NOTCH4功能获得性变异破坏系统性硬化症中的血管生成

Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis

作者信息Urvashi Kaundal, Pei-Suen Tsou, Mousumi Sahu, Mengqi Huang, Steven E Boyden, Curtis M Woodford, Daniel Shriner, Emilee Stenson, Sarah Ayla Safran, Yuechen Zhou, Taylor A Talley, Kaavya Gudapati, Xuetao Zhang, Yosuke Kunishita, Janet Wang, Ami A Shah, Maureen D Mayes, Ayo P Doumatey, Amy R Bentley, Robyn Domsic, Thomas A Medsger Jr, Paula S Ramos, Richard M Silver, Virginia Steen, John Varga, Vivien Hsu, Lesley Ann Saketkoo, Elena Schiopu, Jessica K Gordon, Lindsey A Criswell, Heather Gladue, Chris Derk, Elana J Bernstein, S Louis Bridges Jr, Victoria Shanmugam, Lorinda Chung, Suzanne Kafaja, Reem Jan, Marcin Trojanowski, Avram Goldberg, Benjamin D Korman, James Mullikin, James W Thomas, Stefania Dell'Orso, Davide Randazzo, Adebowale Adeyemo, Elaine F Remmers, Pamela L Schwartzberg, Ivona Aksentijevich, Charles Rotimi, Fredrick M Wigley, Rong A Wang, Francesco Boin, Dinesh Khanna, Robert Lafyatis, Daniel L Kastner, Pravitt Gourh
PMID41644364
发布时间2026-07
DOI10.1016/j.ard.2025.12.015

实验完整度

包含遗传关联分析(发现和复制队列)、体外功能实验(LCL、pECs管形成和球状体发芽)、scRNA-seq、小鼠模型(Tie2-tTA;TRE-Notch4)等至少两个独立证据层级,并有功能验证和机制验证。

主要模型

非裔美国人SSc患者及对照(遗传队列) 淋巴母细胞样细胞系(LCLs) 原代内皮细胞(pECs)包括HUVECs Tie2-tTA;TRE-Notch4小鼠模型

重点核对

NOTCH4变异(c.2824C>T和c.–117G>A)与SSc关联的验证 使用DLL4刺激和抑制剂(anti-NOTCH4抗体、DAPT、nirogacestat)的体外血管生成实验 scRNA-seq鉴定NOTCH4hi内皮细胞亚群 小鼠模型中Notch4过表达诱导EndoMT LCL和pECs中GC处理对NOTCH4表达的影响

摘要

目的:血管病变和纤维化是系统性硬化症(SSc)发病机制的核心,其遗传学基础在很大程度上未知。在此,我们试图研究非裔美国人(AA)SSc患者严重血管表型和较差结局的病因。方法:本研究聚焦于具有更严重血管表型和较差结局的AA SSc患者,结合遗传学、单细胞RNA测序、功能测定和小鼠模型,探讨NOTCH4在SSc血管病变中的作用以及NOTCH4靶向治疗的潜力。结果:基于基因的检测在外显子组-wide显著性水平上鉴定了NOTCH4与SSc的关联(P = 1.6 × 10−7),并且与严重血管疾病患者的关联(P = 3.5 × 10−7)。由错义(c.2824C>T)和启动子(c.–117G>A)变异定义的风险单倍型在AA SSc患者(11%)中富集,对照组为6.1%,该单倍型在AA SSc患者中的人群归因风险为2.6%,比欧裔美国人高52倍。SSc相关的NOTCH4变异增加了NOTCH4表达和信号传导,导致血管生成减少和内皮-间质转化(EndoMT)增加。甲襞毛细血管异常、血管生成减少和血管腔内纤维化在SSc中常见。遗传、化学、抗体或FDA批准的药物抑制NOTCH4信号传导可挽救血管生成并使EndoMT恢复至基线水平。结论:NOTCH4变异与SSc发病机制和血管病变相关,部分解释了AA中SSc患病率增加的原因。该研究强调需要进一步研究和临床试验,以抑制NOTCH4通路作为治疗SSc血管和纤维化表现的策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
NOTCH4基因的罕见功能变异是否与非裔美国人系统性硬化症的易感性和血管病变相关,及其机制。
核心机制
SSc相关的NOTCH4变异(c.–117G>A和c.2824C>T)增加NOTCH4表达和信号传导,导致血管生成受损和内皮-间质转化(EndoMT)增加。
主要证据
遗传关联分析(SKAT)显示NOTCH4基因与SSc显著关联;功能实验表明NOTCH4信号激活抑制管形成和血管发芽,而抑制NOTCH4(抗体、siRNA、DAPT、nirogacestat)可恢复血管生成;小鼠模型显示Notch4过表达导致EndoMT和动静脉畸形。
研究意义
研究指出NOTCH4通路是SSc血管病变的关键贡献者,抑制NOTCH4可能成为治疗SSc血管和纤维化表现的潜在策略,并可能为个性化医疗铺平道路。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

