小鼠模型表型确认
确认Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠表现出ICI-MC的临床病理特征。
对Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠进行心脏组织H&E染色和免疫细胞流式分析,确认心肌炎表型及T细胞浸润。
T cells specific for α-myosin drive immunotherapy-related myocarditis
包含小鼠模型、单细胞RNA/TCR测序、抗体耗竭、过继转移、抗原筛选、MHC四聚体染色及患者样本验证等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠心肌炎模型 Rag1−/−小鼠过继转移模型 ICI-MC患者外周血及组织样本
Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠的基因型及心肌炎表型确认 CD8+ T细胞耗竭抗体(抗CD8,200μg,腹腔注射,每周三次) 过继转移中供体脾细胞的CD8耗竭及细胞数量(1×10^6) α-肌球蛋白肽库(172个重叠肽)及筛选浓度(10μg/mL) MHC-I限制性验证(H2-Kb阻断抗体)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠表现出ICI-MC的临床病理特征。
对Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠进行心脏组织H&E染色和免疫细胞流式分析,确认心肌炎表型及T细胞浸润。
表征心肌炎心脏中免疫细胞组成和TCR克隆性,鉴定主要致病细胞群。
对健康野生型和Pdcd1−/−Ctla4+/−心肌炎小鼠心脏CD45+免疫细胞进行单细胞RNA/TCR测序,分析细胞簇和TCR克隆性。
验证CD8+ T细胞在心肌炎发生中的必要性。
对Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠进行抗CD8或抗CD4抗体耗竭,观察生存率;并进行过继转移实验,将全脾细胞或CD8耗竭脾细胞转移至Rag1−/−小鼠,评估心肌炎诱导。
鉴定心肌炎TCR识别的同源抗原。
利用候选自身抗原方法,针对心肌富集且胸腺不表达的基因(MYH6, NPPA, NPPB, SBK2)合成重叠肽库,与TCR报告细胞和BMDC共培养,检测NFAT-GFP活性。
确认α-肌球蛋白肽的MHC-I限制性。
使用H2-Kb和H2-Db阻断抗体,验证TCR报告细胞对α-肌球蛋白肽的响应受MHC-I限制。
检测小鼠心脏浸润CD8+ T细胞对α-肌球蛋白肽的特异性。
使用负载α-肌球蛋白肽的H2-Kb四聚体对心肌炎小鼠心脏CD3+CD8+细胞进行染色。
评估α-肌球蛋白在人类ICI-MC中的相关性。
从ICI-MC患者和健康供者PBMC中扩增α-肌球蛋白特异性T细胞,进行TCR测序分析,并与组织TCR库比较;对患者1的TCR进行克隆和抗原鉴定。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 单细胞RNA/TCR测序 | 10X Chromium系统 | 10X Genomics | -- |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 免疫组化 | Leica Bond-Max免疫组化自动染色机 | Leica Biosystems | -- |
| 流式细胞术 | Attune NxT声波聚焦流式细胞仪 | Life Technologies | -- |
| 细胞分选 | WOLF细胞分选仪 | NanoCellect | -- |
| qPCR | CFX96 Touch实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- |
| 组织裂解 | TissueLyser II组织研磨仪 | Qiagen | -- |
| RNA提取 | Maxwell 16自动化工作站 | Promega | -- |
| 抗体耗竭 | 抗CD8耗竭抗体 | BioXCell | BE0061 |
| 抗CD4耗竭抗体 | BioXCell | BE0003-1 | |
| 过继转移 | CD8(TIL)磁珠,小鼠 | Miltenyi | 130-116-478 |
| 抗原发现 | 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | ProSpec | CYT-222 |
| PBMC扩增 | 重组人白细胞介素-2 | Peprotech | -- |
| 重组人白细胞介素-7 | Peprotech | -- | |
| 重组人白细胞介素-15 | Peprotech | -- | |
| CTS OpTmizer T细胞扩增无血清培养基 | Thermo Fisher Scientific | A1048501 | |
| TCR报告细胞 | Jurkat-TCR-ko-CD8+-NFAT-GFP报告细胞 | -- | -- |
| MSCV-IRES-Thy1.1 DEST载体 | Addgene | 17442 | |
| platA逆转录病毒包装细胞系 | Cell BioLabs | RV-102 | |
| 四聚体染色 | H-2Kb-PE四聚体 | Tetramer Shop | -- |
| 人四聚体染色 | easYmer HLA-A*03:01四聚体 | Eagle Biosciences | 1016-01-20 |
| easYmer HLA-A*24:02四聚体 | Eagle Biosciences | 1020-01-20 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| HEPES缓冲液 | -- | -- | |
