基于长读长测序的1019个多样性人类基因组结构变异研究

基因组结构变异对遗传多样性和人类疾病有重要贡献，但在群体规模队列中仍未被充分表征。本研究对1019个人类样本进行了长读长测序，构建了一个覆盖1000基因组计划中26个种群的中等覆盖度资源库。通过整合基于线性和图基因组的分析，我们发现了超过10万个序列解析的双等位基因结构变异，并对30万个多等位基因可变数目串联重复进行了基因分型，超越了基于短读长的群体规模调查。我们表征了不同种群中的缺失、重复、插入和倒位。长散布核元件-1和SINE-VNTR-Alu逆转录转座活性介导了独特序列片段的5'或3'转导，这取决于源移动元件类别和基因座。结构变异断点分析揭示了多种同源介导过程对结构变异形成和重复缺失事件的贡献。我们的开放获取资源强调了长读长测序在推进结构变异表征方面的价值，并可用于指导患者基因组中的变异优先排序。