验证褪黑素对类器官的细胞命运调控
探究褪黑素是否影响肠道上皮细胞的命运,特别是诱导静止状态。
处理小鼠小肠类器官,观察形态变化、细胞死亡、增殖、细胞周期和p27表达,进行转录组分析。
Melatonin-inspired hybrid spheroids accelerate intestinal repair via YAP-driven fetal reprogramming
体外类器官培养、基因芯片与scRNA-seq、细胞功能实验证实褪黑素作用,并构建Mel-HS进行体内DSS结肠炎模型验证,包含功能与机制验证。
小鼠小肠类器官(mSIOs) DSS诱导结肠炎小鼠模型 人脐带血来源间充质干细胞(UCB-MSCs) 人扁桃体来源间充质干细胞(T-MSCs)
Mel-HS中Mel-MS浓度:0.7 µg DSS浓度:2.5%(w/v) 给药时间点:DAY 1或DAY 5 给药剂量:2×10^3个3D-MSCs或Mel-HS,或1.4 mg Mel-MS(200 µL PBS) 样本量:各处理组小鼠数量(PBS n=20,MS n=16,3DU n=21,3DT n=10,HSU n=20,HST n=10)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究褪黑素是否影响肠道上皮细胞的命运,特别是诱导静止状态。
处理小鼠小肠类器官,观察形态变化、细胞死亡、增殖、细胞周期和p27表达,进行转录组分析。
评估褪黑素预处理是否能增强类器官在炎症损伤后的恢复能力。
用cytomix(IFN-γ、TNF-α和IL-1β混合物)损伤类器官,比较褪黑素预处理和未处理组的恢复、增殖和出芽情况。
确定褪黑素如何影响YAP信号通路,包括亚细胞定位和蛋白表达。
在不同时间点处理类器官,检测YAP的核定位、磷酸化状态和靶基因表达。
制备负载褪黑素的PLGA微球,并将其与MSCs结合形成异质球体,评估其理化性质和功能。
使用乳化溶剂蒸发法制备Mel-MS,表征尺寸、包封率、释放曲线;将Mel-MS与MSCs共培养形成Mel-HS,评估细胞活力和PGE2分泌。
评估Mel-HS(或其条件培养基)能否增强RSC诱导并保护类器官免受损伤。
将类器官与Mel-HS共培养或使用其条件培养基,检测RSC标记基因和Sca1+细胞比例;使用5-FU和cytomix诱导损伤,评估细胞活力和恢复。
评估Mel-HS在DSS诱导的结肠炎中的治疗和预防作用,并探索其免疫调节和再生机制。
DSS诱导结肠炎,在第1天或第5天腹腔注射3D-MSCs或Mel-HS,监测体重、存活率、DAI、结肠长度、组织学评分,并分析免疫细胞浸润、细胞因子水平和上皮再生标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 褪黑素 | MedChemExpress | -- |
| 2-碘褪黑素 | MedChemExpress | -- | |
| 前列腺素E2 | MedChemExpress | -- | |
| 5-氟尿嘧啶 | MedChemExpress | -- | |
| 材料制备 | 聚乳酸-乙醇酸共聚物 | Sigma-Aldrich | -- |
| 聚乙烯醇 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞因子处理 | 重组干扰素-γ | PeproTech | -- |
| 重组白细胞介素-1β | PeproTech | -- | |
| 重组肿瘤坏死因子-α | PeproTech | -- | |
| 细胞培养 | 间充质干细胞(脐带血和扁桃体来源) | -- | -- |
| MEM-α培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞消化 | TrypLE消化液 | Gibco | -- |
| 3D培养 | AggreWell™400 | STEMCELL Technologies | -- |
| 动物模型 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | -- |
| C57BL/6小鼠 | Orient Bio | -- | |
| 流式分析 | Click-iT EdU流式细胞术检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| SYTOX试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| CellROX试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞核染色 | Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 酶活性检测 | MPO活性检测试剂盒 | Abcam | -- |
| RNA提取 | RNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green试剂 | iNtRON Biotechnology | -- |
| 蛋白提取 | PRO-PREP裂解缓冲液 | iNtRON Biotechnology | -- |
| Western blot | Arx抗体 | ABclonal | -- |
| Epcam抗体 | ABclonal | -- | |
| 溶菌酶抗体 | ABclonal | -- | |
| Muc2抗体 | ABclonal | -- | |
| cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| E-钙粘蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 非磷酸化YAP抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化YAP抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 总YAP抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | -- | |
| 免疫荧光 | Ki-67抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Reg3β抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Olfm4抗体 | Abcam | -- | |
| 流式分析 | Ly6a-FITC抗体 | BioLegend | -- |
| Ly6a-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| Fc受体阻断剂 | Miltenyi Biotec | -- | |
| CD45-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD31-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| TER-119-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD326-APC抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 组织包埋 | OCT包埋剂 | Sakura Finetek | -- |
| 材料表征 | 扫描电子显微镜(JSM-IT 800) | JEOL | -- |
| 成像分析 | BioTek Cytation 5 细胞成像多功能检测仪 | Agilent | -- |
| RT-qPCR | ABI 7500 实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| 流式分析 | BD Accuri™ C6 Plus 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 统计绘图 | GraphPad Prism 9 软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 类器官培养与处理 | 褪黑素、PGE2、2I、8M的处理浓度和时间;细胞因子浓度 阅读提示:Materials and methods 2.2 |
| Mel-MS的制备与表征 | PLGA和褪黑素比例、PVA浓度、乳化参数、微球粒径、载药量、包封率、释放曲线 阅读提示:Materials and methods 2.5 |
| Mel-HS的构建 | 每球细胞数、Mel-MS用量、细胞来源 阅读提示:Materials and methods 2.6 |
| DSS结肠炎模型 | DSS浓度、给药周期、小鼠品系、性别、年龄、分组、给药剂量和途径 阅读提示:Materials and methods 2.7 |
| 体内RSC检测 | EdU给药剂量和时间、组织解离方法、抗体组合、Sca1+细胞检测策略 阅读提示:Materials and methods 2.10, 2.11 |