| 环孢素A | Sigma-Aldrich | C1832 | |
| CpG寡脱氧核苷酸ODN2006 | Invitrogen | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Worthington | LS002138 | |
| 胶原酶3 | Worthington | LS004182 | |
| ACK裂解缓冲液 | KD Medical/MediaTech | NC0274127 | |
| 流式抗体 | 抗小鼠CD45抗体(AF488) | BioLegend | 103122 |
| 抗CD45抗体(PerCP/Cy5.5) | BioLegend | 103132 | |
| 抗CD3抗体(AF488) | BioLegend | 100210 | |
| 抗CD4抗体(APC) | BioLegend | 100412 | |
| 抗CD8a抗体(PE/Cy7) | BioLegend | 100722 | |
| 抗Thy1.1抗体 | BioLegend | 202506 | |
| 抗TCR β链抗体(PE) | BioLegend | 109208 | |
| 抗CD3抗体(APC) | BioLegend | 100235 | |
| 抗CD8a抗体(FITC) | Thermo Fisher | MA5-16759 | |
| 人流式抗体 | 抗人CD3抗体(AF488) | BioLegend | 300319 |
| 抗CD8a抗体(APC) | BioLegend | 301014 | |
| 免疫组化 | 抗CD3抗体 | Abcam | Ab16669 |
| 抗CD4抗体 | eBioscience | 14-9766-82 | |
| 抗CD8抗体 | eBioscience | 14-0808-82 | |
| 抗F4/80抗体 | Novus Biologicals | NB600-404 | |
| 抗CD45R/B220抗体 | BD Pharmingen | 553086 | |
| Bond聚合物精制检测系统 | Leica Biosystems | DS9800 | |
| Bond Intense R检测系统 | Leica Biosystems | DS9263 | |
| qPCR | SsoAdvanced通用SYBR Green超混合液 | Bio-Rad | 1725270 |
| SensiFAST cDNA合成试剂盒 | Bioline | BIO-65054 | |
| RNA提取 | LEV simplyRNA组织提取试剂盒 | Promega | AS1280 |
| 单细胞测序 | TotalSeq™-C0301 | BioLegend | 155861 |
| TotalSeq™-C0302 | BioLegend | 155863 | |
| TotalSeq™-C0303 | BioLegend | 155865 | |
| 磁珠分离 | CD8(TIL)磁珠,小鼠 | Miltenyi | 130-116-478 |
| 细胞活力染料 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠的基因型;心肌炎发生率约50%(雌性偏高);小鼠周龄3-6周。 阅读提示:Methods: Mice |
| 单细胞RNA/TCR测序 | 样本量(6个健康心脏、4个心肌炎心脏);测序平台(10X Chromium 5');细胞过滤标准(200-3000转录本,<15%线粒体);聚类参数(分辨率0.4)。 阅读提示:Methods: Single-cell RNA/TCR sequencing |
| 抗体耗竭 | 抗体剂量(200μg/次,腹腔注射,每周三次);起始日龄(21天);处理时长(至90日龄);对照组(vehicle);耗竭效率验证(尾部采血,第3周)。 阅读提示:Methods: Antibody-mediated depletion and dexamethasone treatment |
| 过继转移 | 供体脾细胞数量(1×10^6);转移途径(尾静脉);受体品系(Rag1−/−);CD8耗竭方法(磁珠);供体心肌炎确认(H&E或CD45流式)。 阅读提示:Methods: Adoptive transfer |
| 抗原发现 | 肽库(α-肌球蛋白等,172个重叠肽);肽浓度(10μg/mL);共培养比例(TCR细胞:BMDC=1:3);孵育时间(过夜)。 阅读提示:Methods: Antigen discovery |
| MHC阻断 | 阻断抗体克隆(抗Kb B8-24-3,抗Db 28-14-8S);浓度(10μg/mL);预孵育时间(1小时);APC细胞系(EL-4)。 阅读提示:Methods: MHC blocking |
| 四聚体染色 | 四聚体负载肽条件(5μL空四聚体+0.5μL 200μM肽,4°C 30分钟);细胞染色温度和时间(37°C 20分钟);圈门策略(CD3+CD8+)。 阅读提示:Methods: Tetramer staining and flow cytometry |
| 患者PBMC扩增 | PBMC来源(ICI-MC患者和健康供者);肽浓度(130种α-肌球蛋白肽,每种400ng/mL;CEF肽池);培养时间(14天);细胞因子组合(IL-2, IL-7, IL-15各25ng/mL);培养基(CTS OpTmizer)。 阅读提示:Methods: PBMC expansion |
| TCR报告细胞构建 | TCR基因合成(Stitchr);载体(MSCV-IRES-Thy1.1);包装细胞系(platA);转导细胞(Jurkat-TCR-ko-CD8+-NFAT-GFP);分选(Thy1.1阳性)。 阅读提示:Methods: TCR sequences and cloning |