识别α-肌球蛋白的T细胞驱动免疫治疗相关心肌炎

T cells specific for α-myosin drive immunotherapy-related myocarditis

作者信息Margaret L Axelrod, Wouter C Meijers, Elles M Screever, Juan Qin, Mary Grace Carroll, Xiaopeng Sun, Elie Tannous, Yueli Zhang, Ayaka Sugiura, Brandie C Taylor, Ann Hanna, Shaoyi Zhang, Kaushik Amancherla, Warren Tai, Jordan J Wright, Spencer C Wei, Susan R Opalenik, Abigail L Toren, Jeffrey C Rathmell, P Brent Ferrell, Elizabeth J Phillips, Simon Mallal, Douglas B Johnson, James P Allison, Javid J Moslehi, Justin M Balko
PMID36385524
期刊Nature
发布时间2022-11
DOI10.1038/s41586-022-05432-3

实验完整度

包含小鼠模型、单细胞RNA/TCR测序、抗体耗竭、过继转移、抗原筛选、MHC四聚体染色及患者样本验证等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。

主要模型

Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠心肌炎模型 Rag1−/−小鼠过继转移模型 ICI-MC患者外周血及组织样本

重点核对

Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠的基因型及心肌炎表型确认 CD8+ T细胞耗竭抗体(抗CD8,200μg,腹腔注射,每周三次) 过继转移中供体脾细胞的CD8耗竭及细胞数量(1×10^6) α-肌球蛋白肽库(172个重叠肽)及筛选浓度(10μg/mL) MHC-I限制性验证(H2-Kb阻断抗体)

摘要

免疫相关不良事件,特别是诸如心肌炎(MC)等严重毒性反应,是免疫检查点抑制剂(ICI)在抗癌治疗中应用的主要挑战。ICI-心肌炎(ICI-MC)的发病机制尚不清楚。Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠再现了ICI-MC的临床病理特征,包括心肌T细胞浸润。对Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠心脏免疫浸润进行的单细胞RNA/T细胞受体(TCR)测序鉴定出克隆性效应CD8+ T细胞是主要细胞群。使用抗CD8而非抗CD4耗竭抗体治疗可挽救Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠的存活。将来自患有MC的小鼠的免疫细胞过继转移至受者体内可诱导致死性MC,且该过程需要CD8+ T细胞。α-肌球蛋白是一种心脏特异性蛋白,在胸腺中不表达,被鉴定为来源于暴发性MC小鼠的三个MHC-I限制性TCR的同源抗原来源。来自三名ICI-MC患者的外周血T细胞可被α-肌球蛋白肽扩增,且这些α-肌球蛋白扩增的T细胞与患病心脏和骨骼肌共享TCR克隆型,表明α-肌球蛋白可能是ICI-MC中临床重要的自身抗原。这些研究强调了细胞毒性CD8+ T细胞的关键作用,首次在ICI-MC中鉴定出候选自身抗原,并为ICI毒性发病机制提供了新的见解。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
免疫检查点抑制剂相关心肌炎(ICI-MC)的发病机制,特别是驱动心肌损伤的自身抗原和T细胞亚群。
核心机制
细胞毒性CD8+ T细胞识别心肌特异性自身抗原α-肌球蛋白(MHC-I限制性表位),驱动心肌损伤。
主要证据
小鼠模型(Pdcd1−/−Ctla4+/−)中心肌浸润以克隆性CD8+ T细胞为主;抗CD8耗竭或过继转移中去除CD8+ T细胞可挽救生存;α-肌球蛋白肽激活小鼠和人TCR报告细胞,H2-Kb四聚体染色阳性;ICI-MC患者中α-肌球蛋白扩增的TCR存在于心脏和骨骼肌。
研究意义
首次在ICI-MC中鉴定出候选自身抗原α-肌球蛋白,提示CD8+ T细胞介导的抗原驱动毒性,为毒性预测和治疗策略提供新见解。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

