确认STING激动剂和抑制剂对MNV复制的影响
验证STING信号是否影响MNV复制
在小鼠巨噬细胞RAW264.7和J774A.1中,使用STING激动剂DMXAA和2'3'-cGAMP处理,以及STING抑制剂H151处理,检测病毒RNA和蛋白表达及病毒滴度。
cGAS-STING effectively restricts murine norovirus infection but antagonizes the antiviral action of N-terminus of RIG-I in mouse macrophages
包含STING激动剂/抑制剂处理实验、cGas/Sting基因敲除及回补实验、过表达实验、病毒复制检测、蛋白互作实验及机制验证,构成多层级独立证据。
RAW264.7小鼠巨噬细胞 J774A.1小鼠巨噬细胞 HEK293T人胚胎肾细胞(表达CD300lf) cGas-/-和Sting-/- RAW264.7细胞
STING激动剂DMXAA和2'3'-cGAMP的处理浓度及时间 STING抑制剂H151的处理浓度 cGas和Sting基因敲除细胞系 JAK inhibitor 1的处理浓度 MNV感染复数(MOI)和感染时间
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证STING信号是否影响MNV复制
在小鼠巨噬细胞RAW264.7和J774A.1中,使用STING激动剂DMXAA和2'3'-cGAMP处理,以及STING抑制剂H151处理,检测病毒RNA和蛋白表达及病毒滴度。
探究STING激动剂抗MNV作用是否依赖JAK/STAT通路
在RAW264.7和J774A.1细胞中,使用JAK抑制剂1处理,检测STAT1磷酸化、ISG表达以及MNV复制水平。
确定内源性cGAS和STING在抗MNV免疫中的作用
使用cGas-/-和Sting-/- RAW264.7细胞,感染MNV,检测病毒复制水平、ISG(ISG15、IFIT1、MX1等)和IFN-β转录水平。
确认cGAS和STING的缺失效应可被回补所逆转
在cGas-/-或Sting-/-细胞中瞬时转染pMyc-cGAS或pMyc-STING,检测MNV复制水平。
验证cGAS和STING过表达是否具有抗病毒作用
在HEK293T细胞中共转染CD300lf和cGAS/STING,或在小鼠巨噬细胞中转染cGAS/STING,感染MNV,检测病毒复制。
探究STING是否通过与RIG-I结合影响其抗病毒功能
通过共定位和免疫共沉淀验证STING与RIG-I及其N端相互作用;在cGas-/-或Sting-/-细胞中转染RIG-I_N,比较其抗MNV效果,并在Sting-/-细胞中回补STING观察抗病毒作用的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | DMXAA | InvivoGen | -- |
| H151 | InvivoGen | -- | |
| 2'3'-cGAMP | InvivoGen | -- | |
| JAK抑制剂1 | Santa Cruz Biotechnology | SC-204021 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Lonza Verviers | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| RNA提取 | NucleoSpin RNA II 试剂盒 | Macherey-Nagel | -- |
| cDNA合成 | cDNA合成试剂盒 | TaKaRa Bio | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green | Applied Biosystems | -- |
| StepOnePlusTM 系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blotting | PVDF膜 | Invitrogen | -- |
| Odyssey 3.0 红外成像系统 | Li-Cor Biosciences | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | sc-2003 |
| 转染 | FuGENE HD转染试剂 | Promega | E2311 |
| 抗体 | 抗STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | #9172 |
| 抗磷酸化STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | #9177 | |
| 抗RIG-I抗体 | Cell Signaling Technology | #3743 | |
| 抗MDA5抗体 | Cell Signaling Technology | #5321 | |
| 抗cGAS抗体 | Cell Signaling Technology | #31659 | |
| 抗STING抗体 | Cell Signaling Technology | #13647 | |
| 抗Myc标签抗体 | Cell Signaling Technology | #2278 | |
| 抗Myc标签抗体 | Cell Signaling Technology | #2276 | |
| 抗GBP2抗体 | Proteintech | 11854-1-AP | |
| 抗GBP5抗体 | Proteintech | 13220-1-AP | |
| 抗Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 抗β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | #sc-47778 | |
| 免疫荧光 | 抗兔IgG (H+L), F(ab')2片段 (Alexa Fluor 488偶联物) | -- | -- |
| 抗兔IgG (H+L), F(ab')2片段 (Alexa Fluor 594偶联物) | -- | -- | |
| 抗小鼠IgG (H+L), F(ab')2片段 (Alexa Fluor 594偶联物) | -- | -- | |
| 荧光素酶检测 | 荧光素钾盐 | Sigma-Aldrich | -- |
| LumiStar Optima发光检测仪 | BMG Lab Tech | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT | Sigma | -- |
| 统计学 | GraphPad Prism 5.0 | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒感染 | MNV-1、MNVCW3、MNVCR6病毒株、感染复数(MOI)、感染时间(1小时)、处理时间(20小时) 阅读提示:Materials and Methods: Virus strains, Antiviral assay with MNV;Figure legends for Figure 1, 3, 4等 |
| 药物处理 | DMXAA浓度(10 μg/ml)、H151浓度(5 μg/ml)、2'3'-cGAMP浓度(2 μg/ml)、JAK inhibitor 1浓度(5 μg/ml) 阅读提示:Materials and Methods: Chemicals and antibodies;Figure legends for Figure 1, 2等 |
| 基因操作 | cGas-/-和Sting-/- RAW264.7细胞来源、质粒转染量(1 μg) 阅读提示:Materials and Methods: Cell lines, Plasmid construction and cell transfection;Figure legends for Figure 3, 5等 |
| 蛋白互作分析 | 转染量(1 μg/1.5 μg)、共转染时间(24小时/48小时) 阅读提示:Materials and Methods: Co-immunoprecipitation;Figure legends for Figure 7 |
| 统计设计 | 重复数(n=2-8)、统计方法(Mann–Whitney test, one-way ANOVA with Newman–Keuls test)、显著性水平(p<0.05) 阅读提示:Materials and Methods: Statistical analysis;Figure legends |