建立饮食诱导肥胖模型并评估肿瘤生长和抗PD-1反应
验证高脂饮食是否影响肿瘤生长及抗PD-1治疗的疗效。
将C57BL/6J小鼠喂食低脂饮食(10% kcal)或高脂饮食(45% kcal)20-25周,皮下注射MC38结肠癌细胞,肿瘤生长19天后给予抗PD-1或IgG对照,测量肿瘤生长和体重。
Obesity induces PD-1 on macrophages to suppress anti-tumour immunity
包含体外细胞实验、体内肿瘤模型、单细胞测序和临床样本分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证(如敲除、抑制剂、代谢分析)
小鼠MC38结肠癌同系皮下移植模型 小鼠6419c5胰腺癌模型 小鼠LVRCC肾癌模型 人肾透明细胞癌肿瘤样本 人子宫内膜癌肿瘤样本
使用45 kcal%高脂饮食或10 kcal%低脂饮食喂养20-25周诱导肥胖 皮下注射5×10^5 MC38细胞,肿瘤生长19天 抗PD-1(RMP1-14)或IgG对照在肿瘤可触及后第9、11、13、15天腹腔注射200 μg 骨髓来源巨噬细胞用IFNγ(50 ng/ml)或IL-4(50 ng/ml)或25%肿瘤条件培养基刺激24小时 LysMCre Pdcd1fl/fl小鼠用于髓系特异性PD-1敲除
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证高脂饮食是否影响肿瘤生长及抗PD-1治疗的疗效。
将C57BL/6J小鼠喂食低脂饮食(10% kcal)或高脂饮食(45% kcal)20-25周,皮下注射MC38结肠癌细胞,肿瘤生长19天后给予抗PD-1或IgG对照,测量肿瘤生长和体重。
比较不同饮食和处理组肿瘤中免疫细胞组成和基因表达差异。
从MC38肿瘤中分离CD45+和CD45−细胞进行scRNA-seq,鉴定免疫细胞亚群并分析基因表达,同时进行V(D)J测序分析TCR克隆性,并用Compass分析代谢状态。
确定高脂饮食是否改变肿瘤相关巨噬细胞的吞噬、抗原呈递和代谢表型。
通过流式细胞术测量TAM的吞噬能力(pHrodo)、MHC-I/II表达、CD80表达,以及用Seahorse分析糖酵解水平。
验证肥胖相关的细胞因子、脂肪酸和炎症信号是否直接诱导巨噬细胞PD-1。
用LPS、IFNγ、IL-4、TCM、IL-6、MCP1、IL-1β、TNF、瘦素、胰岛素、棕榈酸等处理BMDMs,检测PD-1表达;使用免疫组化分析人类肿瘤样本中PD-1+巨噬细胞。
确定PD-1是否直接调节巨噬细胞糖酵解、吞噬和抗原呈递能力。
通过FACS分选PD-1+和PD-1low/− TAM进行bulk RNA-seq和细胞外通量分析;使用rmPD-L1或抗PD-1处理TCM刺激的BMDMs,检测代谢和功能;使用CRISPR敲除Pten激活mTORC1,观察PD-1表达变化。
验证巨噬细胞PD-1在肿瘤免疫监视中的直接作用。
使用LysMCre Pdcd1fl/fl小鼠和野生型对照,皮下接种MC38细胞,测量肿瘤生长,分析TAM功能和CD8+ T细胞活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 抗PD-1抗体(RMP1-14) | BioXCell | -- |
| 大鼠IgG2a同型对照(2A3) | BioXCell | -- | |
| 细胞培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- |
| 干扰素-γ | -- | -- | |
| 白细胞介素-4 | -- | -- | |
| 棕榈酸 | -- | -- | |
| 脂多糖 | -- | -- | |
| 2-脱氧葡萄糖 | Cayman Chemical | 14325 | |
| 依托莫昔 | Cayman Chemical | 11969 | |
| 6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸 | Sigma-Aldrich | D2131 | |
| 信号通路抑制 | 雷帕霉素 | Sigma | -- |
| KJ Pyr 9 | MedChemExpress | -- | |
| 10058-F4 | MedChemExpress | -- | |
| BMS-345541 | Sigma | -- | |
| 信号通路激活 | AICAR | Sigma | -- |
| 代谢分析 | Seahorse XFe96生物分析仪 | Agilent | -- |
| Cell-Tak | Corning | 354240 | |
| MitoStress检测试剂盒 | Agilent | -- | |
| GlycoStress检测试剂盒 | Agilent | -- | |
| 流式细胞术 | Fc受体阻断剂 | BD | 553142 |
| Ghost Dye Red 780死活染料 | Cell Signaling | 18452S | |
| pHrodo红色大肠杆菌生物颗粒 | Invitrogen | P35361 | |
| BODIPY FL C16荧光染料 | Invitrogen | -- | |
| 2-NBDG葡萄糖类似物 | Sigma | A8625 | |
| 细胞培养 | 重组小鼠PD-L1(rmPD-L1) | R&D Systems | 9048-B7 |
| 组织消化 | 胶原酶 | Sigma-Aldrich | C2674 |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | D5025 | |
| 细胞分离 | MACS CD45磁珠 | Miltenyi | 130-110-618 |
| 死细胞去除试剂盒 | Miltenyi | 130-090-101 | |
| CD11b磁珠 | Miltenyi | 130-049-601 | |
| 测序 | Chromium控制器 | 10x Genomics | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 饮食诱导肥胖模型 | 饮食配方(D12451或D12450H)、喂养持续时间(20-25周)、小鼠周龄和性别、代谢参数(血糖和胰岛素) 阅读提示:方法部分'Diet treatment'和扩展数据图1 |
| 肿瘤模型建立 | 细胞系(MC38等)、注射细胞数(如5×10^5)、注射途径(皮下或原位)、肿瘤生长天数、肿瘤测量方式 阅读提示:方法部分'Cell lines and primary macrophage isolation'和'Diet treatment' |
| 抗PD-1治疗 | 抗体克隆(RMP1-14)、剂量(200 μg)、给药途径(腹腔注射)、给药时间(第9、11、13、15天) 阅读提示:方法部分'Diet treatment' |
| 巨噬细胞分离和培养 | 骨髓来源巨噬细胞制备(M-CSF浓度和天数)、BMDM刺激条件(IFNγ、IL-4浓度和时间)、肿瘤条件培养基制备方法 阅读提示:方法部分'Cell lines and primary macrophage isolation' |
| 代谢分析 | 细胞数量、培养基成分、Seahorse分析仪型号、相关试剂浓度(寡霉素、FCCP等) 阅读提示:方法部分'Extracellular flux assay' |
| 流式细胞术 | 抗体克隆和荧光素、染色浓度、死活染料、Fc阻断、gating策略 阅读提示:方法部分'Mouse flow cytometry'和补充图 |