小鼠模型表型确认

确认Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠表现出ICI-MC的临床病理特征。

对Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠进行心脏组织H&E染色和免疫细胞流式分析,确认心肌炎表型及T细胞浸润。

2

单细胞RNA/TCR测序分析心脏免疫浸润

表征心肌炎心脏中免疫细胞组成和TCR克隆性,鉴定主要致病细胞群。

对健康野生型和Pdcd1−/−Ctla4+/−心肌炎小鼠心脏CD45+免疫细胞进行单细胞RNA/TCR测序,分析细胞簇和TCR克隆性。

3

CD8+ T细胞必要性验证

验证CD8+ T细胞在心肌炎发生中的必要性。

对Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠进行抗CD8或抗CD4抗体耗竭,观察生存率;并进行过继转移实验,将全脾细胞或CD8耗竭脾细胞转移至Rag1−/−小鼠,评估心肌炎诱导。

4

抗原发现:候选自身抗原筛选

鉴定心肌炎TCR识别的同源抗原。

利用候选自身抗原方法,针对心肌富集且胸腺不表达的基因(MYH6, NPPA, NPPB, SBK2)合成重叠肽库,与TCR报告细胞和BMDC共培养,检测NFAT-GFP活性。

5

MHC限制性验证

确认α-肌球蛋白肽的MHC-I限制性。

使用H2-Kb和H2-Db阻断抗体,验证TCR报告细胞对α-肌球蛋白肽的响应受MHC-I限制。

6

α-肌球蛋白特异性T细胞检测

检测小鼠心脏浸润CD8+ T细胞对α-肌球蛋白肽的特异性。

使用负载α-肌球蛋白肽的H2-Kb四聚体对心肌炎小鼠心脏CD3+CD8+细胞进行染色。

7

患者样本验证

评估α-肌球蛋白在人类ICI-MC中的相关性。

从ICI-MC患者和健康供者PBMC中扩增α-肌球蛋白特异性T细胞,进行TCR测序分析,并与组织TCR库比较;对患者1的TCR进行克隆和抗原鉴定。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
10X Chromium系统10X Genomics--
NovaSeq 6000测序仪Illumina--
Leica Bond-Max免疫组化自动染色机Leica Biosystems--
Attune NxT声波聚焦流式细胞仪Life Technologies--
WOLF细胞分选仪NanoCellect--
CFX96 Touch实时荧光定量PCR检测系统Bio-Rad--
TissueLyser II组织研磨仪Qiagen--
Maxwell 16自动化工作站Promega--
抗CD8耗竭抗体BioXCellBE0061
抗CD4耗竭抗体BioXCellBE0003-1
CD8(TIL)磁珠,小鼠Miltenyi130-116-478
粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子ProSpecCYT-222
重组人白细胞介素-2Peprotech--
重组人白细胞介素-7Peprotech--
重组人白细胞介素-15Peprotech--
CTS OpTmizer T细胞扩增无血清培养基Thermo Fisher ScientificA1048501
Jurkat-TCR-ko-CD8+-NFAT-GFP报告细胞----
MSCV-IRES-Thy1.1 DEST载体Addgene17442
platA逆转录病毒包装细胞系Cell BioLabsRV-102
H-2Kb-PE四聚体Tetramer Shop--
easYmer HLA-A*03:01四聚体Eagle Biosciences1016-01-20
easYmer HLA-A*24:02四聚体Eagle Biosciences1020-01-20
RPMI-1640培养基----
胎牛血清----
HEPES缓冲液----
环孢素ASigma-AldrichC1832
CpG寡脱氧核苷酸ODN2006Invitrogen--
二甲基亚砜----
脱氧核糖核酸酶IWorthingtonLS002138
胶原酶3WorthingtonLS004182
ACK裂解缓冲液KD Medical/MediaTechNC0274127
抗小鼠CD45抗体(AF488)BioLegend103122
