体外药物敏感性筛选
评估PIKfyve抑制剂对骨髓瘤细胞系和淋巴瘤细胞系的细胞毒性。
使用76种药物组合筛选,检测25种骨髓瘤细胞系和15种淋巴瘤细胞系对APY0201的敏感性,并进一步用APY0201、YM201636和apilimod处理20种细胞系,通过CellTiter Glo测定细胞活力。
Identification of PIKfyve kinase as a target in multiple myeloma
包含体外细胞系筛选、离体患者样本验证、转录组分析、蛋白表达检测、功能验证及机制研究等多个独立证据层级。
人多发性骨髓瘤细胞系(HMCL,如KMS26、JJN3等) 患者来源的CD138+原代骨髓瘤细胞 非霍奇金淋巴瘤细胞系
药物浓度范围:APY0201等,需核实初始筛选的浓度和梯度 孵育时间:24h或72h,需核实不同实验的孵育时间 细胞系选择:25种HMCL,需根据敏感性选择 离体样本:100例患者样本,需明确分型如t(11;14)和三体状态 检测方法:CellTiter Glo、免疫印迹、mRNA测序等,需统一操作流程
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PIKfyve抑制剂对骨髓瘤细胞系和淋巴瘤细胞系的细胞毒性。
使用76种药物组合筛选,检测25种骨髓瘤细胞系和15种淋巴瘤细胞系对APY0201的敏感性,并进一步用APY0201、YM201636和apilimod处理20种细胞系,通过CellTiter Glo测定细胞活力。
验证PIKfyve抑制剂对患者原代骨髓瘤细胞的抗肿瘤活性。
检测100个CD138+原代骨髓瘤样本对APY0201的敏感性,并选择15个样本进一步测试APY0201和apilimod的活性。
探究PIKfyve抑制对溶酶体功能和自噬的影响。
通过mRNA测序检测5个骨髓瘤细胞系和4个原代样本经APY0201处理后的基因表达变化,并用免疫印迹检测TFEB、LC3、p62等蛋白水平,通过活细胞成像观察空泡形成。
建立预测PIKfyve抑制剂敏感性的自噬检测方法。
使用自噬检测试剂盒(如Premo Autophagy Tandem Sensor和Autophagy Detection Kit)检测敏感和耐药细胞系及原代样本在药物处理后的自噬信号,并与其EC50比较。
评估APY0201对正常免疫细胞的影响。
在2个原代患者样本中,检测APY0201对骨髓瘤细胞和正常白细胞(T、B淋巴细胞、单核细胞等)的细胞毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo | Promega | -- |
| 药物处理 | APY0201 | MedChemExpress | HY-15982 |
| 阿吡莫德 | Santa Cruz Biotechnology | sc-480051 | |
| YM201636 | SelleckChem | S1219 | |
| 免疫印迹 | 抗β-肌动蛋白抗体 | GeneScript | A00702-100 |
| 抗Lamp-1抗体 | Abcam | ab25630 | |
| 抗SQSTM1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-28359 | |
| 抗组织蛋白酶A抗体 | R&D Systems | AF1049 | |
| 抗组织蛋白酶D抗体 | R&D Systems | AF1014 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2128 | |
| 抗Beclin1抗体 | Cell Signaling Technology | 3495 | |
| 抗Caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 抗Lamin A/C抗体 | Cell Signaling Technology | 4777 | |
| 抗LC3A/B抗体 | Cell Signaling Technology | 12741 | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| 抗TFEB抗体 | Cell Signaling Technology | 4240 | |
| 自噬检测 | Premo自噬串联传感器RFP-GFP-LC3试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | P36239 |
| 自噬检测试剂盒 | Abcam | ab139484 | |
| 溶酶体染色 | LysoSensor Yellow/Blue DND-160探针 | Thermo Fisher Scientific | L7545 |
| 显微镜检查 | 蔡司LSM 800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物筛选 | 细胞系种类和数量、药物浓度范围、孵育时间、检测方法 阅读提示:Methods: PIKfyve inhibitor sensitivity |
| 离体样本处理 | 样本纯化方法、样本数量、药物浓度、孵育时间 阅读提示:Methods: Ex vivo sensitivity |
| 免疫印迹 | 抗体及稀释比例、细胞处理时间和浓度 阅读提示:Methods: Immunoblotting; Figure legends |
| 自噬检测 | 试剂盒型号、处理时间、检测设备 阅读提示:Methods: Autophagy organelle formation; Figure 5 legend |
| mRNA测序 | 处理浓度、时间、RNA提取方法、测序平台和数据分析流程 阅读提示:Methods: mRNA sequencing |