胶质母细胞瘤突变改变EGFR二聚体结构以阻止配体偏向性

Glioblastoma mutations alter EGFR dimer structure to prevent ligand bias

作者信息Chun Hu, Carlos A Leche 2nd, Anatoly Kiyatkin, Zhaolong Yu, Steven E Stayrook, Kathryn M Ferguson, Mark A Lemmon
PMID35140400
期刊Nature
发布时间2022-02
DOI10.1038/s41586-021-04393-3

实验完整度

包含细胞功能实验(eHAP和Ba/F3细胞)、小角X射线散射、化学交联、X射线晶体学、SPR和SE-AUC等多种体外验证,且包括结构解析和功能验证。

主要模型

工程化单倍体eHAP细胞表达野生型或突变型EGFR Ba/F3细胞表达野生型或突变型EGFR 纯化的sEGFR蛋白(残基1-501)

重点核对

使用R84K和A265V突变型sEGFR进行X射线晶体结构解析 通过SAXS和化学交联验证EREG诱导的sEGFR二聚化 在eHAP和Ba/F3细胞中比较EGF和EREG的剂量-反应EC50 使用SPR测量突变对EREG结合亲和力的影响

摘要

表皮生长因子受体(EGFR)在人类癌症中频繁突变,并且是重要的治疗靶点。EGFR抑制剂在肺癌中已取得成功,在肺癌中,细胞内酪氨酸激酶结构域突变激活受体,但在胶质母细胞瘤(GBM)中则不然——其突变仅发生在细胞外区域。在这里,我们展示了常见的细胞外GBM突变阻止EGFR区分其激活配体。不同的生长因子配体稳定不同的EGFR二聚体结构,这些结构以不同的动力学发出信号,以指定或偏向结果。EGF本身诱导强对称二聚体,短暂信号传导以促进增殖。表皮调节素(EREG)诱导弱得多的不对称二聚体,驱动持续信号传导和分化。GBM突变降低了EGFR在细胞试验中区分EREG与EGF的能力,并允许EGFR响应EREG和其他低亲和力配体形成强(EGF样)二聚体。使用X射线晶体学,我们进一步表明R84K GBM突变使EREG驱动的细胞外二聚体对称化,使其类似于通常与EGF一起看到的二聚体。第二个GBM突变A265V,反而重塑关键二聚化接触以加强不对称的EREG驱动的二聚体。我们的结果证明了EGFR对配体辨别能力的改变在GBM中的重要作用,对治疗靶向具有潜在意义。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
胶质母细胞瘤中常见的EGFR胞外突变如何影响受体对配体的辨别,从而可能促进肿瘤发生?
核心机制
GBM突变(如R84K和A265V)破坏EGFR胞外结构域中自抑制性的结构域I/II接触,使低亲和力配体(如EREG)能够诱导形成类似EGF的高亲和力配体所诱导的强二聚体,从而消除配体辨别能力。
主要证据
细胞实验显示突变型EGFR对EREG的敏感性增强,EC50与EGF相似;SAXS和交联实验显示突变增强了EREG诱导的二聚化;晶体结构明确了R84K对称化和A265V改变二聚体臂对接的机制。
研究意义
该发现提示EGFR胞外突变可能通过改变信号性质而非仅仅增加活性来促进GBM发展,为针对EGFR突变的新治疗策略提供了结构基础。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