发现和复制队列中NOTCH4与SSc的遗传关联

检测NOTCH4基因罕见功能变异是否与SSc风险增加相关。

对发现队列(379 AA SSc, 411 AA对照)进行外显子组测序,对复制队列(590 AA SSc, 360 AA对照)进行定制捕获测序,使用SKAT进行基于基因的关联测试。

2

NOTCH4变异功能特征分析

评估风险变异(c.–117G>A和c.2824C>T)对NOTCH4表达和信号传导的影响。

在LCLs中测量NOTCH4表达(RT-PCR, ELISA),在DLL4刺激后测量下游效应基因(HEY2, HES1),使用ATAC-seq和ChIP-seq分析启动子区域染色质可及性和GR结合。

3

单细胞RNA测序分析SSc皮肤中NOTCH4表达

确定NOTCH4在SSc皮肤中的表达细胞类型和与血管生成的相关性。

对27例SSc和10例对照的皮肤活检进行scRNA-seq,分析内皮细胞亚群中NOTCH4表达,并进行差异表达和通路分析。

4

体外血管生成和EndoMT功能实验

验证NOTCH4信号增加是否损害血管生成并促进EndoMT,以及抑制NOTCH4是否能恢复。

使用内皮细胞系和患者来源pECs进行Matrigel管形成和球体发芽实验;用DLL4刺激激活NOTCH4,并用anti-NOTCH4抗体、DAPT、nirogacestat或siRNA抑制NOTCH4;通过流式细胞术检测EndoMT标志物(NOTCH3, SNAI2)。

5

小鼠模型中Notch4过表达验证EndoMT

在体内验证内皮细胞中Notch4过表达是否导致EndoMT。

使用Tie2-tTA;TRE-Notch4*小鼠(新生期开启Notch4*表达),通过免疫荧光染色检测脑组织中CD31+Erg+内皮细胞中Acta2的表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
外显子组测序----
Delta样配体4文中未明确说明--
抗NOTCH4阻断抗体文中未明确说明--
DAPT(γ-分泌酶抑制剂)文中未明确说明--
尼罗加司他文中未明确说明--
NOTCH4 siRNA文中未明确说明--
抗Erg抗体文中未明确说明--
抗CD31抗体文中未明确说明--
抗Acta2抗体文中未明确说明--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
遗传关联分析
队列组成(AA SSc和对照数量)、基因检测方法(SKAT)、显著性阈值
阅读提示:Methods: Participants, Statistical analysis; Table 1
LCL功能实验
LCL基因型(WT或HET)、血清饥饿时间(2小时)、DLL4刺激时间(24小时)、GC处理条件
阅读提示:Results: Exploring the functional role of NOTCH4 variants; Figure 1 legend
体外血管生成实验
内皮细胞类型(EC lines或pECs)、pECs基因型(HET或WT)、DLL4浓度、抑制剂浓度(DAPT、nirogacestat、抗体)、处理时间、管形成参数测量
阅读提示:Methods: Genetic and functional analysis; Figure 4 legend
单细胞RNA测序
皮肤活检样本量(SSc 27, 对照10)、组织处理流程、测序平台、数据分析软件
阅读提示:Methods: Genetic and functional analysis; Figure 3 legend
小鼠模型实验
小鼠品系(FVB/N)、基因型(Tie2-tTA;TRE-Notch4* vs Tie2-tTA)、四环素去除时间(从出生)、脑组织切片和免疫荧光抗体
阅读提示:Methods: Mouse model; Figure 5 legend