中性粒细胞铁死亡特征鉴定
验证化疗耐药乳腺癌中中性粒细胞是否发生铁死亡
从化疗敏感和耐药患者肿瘤中纯化TINs,进行转录组测序、细胞活力检测、电镜观察、脂质过氧化检测及临床样本免疫荧光染色。
Ferroptotic Neutrophils Induce Immunosuppression and Chemoresistance in Breast Cancer
包含体外细胞共培养、类器官模拟(肿瘤条件培养基)、自发肿瘤小鼠模型、临床样本分析及单细胞测序等多层级验证,并涵盖功能验证和机制研究。
乳腺癌患者肿瘤浸润中性粒细胞和CD4 T细胞 CD34+髓系祖细胞来源的中性粒细胞 MMTV-PyMT自发乳腺癌小鼠模型 乳腺癌患者肿瘤组织及配对血液样本
化学耐药/敏感患者肿瘤中4-HNE+中性粒细胞比例与生存期关系 Fer-CD4 T细胞通过IL1β/IL1R1/NF-κB信号降低MBOAT1表达 铁死亡中性粒细胞分泌PGE2、IDO和氧化脂质抑制CD8+ T细胞功能 IL1β+ CD4+ T细胞或IL1R1+中性粒细胞缺失小鼠对ADM化疗的反应 MBOAT1过表达或敲除对中性粒细胞铁死亡敏感性的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证化疗耐药乳腺癌中中性粒细胞是否发生铁死亡
从化疗敏感和耐药患者肿瘤中纯化TINs,进行转录组测序、细胞活力检测、电镜观察、脂质过氧化检测及临床样本免疫荧光染色。
探究MBOAT1在中性粒细胞铁死亡中的作用
对TINs进行脂质组学分析,检测MBOAT1表达,并在CD34+祖细胞来源的中性粒细胞中过表达或敲除MBOAT1,检测铁死亡敏感性。
验证铁死亡中性粒细胞对CD8+ T细胞功能的影响
将化疗耐药患者来源的中性粒细胞与肿瘤特异性CTL共培养,检测CTL增殖、细胞因子产生和杀伤功能;并鉴定分泌的免疫抑制因子。
鉴定化疗耐药肿瘤中调控中性粒细胞铁死亡的CD4 T细胞亚群
通过单细胞测序和流式鉴定IL1β+CXCL3+ CD4 T细胞亚群,并通过共培养实验验证其对中性粒细胞铁死亡的影响。
阐明Fer-CD4 T细胞诱导中性粒细胞铁死亡的分子机制
使用中和抗体、IL1R1拮抗剂、shRNA敲低和信号通路抑制剂处理,检测中性粒细胞中NF-κB信号激活及MBOAT1表达变化。
验证Fer-CD4 T细胞与中性粒细胞之间的相互促进关系
通过趋化实验、迁移实验和共培养实验,检测Fer-CD4 T细胞分泌的趋化因子对中性粒细胞的招募作用,以及铁死亡中性粒细胞对CD4 T细胞分化的影响。
验证靶向Fer-CD4 T细胞或IL1R1+中性粒细胞能否增强化疗效果
在MMTV-PyMT自发乳腺癌模型中,通过基因敲除或抗体清除IL1β+ CD4 T细胞或IL1R1+中性粒细胞,结合ADM化疗,观察肿瘤生长和免疫指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | CD4微珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-101 |
| EpCAM微珠 | Miltenyi Biotec | 130-061-101 | |
| CD66b微珠 | Miltenyi Biotec | 130-104-913 | |
| Ly-6G微珠 | Miltenyi Biotec | 130-120-337 | |
| CD4微珠(小鼠) | Miltenyi Biotec | 130-116-475 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| IL2 | PeproTech | -- | |
| CFSE | Thermo Fisher Scientific | C34554 | |
| Dynabeads CD3/CD28 T细胞扩增磁珠 | Gibco | 11161D | |
| 药物处理 | IL1β中和抗体 | R&D Systems | AF-201 |
| IgG对照 | R&D Systems | AB-108 | |
| 阿那白滞素 | Mybiosource | MBS635657 | |
| 酮咯酸 | Selleck | S1646 | |
| 罗非昔布 | Selleck | S3043 | |
| Ferrostatin-1 | Selleck | S7243 | |
| 去铁胺 | Selleck | S5742 | |
| z-VAD-FMK | Selleck | S7023 | |
| Necrostatin-1 | Selleck | S8037 | |
| JSH23 | Selleck | S7351 | |
| SB202190 | Selleck | S1077 | |
| LY294002 | Selleck | S1105 | |
| 细胞死亡检测 | SYTOX Green核酸染料 | Invitrogen | S7020 |
| Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | 62249 | |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11脂质探针 | Invitrogen | D3861 |
| BODIPY 665/676脂质探针 | Invitrogen | B3932 | |
| 免疫荧光 | Opal四色手动免疫组化试剂盒 | PerkinElmer | NEL840001KT |
| Alexa Fluor 488鬼笔环肽 | Invitrogen | A12379 | |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Millipore | 20-188 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | 78444 | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| PVDF膜 | Roche | 03010040001 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | A33251 |
| qRT-PCR | CellAmp Direct RNA Prep Kit for qRT-PCR试剂盒 | TaKaRa | -- |
