建立体内和体外模型
模拟RGC变性的病理条件,观察Vps35、p35和tau磷酸化的变化。
大鼠玻璃体腔注射谷氨酸建立视网膜兴奋毒性模型;原代培养小鼠RGCs并用谷氨酸处理。
Vps35 Deficiency Impairs Cdk5/p35 Degradation and Promotes the Hyperphosphorylation of Tau Protein in Retinal Ganglion Cells
包含原代细胞培养、大鼠体内模型、免疫荧光、Western blot、免疫沉淀等多个独立证据层级,并通过基因敲低/过表达和抑制剂进行功能与机制验证。
原代小鼠视网膜神经节细胞(RGCs) 大鼠视网膜谷氨酸兴奋毒性模型
大鼠玻璃体腔注射50 nmol谷氨酸(3 µL)建立视网膜神经变性模型 原代RGCs使用Vps35 siRNA敲低和pcDNA3.1-Flag-Vps35过表达 Cdk5抑制剂roscovitine处理浓度为25 µmol/L RGCs培养时间:体外培养7-8天时进行转染 样本量:每个实验条件至少使用3只动物
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟RGC变性的病理条件,观察Vps35、p35和tau磷酸化的变化。
大鼠玻璃体腔注射谷氨酸建立视网膜兴奋毒性模型;原代培养小鼠RGCs并用谷氨酸处理。
比较模型组与对照组中Vps35、p35、Cdk5和p-tau s396/s404的表达变化。
免疫荧光检测视网膜和RGCs中各蛋白的分布和共定位;Western blot检测蛋白表达水平;RT-qPCR检测mRNA表达。
验证Vps35是否影响Cdk5/p35活性和tau磷酸化。
在原代RGCs中转染Vps35 siRNA敲低或pcDNA3.1-Flag-Vps35过表达,检测p35、Cdk5和p-tau s396水平。
验证Cdk5是否是Vps35缺陷引起tau磷酸化的关键激酶。
用roscovitine(Cdk5抑制剂)处理正常或Vps35敲低的RGCs,检测p-tau s396水平。
探讨Vps35如何影响p35降解,确定Vps35与p35、LAMP1的相互作用。
免疫荧光和免疫共沉淀检测Vps35、p35、LAMP1、EEA1的共定位和直接相互作用;并检测溶酶体标志物LAMP1和泛素化相关UBE1的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 谷氨酸 | Solarbio | -- |
| 无菌PBS | HyClone Laboratories | -- | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 神经基础培养基 | -- | -- | |
| B27补充剂 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Vps35 siRNA | Santa Cruz Biotechnology | sc-63219 | |
| pcDNA3.1-Flag-Vps35质粒 | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-PCR | cDNA合成试剂盒 | Roche Life Science | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Merck Millipore Ltd. | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | -- | |
| 免疫沉淀 | 免疫共沉淀试剂盒 | Pierce Biotechnology | -- |
| 蛋白G琼脂糖珠 | Roche Life Science | -- | |
| 抗体 | 兔抗tau抗体 | Abcam | ab32057 |
| 兔抗tau磷酸化S396抗体 | Abcam | ab109390 | |
| 兔抗tau磷酸化S404抗体 | Abcam | ab131338 | |
| 山羊抗Vps35抗体 | Abcam | ab10099 | |
| 兔抗Vps35抗体 | Abcam | ab157220 | |
| 兔抗LAMP1抗体 | Abcam | ab24170 | |
| 山羊抗小鼠IgG (Cy3)抗体 | Abcam | ab97035 | |
| 驴抗山羊IgG (Cy3)抗体 | Abcam | ab6949 | |
| 山羊抗兔IgG (Alexa Fluor 488)抗体 | Abcam | ab150077 | |
| 驴抗兔IgG (Alexa Fluor 488)抗体 | Abcam | ab150073 | |
| 兔抗βⅢ微管蛋白抗体 | Abcam | ab18207 | |
| 小鼠抗CD90/Thy1抗体 | Abcam | ab225 | |
| 山羊抗GFP抗体 | Abcam | ab6662 | |
| 兔抗p35/25 (C64B10)单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 2680 | |
| 兔抗UBE1a/b抗体 | Cell Signaling Technology | 4891 | |
| 兔抗EEA1 (C45B10)单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3288 | |
| 小鼠抗p35 (4G11)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-293184 | |
| 小鼠抗Cdk5 (J-3)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6247 | |
| Western blot | 兔抗GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 |
| 山羊抗小鼠IgG (HRP)抗体 | Abcam | ab6789 | |
| 山羊抗兔IgG (HRP)抗体 | Abcam | ab6721 | |
| 小鼠抗Flag抗体 | GenScript | A00187 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 大鼠品系、体重、周龄;谷氨酸剂量和注射体积;注射方式;对照组条件;取材时间点;每组动物数 阅读提示:Materials and Methods 中的 Animals 段落 |
| RGC培养 | 小鼠年龄(P1-P3);分离方法(anti-CD90/Thy1 panning);培养基成分(Neurobasal-A, B27, FBS, glutamine, 抗生素);培养时间(DIV7-8);转染试剂和用量 阅读提示:Materials and Methods 中的 RGC Culture and Transfection 段落 |
| 分子调控 | siRNA序列、质粒名称和来源;转染方法(Lipofectamine 3000);浓度和孵育时间;对照组设置 阅读提示:Materials and Methods 中的 RGC Culture and Transfection 段落 |
| 药物处理 | rosocovitine浓度(25 µmol/L)和处理时间(24小时);DMSO对照 阅读提示:Materials and Methods 中的 RGC Culture and Transfection 和 Results 相关部分 |
| 蛋白质检测 | 裂解缓冲液、蛋白酶抑制剂;抗体稀释比例(表3);内参(GAPDH);PVDF膜品牌;成像系统 阅读提示:Materials and Methods 中的 Western Blot Assay 段落 |
| 蛋白相互作用 | 免疫沉淀抗体(anti-p35);蛋白量(300 µg);孵育时间和温度;洗脱方式 阅读提示:Materials and Methods 中的 Coimmunoprecipitation 段落 |