SARS-CoV-2感染对胃的直接影响评估
确定SARS-CoV-2是否直接感染胃组织并引起病理变化。
K18-hACE2小鼠经吸入感染SARS-CoV-2,在不同时间点(2、5、7、14天及4周)收集胃和肺组织,进行组织病理学分析和原位杂交检测病毒RNA。
Post-COVID-19 Effects on Chronic Gastritis and Gastric Cellular and Molecular Characteristics in Male Mice
包含转录组测序、免疫组化、多重免疫细胞分析、幽门螺杆菌共感染模型及组织学评估等体外和体内多层验证。
K18-hACE2小鼠 幽门螺杆菌SS1感染小鼠模型 SARS-CoV-2与幽门螺杆菌共感染小鼠模型
K18-hACE2小鼠(雄性) SARS-CoV-2经吸入感染,剂量为1×10^6 PFU 幽门螺杆菌SS1口服接种,剂量为1×10^8 CFU 感染时间点:SARS-CoV-2后2、5、7、14天及4周;幽门螺杆菌后20周 组织学评估:胃黏膜厚度、免疫细胞计数
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定SARS-CoV-2是否直接感染胃组织并引起病理变化。
K18-hACE2小鼠经吸入感染SARS-CoV-2,在不同时间点(2、5、7、14天及4周)收集胃和肺组织,进行组织病理学分析和原位杂交检测病毒RNA。
分析SARS-CoV-2感染后胃组织的分子和免疫变化。
在感染后7天收集胃标本,进行RNA测序分析差异表达基因,并采用CIBERSORTx预测免疫细胞组成,同时通过细胞因子阵列检测血清细胞因子水平。
评估SARS-CoV-2与幽门螺杆菌共感染对胃病进展的影响。
建立三种模型:仅幽门螺杆菌感染、SARS-CoV-2感染后4周接种幽门螺杆菌(pre-COVID)、幽门螺杆菌感染后4周感染SARS-CoV-2(post-COVID),在幽门螺杆菌感染后20周处死小鼠。
比较不同感染顺序下胃炎严重程度和免疫细胞变化。
对胃组织进行H&E染色评估黏膜厚度和炎症,免疫组化检测ATP4A、MIST1、MUC5AC、MKI67等标记物,并计数免疫细胞(巨噬细胞、肥大细胞、CD4 T细胞等)。
揭示SARS-CoV-2共感染对幽门螺杆菌感染胃的分子机制影响。
从post-COVID小鼠胃标本提取RNA进行测序,进行基因本体分析、GSEA分析,并验证特定基因和蛋白表达(如Wfdc2、p-STAT3、p-ERK)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织病理学分析 | 伊红Y | Sigma | E4009 |
| 原位杂交 | RNAscope 2.5 HD红色检测试剂盒 | ACD | 322350 |
| 免疫组织化学 | 抗CDX2抗体 | Abcam | ab76541 |
| 抗CLDN4抗体 | Abcam | ab210896 | |
| 抗幽门螺杆菌抗体 | Abcam | ab7788 | |
| 抗ATP4A抗体 | MBL | DO31-3 | |
| 抗MIST1抗体 | CST | 14896 | |
| 抗MUC5AC抗体 | Invitrogen | MA5-12178 | |
| 抗MKI67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| 抗F4/80抗体 | CST | 70076 | |
| 抗类胰蛋白酶抗体 | Merck | MAB1222 | |
| 抗CD4抗体 | CST | 25229 | |
| 抗CD44v9抗体 | Cosmo Bio | LKG-M002 | |
| 抗Siglec F抗体 | BD Biosciences | 552125 | |
| 抗中性粒细胞抗体 | Abcam | ab2557 | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | CST | 4370 | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | CST | 9134 | |
| 免疫荧光 | 凝集素GSII,Alexa488偶联物 | Thermo | LS21415 |
| Alexa488标记驴抗小鼠IgG | Invitrogen | A21202 | |
| Alexa488标记驴抗兔IgG | Invitrogen | A21206 | |
| Cy3标记山羊抗兔IgG | Invitrogen | A10520 | |
| Cy3标记山羊抗大鼠IgG | Invitrogen | A10522 | |
| Cy5标记山羊抗小鼠IgG | Jackson Laboratories | 115-175-146 | |
| 病毒生产 | SeaPlaque琼脂糖 | Lonza | 50105 |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Gibco | A5256701 |
| 青霉素/链霉素 | Thermo | 15140122 | |
| 细菌培养 | 微需氧罐 | BD | 260622 |
| 气体包 | BD | 260678 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| RT-qPCR | ImProm-II逆转录系统 | Promega | A3800 |
| SYBR Green | Takara | RR82LR | |
| 细胞因子阵列 | 小鼠细胞因子阵列试剂盒 | R&D Systems | ARY006 |
| 细菌DNA提取 | 通用基因组DNA提取试剂盒 | TAKARA | 9765 |
| 血液分析 | 血液分析仪(BC-5000) | Mindray Global | -- |
| 组织固定 | 中性缓冲福尔马林 | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 雄性K18-hACE2小鼠,购自Jackson Laboratory 阅读提示:Methods, Animals |
| SARS-CoV-2感染 | SARS-CoV-2剂量:1×10^6 PFU,吸入给药30分钟 阅读提示:Methods, Mouse Infection With SARS-CoV-2 and Hpylori |
| 幽门螺杆菌感染 | 幽门螺杆菌SS1剂量:1×10^8 CFU,口服3次,间隔2天 阅读提示:Methods, Mouse Infection With SARS-CoV-2 and Hpylori |
| 共感染时间点 | post-COVID:幽门螺杆菌感染后4周感染SARS-CoV-2;pre-COVID:SARS-CoV-2感染后4周感染幽门螺杆菌 阅读提示:Methods, Mouse Infection With SARS-CoV-2 and Hpylori |
| 组织学分析 | 组织固定于10%中性缓冲福尔马林24小时,石蜡包埋,4μm切片 阅读提示:Methods, Histopathologic Analysis |
| 转录组分析 | RNA提取使用TRIzol,RNA测序由Macrogen执行 阅读提示:Methods, Transcriptomic and Bioinformatic Analyses |