TERT的克隆性失活损害干细胞竞争

Clonal inactivation of TERT impairs stem cell competition

作者信息Kazuteru Hasegawa, Yang Zhao, Alina Garbuzov, M Ryan Corces, Patrick Neuhöfer, Victoria M Gillespie, Peggie Cheung, Julia A Belk, Yung-Hsin Huang, Yuning Wei, Lu Chen, Howard Y Chang, Steven E Artandi
PMID39020172
期刊Nature
发布时间2024-08
DOI10.1038/s41586-024-07700-w

实验完整度

包含基于小鼠模型的体内谱系追踪、条件性基因敲除、转基因拯救实验、ATAC-seq和RNA-seq等多层级验证,并进行功能验证和机制验证。

主要模型

小鼠精原干细胞(SSC) TertCreER/flox条件敲除小鼠 Terc−/−小鼠 TertCreER/+;Rosalsl-Tdtomato/+谱系追踪小鼠

重点核对

Tert条件性敲除对SSC克隆形成的影响(通过TertCreER/flox小鼠模型) TERT的非催化功能(通过Terc缺失或催化失活突变体Tertci验证) MYC在TERT下游的作用(通过转基因MYC过表达拯救实验) 染色质可及性变化(通过ATAC-seq分析) 端粒长度维持(通过端粒FISH分析)

摘要

端粒酶与干细胞和癌症密切相关,因为它催化延伸端粒——保护染色体末端的核蛋白帽。端粒酶逆转录酶(TERT)的过表达以不依赖端粒的方式增强细胞增殖,但迄今为止,功能缺失研究尚未提供证据表明TERT在干细胞功能中具有直接作用。在许多组织中,稳态由干细胞竞争塑造,这是一个干细胞基于内在适应性进行竞争的过程。在这里,我们展示了在含有精原干细胞(SSC)的群体中条件性删除Tert会显著损害竞争性克隆形成。利用从Tert位点进行的谱系追踪,我们发现表达TERT的SSC产生长寿命克隆,但TERT的克隆性失活促进干细胞分化并导致全基因组开放染色质减少。TERT在竞争性克隆形成中的这种作用与其逆转录酶活性和经典端粒酶复合物无关。TERT的失活导致MYC癌基因活性降低,而在TERT缺失的SSC库中转基因表达MYC能有效拯救克隆形成。总之,这些数据揭示了TERT在增强干细胞竞争中存在不依赖催化活性的需求,揭示了TERT和MYC之间的遗传联系,并提示高TERT水平的干细胞的选择优势有助于稳态和衰老过程中雄性生殖系的端粒延伸。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
TERT是否在干细胞竞争中具有不依赖其催化活性的直接功能?
核心机制
TERT通过上调MYC蛋白水平,促进精原干细胞(SSC)的自我更新和竞争性克隆形成,同时维持开放染色质状态,其作用独立于端粒酶催化活性。
主要证据
条件性敲除Tert导致SSC克隆形成减少、分化增加和增殖降低;转基因MYC表达可拯救克隆形成缺陷;ATAC-seq显示TERT缺失导致US细胞染色质可及性降低;Tertci和Terc缺失不影响其功能。
研究意义
揭示了TERT在干细胞竞争中的非经典功能,并提示TERT-MYC轴可能在组织稳态、衰老和癌症发展中具有重要作用。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

TERT表达模式分析

确定TERT在精原细胞亚群中的表达情况

通过流式细胞术分选MCAMhighKIT− (US-h)、MCAMmedKIT− (US-m)和MCAMmedKIT+ (DS)精原细胞,并通过qRT-PCR和Tert-Tdtomato报告小鼠检测Tert mRNA和tdTomato表达。

2

TERT+ SSC谱系追踪与克隆形成

评估TERT表达SSC的自我更新和竞争能力

使用TertCreER/+;Rosalsl-Tdtomato/+小鼠,通过他莫昔芬诱导tdTomato标记TERT+细胞,并在不同时间点统计精子发生中的克隆(patch)数量、长度和总长度。

