微生物群衍生的3-IAA影响胰腺癌的化疗疗效

Microbiota-derived 3-IAA influences chemotherapy efficacy in pancreatic cancer

作者信息Joseph Tintelnot, Yang Xu, Till R Lesker, Martin Schönlein, Leonie Konczalla, Anastasios D Giannou, Penelope Pelczar, Dominik Kylies, Victor G Puelles, Agata A Bielecka, Manuela Peschka, Filippo Cortesi, Kristoffer Riecken, Maximilian Jung, Lena Amend, Tobias S Bröring, Marija Trajkovic-Arsic, Jens T Siveke, Thomas Renné, Danmei Zhang, Stefan Boeck, Till Strowig, Faik G Uzunoglu, Cenap Güngör, Alexander Stein, Jakob R Izbicki, Carsten Bokemeyer, Marianne Sinn, Alec C Kimmelman, Samuel Huber, Nicola Gagliani
PMID36813961
期刊Nature
发布时间2023-03
DOI10.1038/s41586-023-05728-y

摘要

胰腺导管腺癌(PDAC)由于转移性疾病的高发率及对治疗反应有限,预计到2040年将成为第二大致命癌症。只有不到一半的患者对PDAC的主要治疗方法——化疗——有反应,而仅靠基因改变无法解释这一点。饮食是可能影响治疗反应的环境因素,但其在PDAC中的作用尚不清楚。本研究通过鸟枪法宏基因组测序和代谢组学筛选,发现对治疗有反应的患者体内微生物群衍生的色氨酸代谢物吲哚-3-乙酸(3-IAA)富集。在PDAC的人源化无菌小鼠模型中,粪便微生物群移植、短期饮食色氨酸调控以及口服3-IAA给药均能提高化疗疗效。通过功能缺失和功能获得实验,我们发现3-IAA和化疗的疗效是由中性粒细胞衍生的髓过氧化物酶介导的。髓过氧化物酶氧化3-IAA,与化疗结合后,诱导活性氧(ROS)降解酶谷胱甘肽过氧化物酶3和7的下调。这导致癌细胞中ROS积累和自噬下调,从而损害其代谢适应能力并最终抑制其增殖。在人类中,我们在两个独立的PDAC队列中观察到3-IAA水平与治疗疗效之间存在显著相关性。总之,我们鉴定出一种具有PDAC治疗临床意义的微生物群衍生代谢物,并为在癌症患者治疗期间考虑营养干预提供了依据。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
家庭采样试剂盒OMNIgeneGut OMR-200
基质胶Corning356231
BioBEAM 2000辐照仪--BioBEAM 2000
ZymoBIOMICS 96 MagBead DNA试剂盒Zymo ResearchD4302
Zymo DNA Clean and Concentrator-5Zymo ResearchD4004
NEBnext Ultra II DNA文库制备试剂盒(用于Illumina)New England BiolabsE7645
NEBNext Ultra II FS DNA文库制备试剂盒New England BiolabsE7805
AMPure XP磁珠Beckman CoulterA63882
Illumina NovaSeq测序仪IlluminaNovaSeq
DNeasy Blood & Tissue试剂盒Qiagen69504
SequalPrep Normalization Plate KitThermo Fisher ScientificA1051001
Illumina MiSeq v3测序仪IlluminaMiSeq v3
MxP Quant 500试剂盒Biocrates--
ACQUITY UPLC I-Class系统WatersACQUITY UPLC I-Class
Xevo TQ-S质谱仪WatersXevo TQ-S
UPLC–MS/MS系统----
C18液相色谱柱Biocrates--
FLUOstar Omega酶标仪BMG LabtechFLUOstar Omega
均质器Precyllys24 touch
Raptor Biphenyl色谱柱RestekRaptor Biphenyl
Fortessa流式细胞仪BDFortessa
eBioscience Foxp3细胞内染色试剂盒eBioscience00-5523-00
StepOne Plus系统Applied BiosystemsStepOne Plus
ASP300S脱水机LeicaASP300S
EG1160组织包埋系统LeicaEG1160
Ventana Benchmark XT仪VentanaBenchmark XT
Ultra View Universal DAB检测试剂盒Ventana--
NanoZoomer 2.0-HT扫描仪Hamamatsu PhotonicsNanoZoomer 2.0-HT
THUNDER Imager 3D Live Cell and 3D Cell Culture成像系统Leica MicrosystemsTHUNDER Imager 3D Live Cell and 3D Cell Culture