DRG神经元AhR响应性验证
验证DRG神经元是否表达功能性AhR信号通路
使用AhR激动剂ITE和拮抗剂CH处理原代成人DRG神经元,通过IF观察AhR核转位,RT-qPCR检测AhR靶基因表达。
AhR inhibition promotes axon regeneration via a stress-growth switch
包含体外DRG神经元培养、体内SNL与SCI模型、RNA-seq、单细胞及表观基因组分析等多层级验证,并涵盖功能与机制验证。
背根神经节(DRG)神经元 坐骨神经损伤(SNL)小鼠模型 脊髓损伤(SCI)小鼠模型 人诱导神经元(iNs)
神经元特异性AhR敲除小鼠(AhrcKO)的构建与验证 坐骨神经损伤模型中SCG10+轴突再生距离与再生指数 脊髓损伤模型中NF-H+和CGRP+轴突束密度 AhR拮抗剂(SR1、BAY)和激动剂(ITE)的体内外给药方案 AhR缺失导致的新生蛋白合成增加(嘌呤霉素掺入)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DRG神经元是否表达功能性AhR信号通路
使用AhR激动剂ITE和拮抗剂CH处理原代成人DRG神经元,通过IF观察AhR核转位,RT-qPCR检测AhR靶基因表达。
确定AhR活性对轴突生长的影响
通过siRNA敲低Ahr、药理学抑制或使用AhrcKO小鼠的DRG神经元进行神经突生长实验。
检测外周损伤后AhR的表达变化
通过RNA-seq和RT-qPCR检测坐骨神经损伤后DRG中AhR及其靶基因的表达,并通过Western blot检测蛋白水平。
评估神经元特异性AhR敲除对坐骨神经损伤后轴突再生和功能恢复的影响
使用AhrcKO小鼠(Thy1-creERT2)进行SNL手术,通过SCG10免疫荧光检测轴突再生,并通过SFI评估功能恢复。
评估神经元AhR敲除对中枢神经系统损伤后轴突再生和功能恢复的影响
在AhrcKO和对照小鼠中进行T8挫伤性SCI,通过IF检测NF-H和CGRP阳性轴突,并通过BMS、梯子行走和von Frey测试评估功能恢复。
揭示AhR调节轴突再生的分子机制
通过RNA-seq分析AhrcKO小鼠损伤后DRG转录组,并通过嘌呤霉素掺入实验检测蛋白合成,检测p-RPS6和p-eIF2α水平。
验证AhR缺失的促生长作用是否依赖HIF1α信号
使用HIF1α抑制剂KC7F2或siRNA敲低Arnt,检测对AhrcKO神经元神经突生长的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药理处理 | 2-(1'H-吲哚-3'-羰基)-噻唑-4-羧酸甲酯 | Tocris | 1803 |
| CH-223191 | Tocris | 3858 | |
| StemRegenin-1 (SR1) | Selleckchem | S2858 | |
| BAY-2416964 | Selleckchem | S8995 | |
| 6,2',4'-三甲氧基黄酮 | Tocris | 3859 | |
| KC7F2 | Cayman | 14123 | |
| ISRIB | Sigma-Aldrich | 5.09584 | |
| 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | 11330057 |
| Hank's平衡盐溶液 | Gibco | 14175095 | |
| 胶原酶I | Worthington | LS004196 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Gibco | 25200072 | |
| B27补充剂 | Gibco | A3582801 | |
| 层粘连蛋白 | Gibco | 23017015 | |
| 多聚-L-鸟氨酸 | Sigma-Aldrich | P4957 | |
| DharmaFECT 2.0转染试剂 | Dharmacon | T-2002-02 | |
| siRNA敲低 | Ahr siRNA | Dharmacon | L-044066-00 |
| Arnt siRNA | Dharmacon | L-040639-01-0005 | |
| 诱导神经元 | STEMDiff SMADi神经诱导试剂盒 | Stem Cell Technologies | 08581 |
| BrainPhys培养基 | Stem Cell Technologies | 05790 | |
| 脑源性神经营养因子 | Peprotech | 450-02 | |
| 胶质细胞源性神经营养因子 | Peprotech | 450-10 | |
| 细胞培养 | Neurobasal-A培养基 | Gibco | 10888022 |
| 蛋白质合成检测 | 嘌呤霉素 | MP Biomedicals | 210055280 |
| RNA提取 | RNeasy Plus Mini试剂盒 | Qiagen | 74134 |
| RT-qPCR | SuperScript III第一链合成系统 | Invitrogen | 18080051 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Sigma-Aldrich | R0278 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 04693159001 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | 4906845001 | |
| 苯zonase核酸酶 | Millipore | E1014 | |
| 4× LDS样品缓冲液 | Invitrogen | NP0008 | |
| ExpressPlus凝胶 | Genscript | M41210 | |
| Intercept封闭缓冲液 | LI-COR Biosciences | 927-70001 | |
| Odyssey红外成像系统 | LI-COR Biosciences | -- | |
| 免疫荧光 | OCT包埋剂 | Thermo Fisher Scientific | 23-730-571 |
| DAPI | Invitrogen | D1306 | |
| Fluromount G封片剂 | Southern Biotech | 0100-01 | |
| 行为学 | von Frey纤维丝 | -- | -- |
| RNA测序 | Illumina NovaSeq测序平台 | Illumina | -- |
| 显微镜 | Zeiss Axioscope显微镜 | Zeiss | -- |
| Zeiss LSM 780共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 成像分析 | ImageXpress Micro共聚焦高内涵成像系统 | Molecular Devices | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药理处理 | 药物浓度、给药途径、给药频率和持续时间 阅读提示:Methods: Pharmacological treatments |
| 细胞培养 | DRG神经元分离和培养条件,包括消化酶、培养时间、基质包被 阅读提示:Methods: Primary DRG neuron culture |
| 坐骨神经损伤(SNL) | 动物品系、年龄、麻醉方式、损伤方法(压榨或横断)、损伤时间点 阅读提示:Methods: SNL |
| 脊髓损伤(SCI) | 动物品系、年龄、性别、层流手术、挫伤力、损伤时间点 阅读提示:Methods: SCI model |
| 轴突再生评估 | SCG10免疫荧光染色、再生指数计算方法、最大轴突长度测量 阅读提示:Methods: Image analysis |