抗CD45抗体(PerCP/Cy5.5)BioLegend103132
抗CD3抗体(AF488)BioLegend100210
抗CD4抗体(APC)BioLegend100412
抗CD8a抗体(PE/Cy7)BioLegend100722
抗Thy1.1抗体BioLegend202506
抗TCR β链抗体(PE)BioLegend109208
抗CD3抗体(APC)BioLegend100235
抗CD8a抗体(FITC)Thermo FisherMA5-16759
抗人CD3抗体(AF488)BioLegend300319
抗CD8a抗体(APC)BioLegend301014
抗CD3抗体AbcamAb16669
抗CD4抗体eBioscience14-9766-82
抗CD8抗体eBioscience14-0808-82
抗F4/80抗体Novus BiologicalsNB600-404
抗CD45R/B220抗体BD Pharmingen553086
Bond聚合物精制检测系统Leica BiosystemsDS9800
Bond Intense R检测系统Leica BiosystemsDS9263
SsoAdvanced通用SYBR Green超混合液Bio-Rad1725270
SensiFAST cDNA合成试剂盒BiolineBIO-65054
LEV simplyRNA组织提取试剂盒PromegaAS1280
TotalSeq™-C0301BioLegend155861
TotalSeq™-C0302BioLegend155863
TotalSeq™-C0303BioLegend155865
CD8(TIL)磁珠,小鼠Miltenyi130-116-478
4',6-二脒基-2-苯基吲哚----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
小鼠模型
Pdcd1−/−Ctla4+/−小鼠的基因型;心肌炎发生率约50%(雌性偏高);小鼠周龄3-6周。
阅读提示:Methods: Mice
单细胞RNA/TCR测序
样本量(6个健康心脏、4个心肌炎心脏);测序平台(10X Chromium 5');细胞过滤标准(200-3000转录本,<15%线粒体);聚类参数(分辨率0.4)。
阅读提示:Methods: Single-cell RNA/TCR sequencing
抗体耗竭
抗体剂量(200μg/次,腹腔注射,每周三次);起始日龄(21天);处理时长(至90日龄);对照组(vehicle);耗竭效率验证(尾部采血,第3周)。
阅读提示:Methods: Antibody-mediated depletion and dexamethasone treatment
过继转移
供体脾细胞数量(1×10^6);转移途径(尾静脉);受体品系(Rag1−/−);CD8耗竭方法(磁珠);供体心肌炎确认(H&E或CD45流式)。
阅读提示:Methods: Adoptive transfer
抗原发现
肽库(α-肌球蛋白等,172个重叠肽);肽浓度(10μg/mL);共培养比例(TCR细胞:BMDC=1:3);孵育时间(过夜)。
阅读提示:Methods: Antigen discovery
MHC阻断
阻断抗体克隆(抗Kb B8-24-3,抗Db 28-14-8S);浓度(10μg/mL);预孵育时间(1小时);APC细胞系(EL-4)。
阅读提示:Methods: MHC blocking
四聚体染色
四聚体负载肽条件(5μL空四聚体+0.5μL 200μM肽,4°C 30分钟);细胞染色温度和时间(37°C 20分钟);圈门策略(CD3+CD8+)。
阅读提示:Methods: Tetramer staining and flow cytometry
患者PBMC扩增
PBMC来源(ICI-MC患者和健康供者);肽浓度(130种α-肌球蛋白肽,每种400ng/mL;CEF肽池);培养时间(14天);细胞因子组合(IL-2, IL-7, IL-15各25ng/mL);培养基(CTS OpTmizer)。
阅读提示:Methods: PBMC expansion
TCR报告细胞构建
TCR基因合成(Stitchr);载体(MSCV-IRES-Thy1.1);包装细胞系(platA);转导细胞(Jurkat-TCR-ko-CD8+-NFAT-GFP);分选(Thy1.1阳性)。
阅读提示:Methods: TCR sequences and cloning