探索高糖诱导系膜细胞凋亡的潜在miRNA
通过转录组测序筛选高糖处理下系膜细胞中差异表达的miRNA,并预测其可能参与的病理功能。
对小鼠系膜细胞进行正常糖(5.5 mM)或高糖(25 mM)处理48小时,利用下一代测序分析miRNA表达谱,通过生物信息学预测miR-15b-5p的靶基因及功能。
High Glucose Induces Mesangial Cell Apoptosis through miR-15b-5p and Promotes Diabetic Nephropathy by Extracellular Vesicle Delivery
包含体外细胞实验(miRNA mimic/inhibitor、双荧光素酶报告基因)、动物模型(db/db小鼠)及临床患者样本,并进行了功能验证和机制验证。
小鼠系膜细胞(MMC,CRL1927) HEK293细胞 db/db小鼠(2型糖尿病模型) 2型糖尿病患者尿液及肾组织样本
高糖浓度:25 mM葡萄糖处理小鼠系膜细胞48小时 miR-15b-5p mimic(200 nM)和inhibitor(50 nM)的转染浓度及时间 BCL-2作为miR-15b-5p直接靶点的双荧光素酶报告基因验证 尿细胞外囊泡miR-15b-5p水平与ACR、eGFR及肾功快速下降的关联分析 患者随访时间(平均2.4±0.1年)及快速肾功能下降定义(eGFR下降>3 mL/min/1.73m²/年)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过转录组测序筛选高糖处理下系膜细胞中差异表达的miRNA,并预测其可能参与的病理功能。
对小鼠系膜细胞进行正常糖(5.5 mM)或高糖(25 mM)处理48小时,利用下一代测序分析miRNA表达谱,通过生物信息学预测miR-15b-5p的靶基因及功能。
验证miR-15b-5p是否介导高糖诱导的系膜细胞凋亡。
转染miR-15b-5p mimic或inhibitor,通过流式细胞术检测细胞凋亡。
确定BCL-2是否为miR-15b-5p的直接靶基因,并检测其在高糖条件下的表达变化。
使用生物信息学预测(miRmap和TargetScan)和双荧光素酶报告基因实验验证BCL-2为直接靶点;Western blot检测BCL-2蛋白表达。
分析尿细胞外囊泡中miR-15b-5p水平与糖尿病肾病进展的关系。
收集2型糖尿病患者和健康对照的尿液,分离细胞外囊泡,通过qRT-PCR检测miR-15b-5p水平,并分析其与ACR、eGFR及肾功能下降速度的相关性。
检测来自2型糖尿病患者的尿液细胞外囊泡是否促进系膜细胞凋亡。
用从健康个体和2型糖尿病患者尿液中分离的细胞外囊泡处理小鼠系膜细胞,检测凋亡率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基(DMEM) | Gibco | -- |
| 胎牛血清(FBS) | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| TRIzol LS试剂 | Life Technologies | -- | |
| miRNA逆转录 | Mir-X miRNA第一链合成试剂盒 | Takara | catalog #638313 |
| qRT-PCR | QuantStudio 3实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | catalog #13778075 |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC和碘化丙啶(PI)染色试剂盒 | Cell Signaling Technology | catalog #6592 |
| BD Accuri C6流式细胞仪 | BD | -- | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解缓冲液 | EMD Millipore | -- |
| Western blot | BCL-2抗体 | Cell Signaling Technology | catalog #3498s |
| GAPDH抗体 | Millipore | catalog #MAB374 | |
| HSP70、Tsg101、CD9、CD63、CD81抗体 | System Biosciences | catalog #EXOAB-KIT-1-SBI | |
| ProteinSimple/FluorChem Q系统 | Alpha Innotech | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | DharmaFECT Duo转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | catalog #T-2010-03 |
| Dual-Glo荧光素酶检测系统 | Promega | -- | |
| 免疫组化 | BCL-2抗体 | Proteintech | 12789-1-AP |
| 抗α-SMA抗体 | Abcam | catalog #ab5694 | |
| 尿白蛋白检测 | Tina-quant白蛋白Gen.2(ALBT2) | Roche | -- |
| 尿肌酐检测 | 肌酐plus ver.2(CREP2) | Roche | -- |
| 血清肌酐检测 | Roche/Integra 400分析仪 | Roche Diagnostics | -- |
| 尿细胞外囊泡RNA提取 | 尿外泌体RNA提取试剂盒 | Norgen Biotek | catalog #47200 |
| 纳米颗粒跟踪分析 | ZetaView PMX120纳米颗粒分析仪 | Particle Metrix | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与高糖处理 | 小鼠系膜细胞系(CRL1927)的培养条件,高糖浓度(25 mM)和处理时间(48小时) 阅读提示:Materials and Methods: Cell Line and Cell Culture |
| miRNA转染 | miR-15b-5p mimic浓度(200 nM)和inhibitor浓度(50 nM),转染试剂和时间 阅读提示:Materials and Methods: Transient Transfection |
| 凋亡检测 | Annexin V/PI染色和流式细胞仪分析的具体步骤 阅读提示:Materials and Methods: Quantitation of Apoptosis |
| 靶点验证 | 双荧光素酶报告基因实验中质粒比例(8:1)和细胞系(HEK293) 阅读提示:Materials and Methods: 3' UTR Luciferase Reporter Assay |
| 动物模型 | db/db和db/m小鼠的年龄(5周龄)、性别(雄性)和样本收集时间(第12周) 阅读提示:Materials and Methods: Experimental Animals |
| 临床研究 | 患者入组标准(eGFR≥30)、样本量(85例糖尿病患者和38例对照)、随访时间(平均2.4±0.1年)和快速肾功能下降定义(eGFR下降>3 mL/min/1.73m²/年) 阅读提示:Materials and Methods: Human Study Participants, Measurement of Kidney Progression in Humans |