测量TME中营养物质的丰度
确定肿瘤微环境中间质液中葡萄糖、谷氨酰胺和乳酸的浓度是否受限。
通过质谱分析人肾细胞癌和鼠MC38肿瘤间质液中的代谢物。
Cell-programmed nutrient partitioning in the tumour microenvironment
包含体内PET示踪剂摄取实验、体外代谢分析、转录组分析、药物处理等多层级验证,并有人类样本验证。
MC38小鼠结肠癌模型 CT26小鼠结肠癌模型 Renca小鼠肾癌模型 AOM/DSS诱导的结肠癌模型 PyMT转基因乳腺癌模型
不同肿瘤模型中CD45+免疫细胞与CD45-癌细胞FDG摄取比较 mTORC1信号在髓系细胞中的激活状态及雷帕霉素处理的影响 谷氨酰胺摄取抑制剂V9302处理对细胞亚群葡萄糖和谷氨酰胺摄取的影响 FDG和18F-Gln摄取的细胞亚群贡献比例
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定肿瘤微环境中间质液中葡萄糖、谷氨酰胺和乳酸的浓度是否受限。
通过质谱分析人肾细胞癌和鼠MC38肿瘤间质液中的代谢物。
量化肿瘤浸润免疫细胞和癌细胞对葡萄糖的体内摄取能力。
使用18F-FDG PET成像和细胞分级分离(CD45磁珠)测量MC38、CT26、Renca、AOM/DSS和PyMT模型中不同细胞亚群的FDG摄取。
确定哪种浸润免疫细胞亚群葡萄糖摄取最高。
使用CD11b、Gr1、F4/80、CD11c磁珠分选MC38肿瘤中的髓系细胞和树突状细胞,并测量FDG摄取。
测试mTORC1通路是否调节TME中髓系细胞和癌细胞的葡萄糖摄取。
用雷帕霉素(mTORC1抑制剂)处理MC38荷瘤小鼠,测量pS6水平、FDG摄取、细胞外通量(ECAR/OCR)和代谢基因表达。
确定谷氨酰胺在TME中的摄取是否与葡萄糖不同。
使用18F-Gln PET示踪剂测量MC38、CT26、Renca和AOM/DSS肿瘤中不同细胞亚群的谷氨酰胺摄取。
验证谷氨酰胺代谢是否抑制葡萄糖摄取。
用谷氨酰胺转运抑制剂V9302处理MC38荷瘤小鼠,测量各细胞亚群的FDG和18F-Gln摄取。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织消化 | 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | D5025 |
| 胶原酶 | Sigma-Aldrich | C2674 | |
| 细胞分离 | Ficoll-Paque | GE Healthcare | 17144002 |
| SepMate-50管 | Stemcell Technologies | 85450 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 雷帕霉素 | Sigma Aldrich | 202371 |
| V9302 | -- | -- | |
| PET成像 | 18F-氟代脱氧葡萄糖 | -- | -- |
| 18F-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| Inveon微型PET | Siemens Preclinical | -- | |
| NanoSPECT/CT | Mediso | -- | |
| 细胞外通量分析 | Seahorse XFe 96生物分析仪 | Agilent | -- |
| Cell-Tak包被板 | Corning | 354240 | |
| 流式细胞术 | MACSQuant分析仪10或16 | Miltenyi | -- |
| Ghost Dye Red 780 | Cell Signaling | 18452S | |
| 免疫组织化学 | Leica Bond Max免疫组化染色机 | Leica | -- |
| Bond Refine检测系统 | -- | DS9800 | |
| 显微成像 | Olympus BX53显微镜 | Olympus | -- |
| Olympus DP73相机 | Olympus | -- | |
| 基因表达分析 | NanoString nCounter代谢通路基因表达面板 | NanoString | XT-CSO-MMP1-12 |
| 细胞分离 | CD45 TIL磁珠 | Miltenyi | 130-110-618 |
| EPCAM磁珠 | Miltenyi | 130-105-958 | |
| CD4/8 TIL磁珠 | Miltenyi | 130-116-480 | |
| CD11b磁珠 | Miltenyi | 130-049-601 | |
| F4/80磁珠 | Miltenyi | 130-110-443 | |
| Gr1磁珠 | Miltenyi | 130-094-538 | |
| CD11c磁珠 | Miltenyi | 130-125-835 | |
| LS柱 | Miltenyi | 130-042-401 | |
| QuadroMACS分离器 | Miltenyi | -- | |
| 细胞计数 | TC20自动细胞计数器 | Bio-Rad | -- |
| 放射性测量 | Hidex自动伽马计数器 | Hidex | -- |
| 放射性自显影 | Beta成像仪 | Biospacelabs | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 葡萄糖摄取测量 | FDG注射剂量、孵育时间、细胞分级方法(磁珠类型)、每细胞FDG摄取计算 阅读提示:Methods: 18F-FDG and 18F-Gln nutrient uptake assay |
| 谷氨酰胺摄取测量 | 18F-Gln注射剂量、孵育时间、细胞分级方法(磁珠类型)、每细胞18F-Gln摄取计算 阅读提示:Methods: 18F-FDG and 18F-Gln nutrient uptake assay |
| mTORC1抑制作用 | 雷帕霉素给药剂量(2mg/kg)、给药时间(4天)、给药途径(腹腔注射)、pS6检测 阅读提示:Methods: Mice; Figure 3, Extended Data Fig. 7 |
| 谷氨酰胺摄取抑制 | V9302给药剂量(25mg/kg或75mg/kg)、给药次数(bid或一次)、给药途径(腹腔注射) 阅读提示:Methods: Mice; Figure 4, Extended Data Fig. 10 |