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一个卫星重复序列衍生的piRNA调控埃及伊蚊胚胎发育
A satellite repeat-derived piRNA controls embryonic development of Aedes
摘要
串联重复元件，如多样化的卫星重复序列，占据了真核生物染色体的很大部分，主要位于着丝粒、近着丝粒、端粒和亚端粒区域。然而，一些元件位于整个基因组的常染色质区域，并被假设通过调节局部染色质结构在顺式调控基因表达，或通过重复序列衍生的转录本在反式调控基因表达。本研究显示，埃及伊蚊中的一个卫星重复序列通过表达两种PIWI相互作用RNA (piRNA) 促进序列特异性基因沉默。虽然卫星重复序列和piRNA序列通常进化极快，但该位点在大约2亿年间是保守的，这表明它在蚊子生物学中具有核心功能。piRNA的产生在产卵后不久开始，而更丰富的piRNA失活会导致合子中母源沉积的转录本降解失败和发育停滞。我们的结果揭示了一种机制，即卫星重复序列通过piRNA介导的基因沉默来反式调控全局基因表达，这对胚胎发育至关重要。
实验方法
产品清单
| 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|
| GeneElute总RNA小量提取试剂盒 | Sigma Aldrich | -- |
| X-tremeGENE HP转染试剂 | Roche | -- |
| 气动式微量注射泵PV820 | World Precision Instruments | -- |
| Nanodrop分光光度计 | -- | -- |
| Protein A/G Plus磁珠 | Santa Cruz | -- |
| Odyssey-CLx成像系统 | Li-Cor | -- |
| Hybond-NX尼龙膜 | GE Healthcare | -- |
| Carestream BioMax XAR X射线胶片 | Kodak | -- |
| Hybond-N+尼龙膜 | GE Healthcare | -- |
| Amersham Typhoon 5生物分子成像仪 | GE Healthcare | -- |
| Amersham Rediprime DNA标记系统II | GE Healthcare | -- |
| HD In-Fusion克隆试剂盒 | Takara | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| Modulus单管读数仪 | Turner Biosystems | -- |
| LightCycler480仪器 | Roche | -- |
| FirstChoice RLM-RACE试剂盒 | Thermo Fischer Scientific | -- |
| FemtoJet 4x | Eppendorf | -- |
| EVOS FL成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| TruSeq小RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- |
| Illumina HiSeq 4000测序仪 | Illumina | HiSeq 4000 |
| TruSeq链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- |