验证GBM突变对配体辨别的影响

确定GBM突变是否影响EGFR对EGF和EREG的辨别能力

在eHAP细胞中表达野生型或突变型EGFR,用不同浓度的EGF和EREG刺激,通过免疫印迹检测EGFR磷酸化水平

2

测试突变对配体诱导的生长影响

评估突变对EGF和EREG诱导的细胞增殖的差异影响

在Ba/F3细胞中表达WT或突变EGFR,用不同浓度EGF或EREG处理72小时,通过CyQuant Direct检测细胞活力

3

通过SAXS分析配体诱导的二聚化

定量评估GBM突变对EREG诱导的sEGFR二聚化的影响

使用小角X射线散射分析野生型和突变型sEGFR在过量EGF或EREG存在下的二聚化状态

4

通过化学交联验证二聚化

直接观察突变对低亲和力配体诱导的二聚化的增强效果

使用DSS交联5 μM sEGFR与不同配体(EGF、EREG、AREG、EPGN)处理,通过SDS-PAGE和考马斯蓝染色分析二聚体形成

5

解析突变型sEGFR与EREG的晶体结构

确定R84K和A265V突变如何改变EREG诱导的二聚体结构

通过悬滴气相扩散法结晶EREG与sEGFRR84K或sEGFRA265V复合物,收集X射线衍射数据并解析结构

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
pFastbac1载体ThermoFisher Scientific--
Bac-to-Bac系统----
Sf9昆虫细胞----
ESF921培养基Expression Systems--
Sartocon Slice ECO Hydrosart盒式膜包Sartorius--
Ni-NTA树脂Qiagen--
Fractogel SO3-阳离子交换柱Millipore--
Superose 6 10/300 GL凝胶过滤柱Cytiva Life Sciences--
表皮调节素----
人表皮生长因子R&D Systems--
转化生长因子-αR&D Systems--
双调蛋白R&D Systems--
上皮素R&D Systems--
Rigaku BioSAXS-2000nano 小角X射线散射仪Rigaku--
二琥珀酰亚胺辛二酸酯ThermoFisher Scientific--
Pierce LDS样品缓冲液ThermoFisher Scientific--
GelDoc-EZ凝胶成像仪Bio-Rad--
D-(+)-海藻糖二水合物----
精胺四盐酸盐----
XL-I分析超速离心机Beckman--
Biacore 3000 表面等离子体共振仪----
CM5传感芯片Cytiva Life Sciences--
eHAP细胞Horizon--
Ba/F3细胞DSMZ--
IMDM培养基ThermoFisher12440-053
RPMI 1640培养基LifeTech11875-093
白细胞介素-3PeproTech213-13
Nucleofector 2b电转仪Lonza--
PE偶联小鼠抗人EGFR抗体BD Pharmingen555997
FACS Melody流式细胞仪BD Biosciences--
抗EGFR抗体R&D--
磷酸化EGFR (pY845)抗体CST2231
磷酸化EGFR (pY1068)抗体CST3777
磷酸化EGFR (pY1173)抗体CST4407
磷酸化ERK1/2抗体CST9106
总ERK抗体CST4696
马抗小鼠IgG HRP偶联二抗CST7076
WestVision抗兔IgG HRP聚合物二抗Vector LabsWB-1000
兔抗山羊IgG HRP偶联二抗R&DHAF017
SuperSignal West Pico化学发光底物ThermoFisher Scientific--
Kodak Image Station 440CF成像仪Kodak--
Grb2抗体CST3972
CyQuant Direct细胞增殖检测试剂盒InvitrogenC35011
BioTek Synergy 2酶标仪BioTek--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞信号实验
eHAP细胞中EGFR表达水平;血清饥饿时间;EGF和EREG的浓度范围(用于EC50计算)
阅读提示:Methods: Cell signalling and proliferation studies; Fig. 1b-d
细胞增殖实验
Ba/F3细胞表面EGFR表达水平(通过流式分选相似水平);EGF和EREG浓度梯度;处理时间72小时
阅读提示:Methods: Cell signalling and proliferation studies; Extended Data Fig. 1d
SAXS实验
sEGFR浓度70 μM;配体浓度84 μM;缓冲液组成(10 mM HEPES pH 8.0, 150 mM NaCl)
阅读提示:Methods: Small-Angle X-ray Scattering; Fig. 2
化学交联实验
sEGFR浓度5 μM;配体浓度6 μM或60 μM;DSS浓度100 μM;交联时间30分钟
阅读提示:Methods: Covalent Crosslinking; Fig. 2f
晶体学实验
sEGFR和EREG浓度(约8 mg/ml和1.2倍摩尔过量);结晶条件(R84K: 100 mM HEPES pH 7.5, 12% PEG3350, 3% trehalose;A265V: 1% tryptone, 1 mM sodium azide, 50 mM HEPES pH 7.0, 20% PEG3350);衍射数据收集束线(APS 23ID-B)
阅读提示:Methods: Crystallography; Extended Data Table 1
SPR实验
EREG固定化水平(约2,500 RU);sEGFR浓度系列;流速和进样时间(5 μl/min,8分钟)
阅读提示:Methods: Surface Plasmon Resonance (SPR); Extended Data Fig. 7b
SE-AUC实验
sEGFR浓度(2, 5, 10 μM);TGFα摩尔过量1.2倍;转速(6,000, 9,000, 12,000 rpm)
阅读提示:Methods: Sedimentation Equilibrium Analytical Ultracentrifugation (SE-AUC); Extended Data Fig. 4
生存分析
TCGA GBM数据集来源(gbm_tcga_pub2013, gbm_tcga_pan_can_atlas_2018);患者分组依据(EGFR改变状态);统计方法(双侧log-rank检验,未校正多重比较)
阅读提示:Methods: Overall survival analysis of GBM patients; Extended Data Fig. 9