建立LITT小鼠模型并确认消融
验证LITT手术的准确性和可重复性
使用立体定向装置对C57BL/6J小鼠进行激光消融,并通过MRI在术后2天确认消融区域。
Laser interstitial thermal therapy enhances bidirectional blood-brain barrier permeability in glioblastoma
包含scRNA-seq、免疫荧光、透射电镜、ddPCR等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
C57BL/6J小鼠LITT模型 SB28胶质瘤小鼠模型 人胶质母细胞瘤组织样本
LITT激光参数:43°C维持3分钟(naive)或44°C维持90秒(肿瘤),需核对温度和时间 血脑屏障通透性评估时间点:术后3、7、14、21天 ctDNA检测时间点:术后1小时、3天、7天、14天 SB28细胞注射数量:2000个 ddPCR阳性阈值:>5 copies/µL血浆
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证LITT手术的准确性和可重复性
使用立体定向装置对C57BL/6J小鼠进行激光消融,并通过MRI在术后2天确认消融区域。
探究LITT后脑内皮细胞的转录组变化,特别是与紧密连接和转胞吞相关的通路
从LITT和假手术小鼠脑组织中分离CD31+CD11b−CD45−内皮细胞,进行Smart-seq2单细胞RNA测序,并进行差异表达基因和基因集富集分析。
验证LITT是否破坏紧密连接及其空间和时间范围
在LITT后不同时间点(3、7、14、21天)收集脑组织,通过免疫荧光检测claudin-5和CD31的表达,在离消融核心50µm间隔的区域量化荧光强度。
评估LITT是否增加内皮细胞转胞吞作用及其时间过程,并探究Mfsd2a的作用
通过透射电镜观察LITT和假手术组脑内皮细胞腔面膜凹陷和小窝样囊泡结构,量化囊泡数量;并免疫荧光检测Mfsd2a蛋白表达。
探究LITT增强的血脑屏障通透性是否双向,能否促进ctDNA从脑肿瘤释放到血液中
在小鼠颅内植入SB28胶质瘤细胞,7天后进行LITT或假手术,在不同时间点采集血液,通过ddPCR定量eGFP ctDNA和β-actin cfDNA水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 激光间质热疗 | 蒙特里斯医疗 | Monteris Medical | -- |
| 肿瘤植入和监测 | D-荧光素 | Goldbio | #LUCK-1G |
| 血脑屏障通透性分析 | 伊文思蓝 | Sigma-Aldrich | E2129 |
| 内皮细胞分离 | 神经解离试剂盒 | Miltenyi | 130-092-628 |
| 抗CD31-APC抗体 | BD | 551262 | |
| 抗CD45-FITC抗体 | BD | 553080 | |
| 抗CD11b-BV421抗体 | Biolegend | 101236 | |
| Sytox橙色染料 | Thermo Fisher | S34861 | |
| Fc预封闭剂 | BD | 553141 | |
| 单细胞RNA测序 | Quant-iT dsDNA高灵敏度试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| Illumina Nextera XT文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| NovaSeq 6000测序系统 | Illumina | 20012861 | |
| 磁共振成像 | 钆布醇 | Bayer | -- |
| 免疫荧光 | 抗CD31抗体 | BD Pharminogen | 550274 |
| 抗claudin-5抗体 | Thermo Fisher Scientific | 34-1600 | |
| 抗Mfsd2a抗体 | -- | 来自Chenghua Gu博士实验室的赠与 | |
| ctDNA分析 | Q5热启动高保真预混液 | New England Biolabs | -- |
| 探针用ddPCR预混液(无dUTP) | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 激光间质热疗 | 激光参数:温度、持续时间、坐标 阅读提示:Methods: Laser Interstitial Thermal Therapy |
| 单细胞RNA测序 | 内皮细胞分选标记、测序平台、分析流程 阅读提示:Methods: Brain Endothelial Cell Isolation, Single-Cell RNA-Sequencing, SMART-Seq-2 Data Analysis |
| 紧密连接完整性评估 | 时间点、离消融核心的距离、抗体浓度 阅读提示:Methods: Immunofluorescence; Results: LITT Induces Localized and Transient TJ Disruption; Figure 2 legend |
| 转胞吞作用评估 | 时间点、囊泡量化标准、每只动物的横断面数 阅读提示:Results: LITT Increases Caveolae-Mediated Transcytosis and Is Associated With Downregulation of Mfsd2a; Figure 3 legend |
| ctDNA释放评估 | 肿瘤细胞注射数量、LITT参数、采血时间点、ddPCR阈值 阅读提示:Methods: Tumor Implantation and LITT, Blood Collection and Cell-Free DNA Extraction, ctDNA Analysis with ddPCR; Results: LITT Enhances BBB Permeability to Facilitates ctDNA Release; Figure 4 legend |