| SYBR Premix Ex Taq试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| 流式分析 | Zombie Aqua可固定活力试剂盒 | BioLegend | 423101 |
| Live/Dead可固定活力染料-eFluor780 | eBioscience | 65-0865-18 | |
| 蛋白转运抑制剂混合物 | eBioscience | 00-4980-03 | |
| 细胞内固定和透化试剂盒 | eBioscience | 88-8824 | |
| True-Nuclear转录因子缓冲液套装 | BioLegend | 424401 | |
| BD Influx流式细胞仪 | BD | -- | |
| Attune NxT流式细胞分析仪 | Invitrogen | A24858 | |
| 显微成像 | LSM780共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| LSM800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 电子显微镜 | Tecnai G2 SpiritTwin透射电子显微镜 | FEI | -- |
| 细胞培养 | Naive CD4+ T细胞分离试剂盒II | Miltenyi Biotec | 130-094-131 |
| CD8微珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-201 | |
| 死细胞去除微珠 | Miltenyi Biotec | 130-090-101 | |
| CellTracker深红染料 | Thermo Fisher Scientific | C34565 | |
| 碘化丙啶染色溶液 | eBioscience | 00-6990-50 | |
| ELISA | 人IL-1β ELISA试剂盒 | Invitrogen | BMS224-2 |
| 人CXCL3 ELISA试剂盒 | Biorbyt | orb405701 | |
| 人IL-8 ELISA试剂盒 | R&D Systems | D8000C | |
| 人S100A9 ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY5578 | |
| 人PGE2 ELISA试剂盒 | Invitrogen | KHL1701 | |
| 人IDO ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY6030B | |
| 人HGF ELISA试剂盒 | R&D Systems | DHG00B | |
| 人TGF-β1 ELISA试剂盒 | R&D Systems | DB100C | |
| 人IL-10 ELISA试剂盒 | R&D Systems | D1000B | |
| 人IL-21 ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY8879 | |
| 人EBI3 ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY6456 | |
| 人IL-6 ELISA试剂盒 | R&D Systems | D6050B | |
| 人IL-23 ELISA试剂盒 | R&D Systems | D2300B | |
| 人IL-17 ELISA试剂盒 | R&D Systems | QK317 | |
| IDO活性检测 | 吲哚胺2,3-双加氧酶1(IDO1)活性检测试剂盒 | Abcam | ab235936 |
| ELISPOT | IFNγ ELISPOT试剂盒 | DKW | DKW22-1000 |
| ELISPOT读板仪(S6 ULTRA) | CTL | -- | |
| 细胞迁移实验 | μ-Slide趋化腔 | Ibidi | -- |
| 蛋白浓度测定 | NanoDrop ND-2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 测序 | Illumina HiSeq平台 | Illumina | -- |
| 单细胞测序 | Chromium系统 | 10x Genomics | -- |
| Illumina NovaSeq 6000系统 | Illumina | -- | |
| 流式分析 | FlowJo软件 | -- | -- |
| 脂质组学 | QTRAP质谱仪 | -- | -- |
| Thermo Accucore C30色谱柱 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本采集 | 患者化疗方案、反应评估标准(RECIST)、样本类型和数量 阅读提示:Materials and Methods: Patients and samples |
| 中性粒细胞分离和培养 | 分离方法(磁珠类型)、纯度验证、培养基和培养条件 阅读提示:Materials and Methods: Primary cell isolation from tumor tissue, Cell culture |
| 铁死亡诱导和处理 | RSL3剂量、抑制剂浓度(ferrostatin-1等)、处理时间 阅读提示:Materials and Methods: Cell death assay, Results: Neutrophils in chemoresistant... |
| MBOAT1操作 | 慢病毒转导MOI、CRISPR sgRNA序列、敲除效率验证 阅读提示:Materials and Methods: Lentivirus-mediated expression..., CRISPR-mediated gene knockout |
| 共培养实验 | 细胞比例、接触或非接触方式、共培养时间、检测时间点 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and cell coculture |
| 小鼠模型 | 小鼠品系(PyMT, Cd4-Il1bΔ, Mrp8-Il1r1Δ)、DT给药剂量和频率、化疗药物ADM剂量和给药方案 阅读提示:Materials and Methods: Mouse studies |