通过微蛋白和肽蛋白扩展人类蛋白质组

一项主要的科学驱动力是表征蛋白质编码基因组，这是研究人类健康的基础。但一个基本问题仍然是，在以前的分析中遗漏了什么。在过去的十年中，人类细胞类型和疾病状态中观察到非经典开放阅读框（ncORFs）的翻译，这对生物医学科学具有重要意义。然而，知识上的一个关键空白是哪些ncORFs能产生有助于人类蛋白质组的小微蛋白或替代蛋白质分子。在此，我们报告了TransCODE联盟的合作努力，以产生ncORFs在蛋白质水平证据上的共识性景观。我们表明，在对95,520个蛋白质组学实验的大规模分析中，一组7,264个ncORFs中约有25%产生了可检测的肽。我们为ncORF编码的微蛋白开发了一个人类蛋白质注释框架，并将“肽蛋白”的新概念模型编码为具有不确定功能潜力的微蛋白。为了探究肽蛋白的生物学意义，我们创建了一种称为ORF相对分支长度（ORBL）的进化分析方法，并确定进化约束是常见的，并且与ncORF衍生肽的观察相关。然后，我们表征了来自OLMALINC长链非编码RNA的一个肽蛋白的全必需细胞表型。总体而言，我们生成了由GENCODE和PeptideAtlas支持的公共研究工具，并推进了对人类蛋白质组中未被充分研究组分的生物医学发现。