3

TERT条件性敲除对克隆形成的影响

确定内源性TERT在SSC竞争中的作用

构建TertCreER/flox;Rosalsl-Tdtomato/+小鼠,通过他莫昔芬诱导Tert基因敲除和tdTomato标记,分析克隆形成和SSC命运。

4

TERT非催化功能验证

检验TERT对SSC竞争的作用是否依赖其催化活性

使用Terc−/−小鼠和催化失活的Tertci转基因小鼠,观察TERT缺失或过表达对克隆形成的影响。

5

TERT缺失对SSC分化和增殖的影响

确定TERT缺失导致克隆形成减少的细胞机制

通过全组织免疫荧光和流式细胞术分析Tdtomato+ US亚群和KIT+ DS群体,并通过BrdU掺入实验检测增殖,通过cleaved-PARP染色检测凋亡。

6

染色质可及性分析

评估TERT缺失对全球染色质结构的影响

对分选的US-h, US-m, DS, SP和RS细胞进行ATAC-seq,比较TertCreER/+和TertCreER/flox小鼠的开放染色质图谱。

7

转录组分析

识别TERT缺失引起的基因表达变化和信号通路

对tdTomato+ US-h细胞进行RNA-seq,并使用GSEA分析通路富集。

8

MYC拯救实验

验证TERT通过MYC促进SSC竞争

在TertCreER/flox;Rosalsl-Tdtomato/lsl-tTA背景下过表达TetO-hMYC,分析克隆形成和SSC特性。

9

端粒长度测量

评估TERT缺失对端粒长度的影响

通过端粒FISH和tdTomato免疫荧光,测量一年后tdTomato+精子细胞中的端粒长度。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
TrypLE ExpressGibco--
胶原酶IWorthington--
胶原酶IVWorthington--
脱氧核糖核酸酶IWorthington--
胎牛血清----
抗RFP抗体Abcamab124754
抗RFP抗体MBLM208-3
抗E-钙粘蛋白抗体R&D SystemsAF748
抗GFRA1抗体R&D SystemsAF560
抗KIT抗体Cell Signaling Technology3074
抗BrdU抗体Bio-RadMCA2483
抗PLZF抗体Santa Cruzsc-22839
抗剪切型PARP抗体Cell Signaling Technology9548
抗γH2AX抗体EMD Millipore05-636
抗MYC抗体Cell Signaling Technology13987
抗α6整合素抗体Biolegend313622
抗MCAM抗体Biolegend134712
抗KIT抗体BD Biosciences564481
RNAscope 2.5 HD 试剂盒(红色)Advanced Cell Diagnostics--
TaqMan快速高级预混液Thermo Fisher Scientific--
PowerUp SYBR Green预混液Thermo Fisher Scientific--
Direct-zol RNA微量提取试剂盒Zymo Research--
SuperScript IV第一链合成系统Thermo Fisher Scientific--
SMARTer链特异性总RNA-seq试剂盒v2 - Pico输入哺乳动物Clontech--
自制Tn5转座酶----
Tagment DNA缓冲液----
Alexa 488标记的端粒探针PNA Bio--
Cy5标记的着丝粒探针PNA Bio--
封闭试剂Roche--
含有DAPI的Vectashield封片剂Vector Laboratories--
Immuno Shot免疫染色(温和型)Cosmo Bio--
TSA Plus Cyanine 3系统Akoya Biosciences--
TSA Plus Fluorescein系统Akoya Biosciences--
DAB底物试剂盒Vector Laboratories--
Clearmount封片剂American MasterTech--
Leica SP5共聚焦显微镜Leica--
BD Aria II流式细胞分选仪BD Biosciences--
7900HT Fast实时荧光定量PCR系统ABI--
Bioanalyzer 2100生物分析仪Agilent--
Illumina NextSeq测序平台Illumina--
他莫昔芬Cayman--
玉米油Sigma-Aldrich--
多西环素Sigma-Aldrich--
溴脱氧尿苷Sigma-Aldrich--
Igepal CA-630Sigma-Aldrich--
牛血清白蛋白----
Trizol LSThermo Fisher Scientific--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型
小鼠品系、年龄、饲养条件
阅读提示:Methods: Animals
谱系追踪
他莫昔芬剂量、给药方式、时间、观察时间点
阅读提示:Methods: Lineage-tracing assay, Figure 1
TERT条件性敲除
TertCreER/flox小鼠、他莫昔芬剂量、时间
阅读提示:Methods: Generation of Tert-flox mice, Figure 1
克隆形成分析
克隆计数方法、图像分析软件
阅读提示:Methods: Lineage-tracing assay, Figure 1
免疫荧光
抗体稀释度、孵育条件、抗原修复方法
阅读提示:Methods: Whole-mount immunofluorescence, Section immunostaining
流式分析
抗体稀释度、分选策略
阅读提示:Methods: FACS analysis
端粒FISH
探针浓度、杂交温度、信号定量方法
阅读提示:Methods: Telomere FISH
RNA-seq
起始RNA量、文库制备、测序深度
阅读提示:Methods: RNA-seq
ATAC-seq
细胞数目、Tn5转座酶量、测序平台
阅读提示:Methods: ATAC-seq