持续时间(2个月)、样本量(每组5-9只)、组织处理和分析方法 阅读提示:Results中“FLX ameliorates the liver phenotype of MPS-IIIA mice”和“FLX ameliorates the neuropathology in MPS-IIIA mice”部分;Figure 5-8 legends;Materials and methods中“Mice”、“Treatments and tissue collection”部分 |