人类脑类器官模型的建立与性别差异初步比较
建立男性(XY)和女性(XX)来源的人脑类器官模型,并观察性染色体补体对神经发生的影响。
使用H1(男性XY)和H9(女性XX)干细胞生成脑类器官,在类器官形成过程中进行雄激素(T、DHT)、雌激素(E)处理,分析神经前体细胞变化(TBR2+中间前体细胞)。
Androgens increase excitatory neurogenic potential in human brain organoids
包括人类脑类器官体外模型、小鼠类器官比较、细胞电转功能验证、药物干预、转录组与单细胞测序等,综合验证了雄激素介导的机制。
人类大脑类器官(H1男性XY、H9女性XX) 腹侧化人类脑类器官 小鼠胚胎干细胞来源的脑类器官
使用雄性XY(H1)和雌性XX(H9)来源的人脑类器官验证性别差异 雄激素(DHT、T)处理浓度、起止时间及与药物(VPA、sapanisertib等)联合处理方案 过表达AR-V7及ERαY537S的基因操作验证AR特异性 RNA-seq和scRNA-seq分析及差异表达基因验证 脉冲-追踪实验设计验证雄激素对神经元后期生成的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立男性(XY)和女性(XX)来源的人脑类器官模型,并观察性染色体补体对神经发生的影响。
使用H1(男性XY)和H9(女性XX)干细胞生成脑类器官,在类器官形成过程中进行雄激素(T、DHT)、雌激素(E)处理,分析神经前体细胞变化(TBR2+中间前体细胞)。
验证雄激素促进神经前体增殖的效应是否由AR介导,并排除雌激素受体作用。
通过Sendai/Lenti病毒稀疏标记进行谱系追踪,观察DHT处理对放射状胶质细胞克隆大小的影响。在类器官中电转AR-V7(组成性激活AR)或ERαY537S(组成性激活ERα),观察细胞增殖和分化状态变化。
通过转录组学发现雄激素处理的差异表达基因及其富集的信号通路,并验证与HDAC和mTOR信号的关系。
对DHT、T和对照组处理的类器官进行bulk RNA-seq和scRNA-seq,鉴定差异表达基因及细胞亚型变化。通过免疫染色和药物干预(VPA、MI192、MS275抑制HDAC;sapanisertib抑制mTOR;MHY1485激活mTOR)验证这些通路在雄激素效应中的作用。
探究雄激素是否同样影响抑制性神经元(腹侧前脑)的神经发生。
使用IWP-2和SAG处理生成腹侧化的脑类器官,检测DHT和E处理对腹侧前体细胞(DLX2+)的影响。同时检测类器官中与雄激素响应相关的酶(SRD5A1)表达。
模拟胎儿期雄激素脉冲,验证雄激素处理是否最终导致兴奋性神经元总数增加。
在类器官培养过程中,DHT处理18天后撤除,再培养17天,观察神经元总数及亚型(深层、浅层)变化,并通过生长曲线模型预测对兴奋性神经元总数的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | StemFlex™培养基 | Thermo Fisher | A3349401 |
| 基质胶 | Corning | 356234 | |
| STEMdiff™脑类器官试剂盒 | StemCell Technologies | 08570 | |
| IWP-2 | Sigma | I0536 | |
| SAG | Sigma | 566661 | |
| 激素处理 | 双氢睾酮 | Sigma | A8380-1G |
| 睾酮 | Sigma | T1500 | |
| 雌二醇 | Sigma | E1024 | |
| 孕酮 | Sigma | P8783 | |
| 药物处理 | 丙戊酸(丙戊酸钠) | Stratech | S1168-SEL-200mg |
| MS275 | Selleckchem | 209783-80-2 | |
| MI-192 | Tocris | 5647 | |
| 沙帕色替 | Selleckchem | 1224844-38-5 | |
| MHY1485 | Sigma | SML0810 | |
| ELISA | 睾酮ELISA试剂盒 | Abcam | ab108666 |
| 雌二醇ELISA试剂盒 | R&D Systems | KGE014 | |
| CLARIOstar多功能酶标仪 | BMG Labtech | -- | |
| 细胞培养(小鼠) | 重组小鼠白血病抑制因子 | R&D Systems | 8878-LF-025 |
| 病毒转染 | CytoTune™ EmGFP仙台荧光报告病毒 | ThermoFisher | A16519 |
| LentiBrite™ RFP对照慢病毒生物传感器 | Millipore | 17-10409 | |
| 转基因 | EGFP-C1-AR-V7质粒 | Addgene | 86856 |
| pEGFP-C1-ERαY537S质粒 | Addgene | 28230 | |
| 免疫组织化学 | ProLong™ Diamond抗淬灭封片剂 | ThermoFisher | P36961 |
| RNAscope | RNAscope®荧光多联试剂盒 | ACD | 320850 |
| Hs-AR-O2探针 | ACD | 522941 | |
| Western blot | 改良RIPA裂解液 | -- | -- |
| Quick Start Bradford染料试剂 | Bio-Rad | 5000205 | |
| Amersham Hybond P 0.45 PVDF印迹膜 | GE Healthcare | 10600023 | |
| 抗AR抗体(D6F11) | Cell Signaling | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| Li-COR Odyssey CLx红外成像系统 | Li-COR | -- | |
| ddPCR | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| TURBO DNA-free™试剂盒 | Invitrogen | AM1907 | |
| SuperScript™ III第一链合成SuperMix(用于qRT-PCR) | Invitrogen | 11752-050 | |
| ddPCR探针SuperMix | Bio-Rad | 1863026 | |
| QX200微滴数字PCR系统 | Bio-Rad | 1864001 | |
| RNA-seq | NEBNext™ Ultra II DNA文库制备试剂盒(用于Illumina™) | New England BioLabs | E7645 |
| NEBNext™ Poly(A) mRNA磁力分离模块 | New England BioLabs | E7490 | |
| AMPure XP磁珠 | Beckman Coulter | A63881 | |
| HiSeq4000测序仪 | Illumina | -- | |
| scRNA-seq | Accumax细胞分离液 | Sigma | A7089 |
| 死细胞去除试剂盒 | Miltenyi | 130-090-101 | |
| 10X Chromium控制器 | 10X Genomics | -- | |
| Chromium单细胞3'文库与凝胶微珠试剂盒v3.1 | 10X Genomics | -- | |
| Novaseq测序仪 | Illumina | -- | |
| 活细胞成像 | 低熔点琼脂糖 | Sigma | A9414 |
| HBSS缓冲液(1×) | Gibco | 14025092 | |
| Millicell器官型细胞培养插入件 | Merck | PICM0RG50 | |
| 免疫组织化学 | 抗TBR2抗体 | R&D Systems | AF6166 |
| 抗SATB2抗体 | Abcam | ab51502 | |
| 抗SRD5A1抗体 | Abcam | ab110123 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人类脑类器官生成与培养 | 干细胞系(H1雄性XY、H9雌性XX)、Matrigel包被、STEMdiff Cerebral Organoid Kit使用、胚状体大小(18000或2000细胞)、摇床转速(57 rpm)、Matrigel去除时间(14-17天)、培养基于第30天转移至IDM+A等。 阅读提示:Methods: Human stem cell maintenance and organoid generation |
| 激素处理 | 激素类型(DHT、T、E)、浓度(DHT 30 nM,T和E 100 nM)、处理起始时间(第17天)、频率(每周两次)、溶剂(96%乙醇)及实际测量浓度(ELISA验证)。 阅读提示:Methods: Human hormone and drug treatments |
| 药物处理 | 药物名称及浓度(VPA 0.7 mM、MI192 200 nM、MS275 200 nM、sapanisertib 100 nM、MHY1485 2 μM)、处理起始时间(第17天)和持续时间(至第35天)、DHT联合药物时的DHT浓度(30 nM)。 阅读提示:Methods: Human hormone and drug treatments |
| 基因操作(电穿孔) | 质粒浓度(1 μg/mL)、注射及电穿孔时间(第45天)、电压(40 mV)、脉冲持续时间(50 ms)、脉冲次数(5)、脉冲间隔(1.0 s)。 阅读提示:Methods: Electroporations |
| 谱系追踪(病毒标记) | 病毒类型(EmGFP Sendai、LentiBrite RFP)、注射时间(第45天和第53天)、激素处理起始时间(标记后立即)、分析时间点(6和8天标记后)。 阅读提示:Methods: Sendai and Lenti virus labelling |
| 形态学定量分析 | 定量区域定义(VZ、SVZ、progenitor zone、cortical wall等)、细胞计数方法(Fiji手动计数)、分析要求(至少3个独立批次、每个处理至少3个脑室、每个批次至少2个类器官)。 阅读提示:Methods: Quantifications |
| RNA-seq分析 | 处理组(DHT、T)和对照组样本数(6 vs 3)、库制备方法、测序平台(HiSeq4000)、数据分析方法(salmon、DESeq2、ComBat、glmnet)及差异表达基因筛选标准。 阅读提示:Methods: RNA-Seq library preparation and sequencing, Bulk RNA-seq data analysis |
| scRNA-seq分析 | 样本处理(DHT、E、对照各2个类器官)、细胞分离方法(Accumax、DNase I、actinomycin D)、死细胞去除、10X Chromium文库制备、测序平台(Novaseq)、数据分析(CellRanger、Seurat、Monocle3)。 阅读提示:Methods: Single cell RNA sequencing and analysis |